زیست شناسی میکروارگانیسم ها

مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری یک باکتری گرم منفی و میکروآئروفیل می‌باشد. حدود نیمی از جمعیت انسانی جهان آلوده به این باکتری می‌باشند. این باکتری یکی از عوامل اصلی زخم معده و سرطان معده شناخته‌شده است. افزایش ... بیشتر مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری یک باکتری گرم منفی و میکروآئروفیل می‌باشد. حدود نیمی از جمعیت انسانی جهان آلوده به این باکتری می‌باشند. این باکتری یکی از عوامل اصلی زخم معده و سرطان معده شناخته‌شده است. افزایش مقاومت‌های آنتی‌بیوتیکی، هزینه بالای درمان‌های ترکیبی و عوارض جانبی نامطلوب، منجر به افزایش تمایل به روش‌های جایگزین نظیر استفاده از آنتی‌اکسیدان‌ها، عوامل ضدالتهابی، پروبیوتیک ها و داروهای گیاهی شده است. مواد و روش‌ها: در این بررسی تحقیقات صورت گرفته بر روی اثرات 29 خانواده گیاهی شامل 69 گونه گیاهی در ایران برعلیه هلیکوباکتر پیلوری در شرایط آزمایشگاهی و بالینی، بررسی و دسته‌بندی‌شده است. نتایج: با توجه به نتایج به‌دست‌آمده می‌توان از گیاهانی نظیر نعناع، آویشن شیرازی، مروتلخ، گئوم ایرانیکوم، سماق، ملک ازرق، گلپر، زنیان، افنسطین، شیرین‌بیان، زیتون و انار به‌عنوان گیاهانی که بیشترین تأثیر را برعلیه هلیکوباکتر پیلوری در شرایط آزمایشگاهی از خود نشان داده‌اند یادکرد. بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به اثرات ضد باکتریایی گیاهان موردبررسی در این مطالعه، این گیاهان دارویی پتانسیل استفاده به‌عنوان جایگزینی مناسب در درمان عفونت ناشی از هلیکوباکتر پیلوری را دارا می‌باشند اما قبل از هر چیز باید سنجش عملکرد ضد باکتریایی عصاره‌های گیاهی برعلیه هلیکوباکتر پیلوری هم در شرایط آزمایشگاهی و هم در شرایط بالینی مورد ارزیابی قرار گیرد. تعیین ماده مؤثر می‌تواند به تحقیقات بعدی در این زمینه کمک شایانی نماید. همچنین عملکرد گونه‌های گیاهی یکسان در مناطق مختلف باید سنجیده شده و نهایتاً درزمینه تأثیرگذاری آن‌ها نتیجه‌گیری شود. در ارتباط با سویه‌های هلیکوباکتر پیلوری مورد آزمایش نیز بایستی از یک‌سویه استاندارد برای ارزیابی عملکرد ضد باکتریایی عصاره‌های گیاهی مختلف استفاده شود و استفاده از سویه‌های متفاوت ممکن است نتایج متفاوتی را در مورد تأثیر ضد باکتریایی عصاره گیاهی یکسان حاصل نماید.

پژوهشی- فارسی

کاربرد باکتری سودوموناس.GSN23 و روشهای الکتروشیمیایی در شناسایی آلاینده فنل

نرجس کلاه چی؛ غلامحسین ابراهیمی پور؛ سید امید رعنائی سیادت؛ نیکول جافرزیک-رنو

دوره 8، شماره 31 ، مهر 1398، صفحه 19-32

https://doi.org/10.22108/bjm.2019.113064.1159

چکیده

مقدمه: امروزه فنل به عنوان یک آلاینده مهم محیط زیست مطرح بوده و در تصفیه پسابهای صنعتی دارای پایداری بیشتری نسبت به سایر ترکیبات آروماتیک است. روشهایی برای شناسایی فنل در پسابها وجود دارد که علیرغم دقت ... بیشتر مقدمه: امروزه فنل به عنوان یک آلاینده مهم محیط زیست مطرح بوده و در تصفیه پسابهای صنعتی دارای پایداری بیشتری نسبت به سایر ترکیبات آروماتیک است. روشهایی برای شناسایی فنل در پسابها وجود دارد که علیرغم دقت بالا، وقت گیر و پیچیده می باشند. استفاده از زیست حسگرهای آنزیمی برای تشخیص ترکیبات فنلی از روشهای جایگزین و موثر در سنجش این آلاینده می باشد، هر چندکه نقاط ضعف کاربرد آنزیم ها و هزینه های اقتصادی بالا را نمی توان نادیده گرفت. یکی از راهکارهای جایگزین غلبه بر نقاط ضعف کار با آنزیمها، سلول های میکربی در زیست حسگرها می باشند. در این پژوهش با هدف طراحی یک زیست حسگر مقرون به صرفه و دقیق، از سلولهای میکربی استفاده شده است. مواد و روشها: باکتری گرم منفی سودوموناس.GSN23 در حضورغلظتهای بالای فنل آداپته شده و با ایجاد پیوندهای فیزیکی و شیمیایی بر روی الکترودهای کار (کربن شیشه ای و میکروالکترودهای مرکب طلا) تثبیت گردید و روشهای الکتروشیمیایی (ولتامتری موج مربعی و هدایت سنجی) برای سنجش فنل مورد استفاده قرار گرفت. نتایج: باکتری سودوموناس. GSN23 در حضور 1 گرم در لیتر فنل توانست در ساعت 32 رشد، 73% از غلظت اولیه فنل را مصرف نموده و در ساعت 72 میزان فنل در محیط را به صفر برساند. این باکتری پاسخ های مثبت و قابل تکراری را در روش هدایت سنجی برای شناسایی فنل در گستره تشخیص 300-1 میلی گرم در لیترنشان داده و میزان انتخاب پذیری زیست حسگر طراحی شده به سوبسترای فنل در مقایسه با سایر ترکیبات آروماتیک 5 برابر بالاتر تخمین زده شد. بحث و نتیجه‌گیری: زیست حسگرهای میکربی دارای صرفه اقتصادی، پایداری ساختار و مقاومت به تغییرات محیطی می باشند. در این پژوهش باکتری سودوموناس.GSN23 به عنوان مصرف کننده فنل مورد استفاده قرار گرفته و با روش هدایت سنجی پاسخ های قابل تکراری در سنجش این آلاینده بدست آمد.

پژوهشی- فارسی

شناسایی گونه‌های Chaetomium و Amesia همراه بیماری‌های مختلف در گیاهان زینتی علفی اهواز

ریحانه لرکی؛ مهدی مهرابی کوشکی؛ رضا فرخی نژاد

دوره 8، شماره 31 ، مهر 1398، صفحه 33-50

https://doi.org/10.22108/bjm.2019.117357.1205

چکیده

مقدمه: گیاهان زینتی آهار (Zinnia elegans)، اختر (Canna sp.)، اطلسی (Petunia hybrida)، کمپکت (Dracaena Compacta)، کوکب (Dahlia sp.)، گازانیا (Gazania sp.)، گل جعفری (Tagetes sp.)، گلناز (Portulaca grandiflora) و لادن (Tropaeolum majus) از گیاهان زینتی در شهر اهواز میباشند. ... بیشتر مقدمه: گیاهان زینتی آهار (Zinnia elegans)، اختر (Canna sp.)، اطلسی (Petunia hybrida)، کمپکت (Dracaena Compacta)، کوکب (Dahlia sp.)، گازانیا (Gazania sp.)، گل جعفری (Tagetes sp.)، گلناز (Portulaca grandiflora) و لادن (Tropaeolum majus) از گیاهان زینتی در شهر اهواز میباشند. شناسایی قارچ‌های همراه این گیاهان به بهبود مدیریت پرورش آن‌ها در آینده کمک خواهد کرد. اعضای جنس‌های Amesia و Chaetomium عموما در خاک، آب، گیاهان، حیوانات و انسان یافت شده‌اند. در این مطالعه، 12 جدایه‌ از جنس‌های Chaetomium و Amesia، جداسازی شده از گیاهان زینتی علفی، بر اساس ریخت‌شناسی و تجزیه و تحلیل تبارشناسی شناسایی شدند. مواد و روش‏ها: در طول سال‌های 97-1396، 40 نمونه‌ از گیاهان فوق با علایم پوسیدگی ریشه، شانکر ساقه و لکه‌برگی جمع‌آوری و قارچ‌های همراه این علایم جداسازی شد. در بین آن‌ها، 12 جدایه‌ از خانواده Chaetomiaceae بدست آمد که مشخصات ریخت‌شناسی و مولکولی آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت. جدایه‏های قارچی در محیط‌ کشت سیبزمینی- دکستروز - بروث (PDB) رشد یافته و زیست‏توده میسیلیومی آن‌ها، پس از عبور از کاغذ سترون جمع‌آوری و سپس خشک - انجمادی گردید. نواحی ITS و بخش‌هایی از ژن‌های 28S-D1/D2 (برای چهار جدایه‌) و tub2 (برای نه جدایه) با استفاده از آغازگرهای مناسب تکثیر و توالی‌یابی شدند. نتایج: جدایه‌های تحت مطالعه با سویه‌های شناخته‌شده، با استفاده از الگوریتم جستجوی بلاست و تجزیه و تحلیل تبارشناسی مبتنی بر ناحیه‌های ITS، 28S و tub2، مقایسه شدند. بر این اساس، گونه‌های Chaetomium olivaceum، C. ascotrichoides ،C. globosum ، C. rectangulare و Amesia atrobrunnea شناسایی گردیدند. مشخصات ریخت‌شناسی این جدایه‌ها با سویه‌های تایپ هر گونه انطباق داشت. بحث و نتیجه‏گیری: بر اساس دانش ما، این اولین گزارش گونه‌ی C. ascotrichoides در ایران و همراهی C. rectangulare روی کمپکت،C. globosum روی آهار و اختر، C. ascotrichoides روی اطلسی وC. olivaceum روی آهار، لادن و جعفری در جهان می‌باشد.

پژوهشی- فارسی

بررسی توکسین‌زایی قارچ‌های جدا شده از خوراک دام و طیورشهرستان خرم‎آباد

رضا درویش نیا؛ مصطفی درویش نیا؛ محمد حسین قارونی

دوره 8، شماره 31 ، مهر 1398، صفحه 51-69

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.120098.1238

چکیده

مقدمه: میکوتوکسین‎ها یا سموم قارچی فرآورده‌های متابولیکی اولیه و یا ثانویه ‎می‎باشند. طیف وسیعی از انواع قارچ‎های کپکی مانند آسپرژیلوس، فوزاریوم و دیگر قارچ‏ها قادر به تولید مقادیر زیادی از ... بیشتر مقدمه: میکوتوکسین‎ها یا سموم قارچی فرآورده‌های متابولیکی اولیه و یا ثانویه ‎می‎باشند. طیف وسیعی از انواع قارچ‎های کپکی مانند آسپرژیلوس، فوزاریوم و دیگر قارچ‏ها قادر به تولید مقادیر زیادی از میکوتوکسین‎های خطرناک در غذای انسان و دام می‎باشند. مواد و روش‎ها: در این بررسی نمونه‏هایی از خوراک دام و طیور به آزمایشگاه منتقل و روی محیط کشت سیب‌زمینی دکستروز آگار (PDA) کشت داده شد. پس از جدا سازی، خالص سازی و شناسایی، توکسین‌زایی قارچ‎ها روی بستره ذرت انجام و برای بررسی قابلیت توکسین‎زایی از محیط نارگیل آگار استفاده شد. سپس با استفاده از توکسین استاندارد روی صفحۀ TLC در تانک TLC در زیر نور ماوراء بنفش (UV) مورد ارزیابی قرار گرفتند. همچنین ارزیابی کمی توکسین‎ها با استفاده از روش کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (HPLC) انجام شد. نتایج: نتایج نشان داد که نمونه‎ها به قارچ‏های Aspergillus flavus، A. parasiticus، A. ochraceous، A. niger، Penicilliun glabrum، Fusarium verticillioides، F. proliferatum، F. fujikuroi، F. concentricum، Rhizopus oreyzae، Absidia corymbifera، Rhizomucor sp.، Trichothecium sp. و Alternariaalternata آلوده بودند. بیشترین درصد آلودگی مریوط به قارچ‎های Rhizomucor، Absidia و Fusarium (15 و 5/27 درصد) در خوراک طیور و F. prolifratum (1/62 درصد) در خوراک دام بود. همچنین براساس TLCقارچ‌های F. prolifratum و F. verticillioides بیشترین نور را ساطع کردند در حالی که قارچ Rhizomucor کمترین نور و به طبع کمترین توکسین‌زایی را به خود اختصاص داد. براساس نتایج حاصل از HPLC جدایه‌هایF. verticillioides و A. flavusبیشترین توانایی تولید فومونیسین B1 و A. niger از بیشترین میزان افلاتوکسین G1 برخوردار بود. بحث و نتیجه‎گیری:در مطالعه حاضر قارچ‏های آسپرژیلوس، ریزوموکور و فوزاریوم در محیط کشت نارگیل-آگار خاصیت فلورسانس از خود نشان ‎دادند. بعد از نقطه‎گذاری بر روی صفحه TLC، نقاط حاوی توکسین شدت فلورسانس بیشتری داشتند که نتایج کلی سنجش این سم با HPLC نیز همین موضوع را تائید می‌نماید.

پژوهشی- فارسی

تاثیر دیواره سلولی و عصاره سیتوپلاسمی باکتری لاکتوباسیلوس روتری بر تحریک تولید سایتوکاین های اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما

محمد حسین سلطانی کردشولی؛ الهام معظمیان؛ مهدی کلانی

دوره 8، شماره 31 ، مهر 1398، صفحه 71-80

https://doi.org/10.22108/bjm.2019.118287.1219

چکیده

مقدمه: لاکتوباسیلو‌س ها به عنوان میکروارگانیسم‌های زنده‌ای شناخته شده‌اند که در معده، ترشحات صفراوی و پانکراس وجود دارند. به سلول‌های اپیتلیال متصل می‌شوند و در روده انسان کلونیزه می‌گردند. بسیاری ... بیشتر مقدمه: لاکتوباسیلو‌س ها به عنوان میکروارگانیسم‌های زنده‌ای شناخته شده‌اند که در معده، ترشحات صفراوی و پانکراس وجود دارند. به سلول‌های اپیتلیال متصل می‌شوند و در روده انسان کلونیزه می‌گردند. بسیاری از پروبیوتیک‌ها به گروه بزرگی از باکتری‌ها به نام باکتری‌های اسید لاکتیک تعلق دارند. با توجه به خواص تنظیم کنندگی سیستم ایمنی پروبیوتیکها و اثر تنظیمی آنها بر عملکردهای سیستم ایمنی هدف این مطالعه ارزیابی اثر دیواره سلولی و عصاره سیتوپلاسمی باکتری لاکتوباسیلوس روتری بر تحریک تولید سایتوکاین های اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما می باشد. مواد و روشها: به این منظور20 نمونه محصولات لبنی سنتی و پاستوریزه جمع‌آوری شد. شناسایی مولکولی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی انجام شد. DNA باکتری‌ها جداسازی و شناسایی گونه‌های باکتری‌ها با تعیین توالی ژنتیکی محصول PCR صورت گرفت. سپس خون هپارینه انسانی تهیه و سلول‌هایی تک هسته‌ای خون محیطی جداسازی شد. میزان تحریک سیستم ایمنی، سایتوکاین‌های اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما با روش الایزا اندازه‌گیری شدند. نتایج: از 20 نمونه محصولات لبنی، 7 ایزوله لاکتوباسیلوس روتری جداسازی و شناسایی شد. سیستم ایمنی در جهت تولید اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما در حضور دیواره سلولی و عصاره سلولی سیتوپلاسمی باکتری لاکتوباسیلوس روتری تحریک نشد. بحث و نتیجه گیری: سطح سایتوکاین‌های تولید شده در سلول‌های مونوکلئار انسانی بعد از تحریک سیستم ایمنی افزایش پیدا نکرد. باکتری لاکتوباسیلوس روتری در ایمونوتراپی کاربرد نخواهد داشت.

پژوهشی- فارسی

مطالعه تجزیه نفت خام با کروماتوگرافی گازی- طیف سنج جرمی و تولید متانوئیک اسید و بیوسورفکتانت توسط جدایه سودوموناس

سمیه کاظم زاده؛ نفیسه سادات نقوی؛ زرین دخت امامی کرونی؛ مسعود فولادگر

دوره 8، شماره 31 ، مهر 1398، صفحه 81-92

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.120421.1252

چکیده

مقدمه: استفاده از بیوسورفکتانت‌ها به‌دلیل مزایایی نظیر سمیت پایین، تخریب پذیری زیستی و مؤثر بودن آن‌ها در محدوده وسیعی از pH و دما افزایش چشمگیری داشته است. زیست پالایی استراتژی کاهش یا حذف ترکیبات ... بیشتر مقدمه: استفاده از بیوسورفکتانت‌ها به‌دلیل مزایایی نظیر سمیت پایین، تخریب پذیری زیستی و مؤثر بودن آن‌ها در محدوده وسیعی از pH و دما افزایش چشمگیری داشته است. زیست پالایی استراتژی کاهش یا حذف ترکیبات نفتی با استفاده از میکروارگانیسم‌هایی است که توانایی تجزیه هیدروکربن‌های نفتی را با استفاده از تولید بیوسورفکتانت‌ها دارند. هدف از این تحقیق بررسی تولید بیوسورفکتانت و زیست پالایی نفت خام توسط باکتری جداسازی شده از لجن فعال پالایشگاه نفت اصفهان بوده است. مواد و روش‌ها: تشخیص تولید بیوسورفکتانت از روش‌های کمی و کیفی غربالگری مانند همولیز در محیط کشت آگار خوندار، روش‌های پراکنش نفت و فروپاشی روغن، سنجش فعالیت امولسیون‌کنندگی و کشش سطحی انجام شد. باکتری با آزمون‌های بیوشیمیایی و تعین توالی ژن 16S rRNA شناسایی شد. باقی‌مانده هیدروکربن‌های نفتی با استفاده از تجزیه و تحلیل به روش کروماتوگرافی گازی (GC-MS) آنالیز شد. نتایج: ﻧﺘﺎﻳﺞ ﺑﺮرﺳﻲﻣﺎﻫﻴﺖ ﺑﻴﻮﺳﻮرﻓﻜﺘﺎﻧﺖ، ﺑا استفاده از روش‌های ﻛﺮوﻣاﺗﻮﮔﺮاﻓﻲﻻﻳﻪ ﻧﺎزک و طیف سنجی تبدیل فوریه مادون قرمز، ﻣﺸﺨﺺ کرد ﻛﻪ بیوسورفکتانت مورد نظر ازﻧﻮع رامنوﻟﻴﭙﻴﺪی است. جدایه باکتریایی مورد نظر سودوموناس شناسایی شد. در این پژوهش، باکتری سودوموناس جداسازی شده از لجن فعال پالایشگاه نفت اصفهان، قادر به تولید بیوسورفکتانت رامنوﻟﻴﭙﻴﺪی بود و کشش سطحی را تا 27 میلی‌نیوتن بر متر کاهش داد. تجزیه و تحلیل کروماتوگرافی گازی حذف 45/80 درصد هیدروکربن‌های نفتی را طی 20 روز توسط این جدایه نشان داد. متانوئیک اسید به ‌مقدار 23 درصد از ترکیبات قابل توجه تولیدی بود. بحث و نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه نشان داد که جدایه BA3 توانایی تولید بیشترین بیوسورفکتانت و همچنین تجزیه نفت خام را دارا بود. بنابراین این سویه پس از تأیید غیربیماری‌زا بودن، قابل استفاده در زیست پالایی، تجزیه نفت‌خام و رفع آلودگی‌های به‌وجود آمده در محیط زیست، توسط صنعت نفت است. همچنین متانوئیک اسید تولید شده به‌عنوان ماده آنتی-باکتریال در غذای دام‌ کاربرد دارد.

زیست شناسی میکروارگانیسم ها

مقالات آماده انتشار

شماره جاری

دوره 12 (1402)

دوره 11 (1401)

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

دوره و شماره: دوره 8، شماره 31، مهر 1398

سال هشتم، شماره 31، پاییز 1398

چکیده

تاثیر گیاهان دارویی بومی ایران بر هلیکوباکتر پیلوری : مطالعه مروری

چکیده

کاربرد باکتری سودوموناس.GSN23 و روشهای الکتروشیمیایی در شناسایی آلاینده فنل

چکیده

شناسایی گونه‌های Chaetomium و Amesia همراه بیماری‌های مختلف در گیاهان زینتی علفی اهواز

چکیده

بررسی توکسین‌زایی قارچ‌های جدا شده از خوراک دام و طیورشهرستان خرم‎آباد

چکیده

تاثیر دیواره سلولی و عصاره سیتوپلاسمی باکتری لاکتوباسیلوس روتری بر تحریک تولید سایتوکاین های اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما

چکیده

مطالعه تجزیه نفت خام با کروماتوگرافی گازی- طیف سنج جرمی و تولید متانوئیک اسید و بیوسورفکتانت توسط جدایه سودوموناس

چکیده