نشریه زیست شناسی میکروارگانیسم ها

شناسنامه علمی شماره

شناسنامه

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.26655

چکیده

بیشتر

پژوهشی- فارسی

بررسی سنتز برون سلولی نانوذرات مگنتیت توسط باکتری اندوفیت Bacillus sp. BR06 تحت استراتژی عصارة عاری از سلول

مراحم آشنگرف؛ یگانه مس‌چی

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401، صفحه 1-16

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.127905.1372

چکیده

مقدمه: نانوذرات مگنتیت (Fe3O4)، به‌دلیل خصوصیات منحصربه‌فرد فیزیکی، شیمیایی، حرارتی و مکانیکی دارای کاربردهای زیست پزشکی مختلفی مانند سلول درمانی، ترمیم بافت، تحویل دارو و تصویربرداری با رزونانس مغناطیسی‌اند. ... بیشتر مقدمه: نانوذرات مگنتیت (Fe3O4)، به‌دلیل خصوصیات منحصربه‌فرد فیزیکی، شیمیایی، حرارتی و مکانیکی دارای کاربردهای زیست پزشکی مختلفی مانند سلول درمانی، ترمیم بافت، تحویل دارو و تصویربرداری با رزونانس مغناطیسی‌اند. هدف از این مطالعه تولید نانوذرات مگنتیت با استفاده از میانکنش عصارة عاری از سلول جدایه‌های باکتریایی اندوفیت ریشة گیاه توت‌فرنگی و اکسید آهن فریک (Fe2O3) به‌عنوان پیش‌ساز نانوذرات بود.مواد و روش‏‏ها: برای سنتز برون سلولی نانوذرات مگنتیت، استراتژی عصارة عاری از سلول استفاده شد. ویژگی نانوذرات مگنتیت سنتزی پس از استخراج از مخلوط واکنش زیست‌تبدیلی، به وسیلة آنالیزهای طیف‌سنجی مرئی ماورای بنفش و الکترومیکروگراف‌های به‌دست‌آمده از میکروسکوپ الکترونی روبشی نشر میدانی، طیف‌سنجی پراش انرژی پرتو ایکس، آزمون پراش اشعه ایکس و طیف سنجی مادون قرمز فوریه مورد بررسی قرار گرفت.نتایج: براساس نتایج به‌دست‌آمده، جدایة باکتری اندوفیت BR06 قادر به تبدیل زیستی پیش‌ساز اکسید آهن فریک به نانوذرات مگنتیت بود. تجزیه و تحلیل‌های فیلوژنیک تأیید کرد جدایة باکتری مذکور متعلق به جنس باسیلوس است و ازنظر قرابت ژنتیکی بیشترین شباهت نوکلئوتیدی را با باسیلوس سیامنسیس (MT052693) دارد. سویه اندوفیت مذکور قادر به سنتز نانوذرات مگنتیت کروی به شکل گل کلمی با میانگین اندازه ذرات 34 نانومتری در غلظت 5 میلی‌مولار اکسید آهن فریک و پس از 24 ساعت واکنش بود. نتایج طیف‌سنجی و میکروسکوپ الکترونی سنتز نانوذرات مگنتیت را تأیید کرد.بحث و نتیجه‏گیری: در این پژوهش، برای نخستین‌بار زیست سنتز برون‌سلولی نانوذرات مگنتیت با استفاده از باکتری اندوفیت باسیلوس سیامنسیس تحت استراتژی عصارة عاری از سلول توصیف شده است.‌‌

پژوهشی- فارسی

اثر روش‌های مختلف تثبیت سویه بر تولید پروتئاز آئروموناس هیدروفیلا MSB16

ماتیا سادات برهانی

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401، صفحه 17-32

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.128199.1382

چکیده

مقدمه: تثبیت سویه‌های میکروبی دارای مزایایی مانند قابلیت تکرار و هزینة کمتر بازیافت سویه در فرایند تخمیر است. هدف از این مطالعه، بررسی اثر تثبیت سویة آئروموناس هیدروفیلا MSB16 بر توانایی تولید پروتئاز ... بیشتر مقدمه: تثبیت سویه‌های میکروبی دارای مزایایی مانند قابلیت تکرار و هزینة کمتر بازیافت سویه در فرایند تخمیر است. هدف از این مطالعه، بررسی اثر تثبیت سویة آئروموناس هیدروفیلا MSB16 بر توانایی تولید پروتئاز آن بود.مواد و روش‏‏ها: بهترین روش تثبیت سویة MSB16، از میان 5 روش مختلف و با استفاده از پلیمرهای آلژینات، آلژینات - پلی وینیل الکل، آلژینات - پلی وینیل الکل - کربنات کلسیم، آلژینات - نانوذرة گاما آلومینیوم اکسید و همچنین کربوکسی متیل سلولز انتخاب شد. مبنای انتخاب بهترین روش تثبیت، میزان تولید پروتئاز سویة تثبیت‌شده در مقایسه با سویة تثبیت‌نشده به‌صورت مطالعة یک فاکتور در یک زمان است. سپس فاکتورهای مؤثر در روش تثبیت انتخاب‌شده، با استفاده از روش‌شناسی سطح پاسخ، بهینه‌سازی شدند. آنالیز داده‌های مربوط به روش‌شناسی سطح پاسخ با استفاده از نرم‌افزار Design Expert 11 و آزمون تحلیل واریانس بررسی شد.نتایج: براساس نتایج روش‌شناسی سطح پاسخ، بالاترین میزان تولید پروتئاز توسط سویة تثبیت‌شده، در پلیمر حاوی 3 درصد آلژینات - 3 درصد پلی وینیل الکل - 3 درصد کربنات کلسیم به دست آمد (U/mL 32/205). مدل درجه دوم به‌دست‌آمده، براساس مقدار F (59/25) و مقدار p (0001/0>) ازنظر آماری معنادار بود. بالابودن ضریب تشخیص (9584/0) و معنادارنبودن تست عدم برازش (7818/0) صحت مدل را تأیید می‌کرد. تولید پروتئاز تحت‌تأثیر غلظت کربنات کلسیم و پلی وینیل الکل قرار می‌گرفت و با غلظت کربنات کلسیم رابطة معکوس داشت.بحث و نتیجه‏گیری: بهینه‌سازی آماری عوامل مؤثر بر تثبیت سویة MSB16 به روش آلژینات - پلی وینیل الکل - کربنات کلسیم به افزایش 13/2 برابری تولید پروتئاز نسبت به سلول‌های میکروبی آزاد و تثبیت‌نشده منجر شد.

پژوهشی- فارسی

جداسازی و شناسایی اکتینوباکترهای تولیدکنندة آنتی‌بیوتیک از ساحل خلیج فارس

سمیه سوری؛ محمد رعایایی؛ شهلا احمدی؛ غلامرضا قزلباش

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401، صفحه 33-50

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.128467.1385

چکیده

مقدمه: اکتینومیست‌ها باکتری‌های رشته‌ای و گرم مثبت هستند که به‌صورت آزاد یا ساپروفیت و گاه همزیست با گیاهان دیده می‌شوند. این باکتری‌ها را می‌توان از همه اکوسیستم‌ها ازجمله خاک، آب، رسوبات دریایی ... بیشتر مقدمه: اکتینومیست‌ها باکتری‌های رشته‌ای و گرم مثبت هستند که به‌صورت آزاد یا ساپروفیت و گاه همزیست با گیاهان دیده می‌شوند. این باکتری‌ها را می‌توان از همه اکوسیستم‌ها ازجمله خاک، آب، رسوبات دریایی به‌ویژه آب‌های گرم جداسازی کرد. اکتینوباکتری‌های دریایی به‌عنوان تولیدکنندة طیف وسیعی از متابولیت‌های ثانویه شناخته شده‌اند. درواقع هر سویه از اکتینوباکتری‌ها به احتمال زیاد ظرفیت ژنتیکی برای تولید 10 تا 20 متابولیت ثانویه را دارد. حدود 23000 نوع آنتی‌بیوتیک از میکروارگانیسم‌ها کشف شده است که طبق برآوردها حدود 10000 نوع از آنها از اکتینوباکتری‌ها جدا شده‌اند. متابولیت‌های ثانویه تولیدشده توسط اکتینوباکتری‌های دریایی، طیف گسترده‌ای از فعالیت‌های زیستی مانند ضدباکتری، ضدقارچ، ضدسرطان، سمیت سلولی، سیتواستاتیک، ضدعفونی، ضدانگل، ضدمالاریا، ضدویروسی، آنتی‌اکسیدان و ضدرگ‌زایی و غیره دارند.مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش برای جداسازی اکتینوباکتری‌ها، نمونه‌های آب و رسوب از خلیج فارس در محل ایستگاه انرژی اتمی بندر بوشهر جمع‌آوری شدند. برای کشت این نمونه‌ها از 7 نوع محیط کشت استفاده شد. برای تعیین هویت جدایه‌های به‌دست‌آمده، ویژگی‌های ریخت‌شناسی، تست‌های بیوشیمیایی و مطالعات مولکولی بررسی شدند.نتایج: 24 جدایة اکتینوباکتر از نمونه‌های آب و رسوب سواحل خلیج فارس جدا شدند که 18 جدایه فعالیت ضدباکتریایی داشتند؛ بنابراین، 75 درصد جدایه‌ها مولد آنتی‌بیوتیک بودند. 95 درصد مواد به‌دست‌آمده از این 18 سویه، اثر ضدباکتریایی علیه باکتری‌های گرم مثبت و 60 درصد علیه باکتری‌های گرم منفی داشتند. 60 درصد از این مواد علیه هر دو گروه باکتری مؤثر بودند.بحث و نتیجه‏گیری: نتایج نشان دادند هرکدام از 18 نوع ماده ضدباکتری جداشده از 18 سویة مختلف، حداقل علیه یک باکتری بیماری‌زا مؤثر هستند که این نشان‌دهندة توانایی بالقوه این منبع برای مطالعه در زمینة دستیابی به آنتی‌بیوتیک‌های جدید است.

پژوهشی- فارسی

نقش سیانوباکتری‌های مولد EPS در خاک‌های بیابانی

مرضیه حسینی؛ پریسا محمدی؛ پریناز قدم؛ عذرا صبورا؛ رقیه زارعی؛ زهرا حجتی بناب

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401، صفحه 51-66

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.129148.1397

چکیده

مقدمه: پوسته‌های زیستی که روی سطح خاک‌ تشکیل می‌شوند، از میکرو و ماکرو‌ارگانیسم‌هایی همچون سیانوباکتری‌ها، قارچ‌ها، باکتری‌ها، اکتینومیست‌ها، جلبک‌ها، ویروس‌ها، خزه‌ها، گلسنگ‌ها و گیاهان ... بیشتر مقدمه: پوسته‌های زیستی که روی سطح خاک‌ تشکیل می‌شوند، از میکرو و ماکرو‌ارگانیسم‌هایی همچون سیانوباکتری‌ها، قارچ‌ها، باکتری‌ها، اکتینومیست‌ها، جلبک‌ها، ویروس‌ها، خزه‌ها، گلسنگ‌ها و گیاهان تشکیل شده‌اند. سیانوباکتری‌ها، میکروارگانیسم‌های کلیدی در تشکیل پوسته‌های زیستی خاک، به‌خصوص در مناطق بیابانی‌اند که با رشد خود و تشکیل کلنی بر سطح خاک و تولید پلی‌ساکارید خارجی (EPS) باعث افزایش مقدار کربن و نیتروژن خاک می‌شوند و نقش مهمی در تقویت انواع خاک‌ها به‌ویژه خاک‌های فقیر از لحاظ مواد غذایی دارند و باعث جلوگیری از فرسایش آنها می‌شوند.مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش، برترین سویه‌های سیانوباکتریایی مولد کربوهیدرات ترشحی، از میان ۱۹ سویة جداشده از خاک استان‌های مختلف کشور انتخاب شد. میزان تولید کربوهیدرات در این سویه‌ها به روش فنول - اسید سولفوریک تعیین شد. سپس سویه‌های منتخبِ مولد بیشترین مقدار کربوهیدرات ترشحی، در مدل گلدانی به خاک‌های فقیر تلقیح شد. پس از گذشت ۷ هفته از رشد سیانوباکتری‌ها در خاک، تغییر ویژگی‌های فیزیکی و شیمیایی آن اندازه‌گیری شد. همچنین سرعت تشکیل پوستة زیستی و میزان انسجام ذرات خاک به یکدیگر، به‌صورت میکروسکوپی بررسی شد.نتایج: میزان تولید کربوهیدرات در این سویه‌ها به‌ترتیب برابر 66/86 میکروگرم بر میلی‌لیتر برای سویة Anabaena sphaerica، مقدار 91/5۵ میکروگرم بر میلی‌لیتر برای جنس Geitlerinema.sp و مقدار 19/6۴ میکروگرم بر میلی‌لیتر برای سویة Nostoc pruniformeبود. نتایج نشان می‌دهند هر سه این سویه‌ها قادر به تشکیل پوسته‌های زیستی در خاک هستند.بحث و نتیجه‏گیری: سویة Anabaena sphaericaبه‌دلیل سرعت رشد زیاد، تولید بیشتر زیست‌توده و کربوهیدرات ترشحی، افزایش بیشتر مقدار نیتروژن و کربن خاک و نیز تشکیل بهتر پوستة زیستی برای آزمون‌های بعدی انتخاب شد. این سویه برخی ویژگی‌های بافت خاک را بهبود‌ بخشید که در حاصلخیزی آن می‌تواند تأثیر مثبتی داشته باشد.

پژوهشی- فارسی

سنتز نانوذرات طلا با استفاده از اگزوپلی‌ساکارید لاکتوباسیلوس پاراکازئی و ارزیابی خصوصیات ضدباکتریایی، ضدبیوفیلمی و آنتی‌اکسیدانی آنها

مهیار زینی وند؛ سید سهیل آقایی؛ محسن زرگر؛ محمد علی قاسم زاده

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401، صفحه 67-83

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.129552.1404

چکیده

مقدمه: روش‌های مختلفی برای تولید نانوذرات وجود دارند؛ اما امروزه سنتز نانوذرات با روش‌های زیستی به‌دلیل آسان‌بودن، سازگاری با محیط زیست و مقرون‌به‌صرفه بودن، توجه محققان را به خود جلب کرده است. هدف ... بیشتر مقدمه: روش‌های مختلفی برای تولید نانوذرات وجود دارند؛ اما امروزه سنتز نانوذرات با روش‌های زیستی به‌دلیل آسان‌بودن، سازگاری با محیط زیست و مقرون‌به‌صرفه بودن، توجه محققان را به خود جلب کرده است. هدف از پژوهش اخیر سنتز زیستی نانوذرات طلا با استفاده از اگزوپلی‌ساکارید لاکتوباسیلوس پاراکازئی (MN809528) و بررسی فعالیت ضدباکتریایی، ضدبیوفیلمی و آنتی‌اکسیدانی است.مواد و روش‏‏ها: برای سنتز نانوذرات طلا 30 میلی‌لیتر محلول 1 درصد اگزوپلی‌ساکارید (1/0 گرم) به حجم مساوی از محلول آبی HAuCl4 یک میلی‌مولار اضافه و با استفاده از استیرر (rpm 180) به مدت 48 ساعت در دمای اتاق به خوبی مخلوط شد. ویژگی نانوذرات طلا سنتزشده با استفاده از آنالیز‌های طیف‌سنجی UV-VIS، FT-IR، DLS، XRD، EDX، FE-SEM انجام شد. فعالیت ضدباکتریایی نانوذرات طلا تولیدشده با روش انتشار در چاهک، فعالیت ضدبیوفیلمی با روش رقت در میکروپلیت 96 خانه‌ای و فعالیت آنتی‌اکسیدانی نانوذرات با استفاده از قابلیت جذب رادیکال‌های DPPH بررسی شد.نتایج: داده‌های طیف‌سنجی، وجود پیک در 524 نانومتر را نشان دادند که ویژة نانوذرات طلا است. بررسی شکل و اندازة نانوذرات با FE-SEM نشان داد نانوذرات تولیدشده کروی شکل‌اند و به‌طور متوسط اندازة آن‌ها 50-20 نانومتر است. فعالیت ضدباکتریایی نانوذرات طلا با غلظت 50 میکروگرم بر میلی‌لیتر در برابر همه باکتری‌های تست مشاهده شد؛ با این حال، بیشترین فعالیت ضدباکتریایی در برابر اسینتوباکتر بومانی (ATCC 17978) مشاهده شد. در این مطالعه نانوذرات طلا تولیدشده به‌عنوان مهارکنندة بیوفیلم و رادیکال DPPH عمل کردند.بحث و نتیجه‏گیری: نتایج نشان می‌دهند لاکتوباسیلوس پاراکازئی (MN809528)، منبع زیستی خوبی برای سنتز نانوذرات طلا است. مطالعة حاضر، نخستین گزارش از تولید نانوذرات طلا توسط اگزوپلی‌ساکارید جداشده از باکتری‌های اسید لاکتیک بومی است.

پژوهشی- فارسی

شناسایی و بهبود تولید آنزیم L- آسپاراژیناز با استفاده از سویة قارچی جداشده از خاک: Sarocladium kiliense IBRC-M 30453

ندا فاضلی؛ نیره علی مددی؛ شقایق نصر

دوره 11، شماره 42 ، تیر 1401، صفحه 85-102

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.129749.1406

چکیده

مقدمه: L- آسپاراژیناز یک آنزیم ضدسرطان مهم است که در صنایع پزشکی و غذایی کاربرد دارد. با در نظر داشتن اهمیت L- آسپاراژیناز در صنایع مختلف، یافتن سویه‌های مولد جدیدی ارجحیت می‌یابد که بتوانند سطح بالاتری ... بیشتر مقدمه: L- آسپاراژیناز یک آنزیم ضدسرطان مهم است که در صنایع پزشکی و غذایی کاربرد دارد. با در نظر داشتن اهمیت L- آسپاراژیناز در صنایع مختلف، یافتن سویه‌های مولد جدیدی ارجحیت می‌یابد که بتوانند سطح بالاتری از آنزیم با حداقل عوارض جانبی را تولید کنند.مواد و روش‏‏ها: غربالگری اولیه سویه‌های مولد L- آسپاراژیناز با آزمون کیفی روی پلیت محیط کشت زاپک داکس آگار تغییریافته حاوی L- آسپاراژین به‌عنوان منبع نیتروژن و فنل رد به‌عنوان اندیکاتور pH انجام شد. فعالیت L- آسپاراژینازی سویة مولد با استفاده از روش نسلریزاسیون اندازه‌گیری شد. شناسایی سویة قارچی با تعیین ویژگی‌های مورفولوژیک و آنالیز فیلوژنی ژن‌های ریبوزومی ITS (نواحی فاصله‌انداز رونویسی‌شوندة داخلی) و ژن LSU (زیرواحد بزرگ ریبوزومی) انجام شد. تولید L- آسپاراژیناز با روش یک عامل در هر زمان بهینه‌سازی شد. تأثیر دما، میزان مایه تلقیح، منبع کربن و نیتروژن بر تولید آنزیم ارزیابی شد.نتایج: سویة Sarocladium kiliense IBRC-M 30453 از خاک، جداسازی و به‌عنوان یک سویة بالقوه مولد L- آسپاراژیناز شناسایی شد. روش تولید آنزیم خارج سلولی بود. فعالیت بهینة آنزیم U ml−1 4/62 در دمای 25 درجه سانتی‌گراد، میزان مایه تلقیح حجمی 9 درصد و با استفاده از سوکروز به‌عنوان منبع کربن و آمونیوم کلراید به‌عنوان منبع نیتروژن به دست آمد. فرایند بهینه‌سازی به افزایش 8/2 برابری تولید آنزیم منجر شد.بحث و نتیجه‏گیری: به‌دلیل افزایش کاربردهای پزشکی و غذایی L- آسپاراژیناز در بازار تجاری، تقاضا برای این آنزیم از منابع جدید و با عوارض جانبی کمتر وجود دارد و L- آسپاراژیناز قارچی می‌تواند پاسخی مناسب به وضعیت کنونی بازار باشد؛ با وجود این، به‌کارگیری روش‌های آماری بهینه‌سازی و دست‌ورزی‌های ژنتیکی در مطالعات پیش رو برای دستیابی به حداکثر میزان تولید و بهبود قابلیت تولید صنعتی توصیه می‌شود.

تاثیر گیاهان دارویی بومی ایران بر هلیکوباکتر پیلوری : مطالعه مروری

محمدرضا علی رمائی؛ محمد ربانی خوراسگانی؛ محمدرضا رحمانی؛ سید حمید زرکش اصفهانی

دوره 8، شماره 31 ، مهر 1398، ، صفحه 1-18

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2019.113830.1169

چکیده

مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری یک باکتری گرم منفی و میکروآئروفیل می‌باشد. حدود نیمی از جمعیت انسانی جهان آلوده به این باکتری می‌باشند. این باکتری یکی از عوامل اصلی زخم معده و سرطان معده شناخته‌شده است. افزایش ... بیشتر مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری یک باکتری گرم منفی و میکروآئروفیل می‌باشد. حدود نیمی از جمعیت انسانی جهان آلوده به این باکتری می‌باشند. این باکتری یکی از عوامل اصلی زخم معده و سرطان معده شناخته‌شده است. افزایش مقاومت‌های آنتی‌بیوتیکی، هزینه بالای درمان‌های ترکیبی و عوارض جانبی نامطلوب، منجر به افزایش تمایل به روش‌های جایگزین نظیر استفاده از آنتی‌اکسیدان‌ها، عوامل ضدالتهابی، پروبیوتیک ها و داروهای گیاهی شده است. مواد و روش‌ها: در این بررسی تحقیقات صورت گرفته بر روی اثرات 29 خانواده گیاهی شامل 69 گونه گیاهی در ایران برعلیه هلیکوباکتر پیلوری در شرایط آزمایشگاهی و بالینی، بررسی و دسته‌بندی‌شده است. نتایج: با توجه به نتایج به‌دست‌آمده می‌توان از گیاهانی نظیر نعناع، آویشن شیرازی، مروتلخ، گئوم ایرانیکوم، سماق، ملک ازرق، گلپر، زنیان، افنسطین، شیرین‌بیان، زیتون و انار به‌عنوان گیاهانی که بیشترین تأثیر را برعلیه هلیکوباکتر پیلوری در شرایط آزمایشگاهی از خود نشان داده‌اند یادکرد. بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به اثرات ضد باکتریایی گیاهان موردبررسی در این مطالعه، این گیاهان دارویی پتانسیل استفاده به‌عنوان جایگزینی مناسب در درمان عفونت ناشی از هلیکوباکتر پیلوری را دارا می‌باشند اما قبل از هر چیز باید سنجش عملکرد ضد باکتریایی عصاره‌های گیاهی برعلیه هلیکوباکتر پیلوری هم در شرایط آزمایشگاهی و هم در شرایط بالینی مورد ارزیابی قرار گیرد. تعیین ماده مؤثر می‌تواند به تحقیقات بعدی در این زمینه کمک شایانی نماید. همچنین عملکرد گونه‌های گیاهی یکسان در مناطق مختلف باید سنجیده شده و نهایتاً درزمینه تأثیرگذاری آن‌ها نتیجه‌گیری شود. در ارتباط با سویه‌های هلیکوباکتر پیلوری مورد آزمایش نیز بایستی از یک‌سویه استاندارد برای ارزیابی عملکرد ضد باکتریایی عصاره‌های گیاهی مختلف استفاده شود و استفاده از سویه‌های متفاوت ممکن است نتایج متفاوتی را در مورد تأثیر ضد باکتریایی عصاره گیاهی یکسان حاصل نماید.

جدا‏سازی، شناسایی و بهینه‌سازی باکتری‌های تولیدکننده اتانول از فرآیند تخمیر با پایه ساکارومیسس در صنایع الکل‌سازی ایران

مجتبی محسنی؛ هدی ابراهیمی

دوره 2، شماره 7 ، آبان 1392، ، صفحه 15-28

چکیده

مقدمه : با توجه به رشد جمعیت جهان، مصرف زیاد انرژی، محدودیت منابع نفتی تامین کننده انرژی و افزایش قیمت سوخت در آینده، جایگزینی منبع انرژی دیگر امری ضروری است. اتانول سوخت تجدیدپذیر و بی‌خطر بوده و ... بیشتر مقدمه : با توجه به رشد جمعیت جهان، مصرف زیاد انرژی، محدودیت منابع نفتی تامین کننده انرژی و افزایش قیمت سوخت در آینده، جایگزینی منبع انرژی دیگر امری ضروری است. اتانول سوخت تجدیدپذیر و بی‌خطر بوده و تولید جهانی آن بیشتر بر پایه تخمیر میکروبی است. جداسازی باکتری‌ها از تانک‌های تخمیر صنایع الکل‌سازی و بهینه‌سازی شرایط رشد آن‌ها به منظور یافتن جدایه‌هایی با توان بالای تولید اتانول برای معرفی به صنعت، از اهداف این پژوهش بود . مواد و روش ‏‏ ها: نمونه‌های جمع‌آوری شده از تانک تخمیر کارخانجات الکل‌سازی در محیط کشت مایع ZSM ، غنی‌سازی شد. سپس، برای جداسازی باکتری‌های تولید کننده اتانول، به محیط کشت محتوی آگار RMA منتقل شد. بهینه‌سازی شرایط رشد جدایه‌ها و تاثیر آن بر تولید اتانول شامل: درجه حرارت رشد، اسیدیته، زمان تخمیر، هوادهی، غلظت اولیه سوبسترا و منابع کربن و نیتروژن بررسی شد. همچنین، برای شناسایی جدایه‌ها، مشخصات ریخت شناسی، فیزیولوژیک و مولکولی مطالعه شد . نتایج: سه جدایه باکتریایی ZYM7 ، ZYM8 و ZYM9 ، از تانک تخمیر اتانول جداسازی شد. هر سه جدایه توانایی تولید اتانول را نشان داد و پس از 48 ساعت گرماگذاری، به ترتیب 00/5، 60/7 و 00/4 گرم بر لیتر اتانول، اندازه‌گیری شد. نتایج نشان داد که هر سه جدایه علاوه بر مصرف بیشتر قندها، توانایی مصرف قند پنج‌کربنه زایلوز را داشتند. جدایه ZYM7 توانست با مصرف زایلوز، بیش‏ترین اتانول به مقدار 00/13 گرم بر لیتر را تولید کند. بررسی مشخصات ریخت‏شناسی و فیزیولوژیک جدایه‏‌ها نشان داد که جدایه ZYM7 به جنس لاکتوباسیلوس [i] و جدایه‌های ZYM8 و ZYM9 به جنس استوباکتر [ii] متعلق بود. همچنین، بررسی توالی ژن 16S rRNA و رسم درخت فیلوژنی نشان داد که جدایه ZYM7 ، دارای 99 درصد هومولوژی با لاکتوباسیلوس رامنوسوس [iii] و جدایه‏های ZYM8 و ZYM9 به ترتیب دارای 99 و 97 درصد هومولوژی با استوباکتر پاستیوریانوس [iv] بودند . بحث و نتیجه ‏ گیری: نتایج نشان می‌دهد باکتریهای جدا شده، گزینه مناسبی برای تولید اتانول از مواد اولیه غنی از زایلوز هستند و می‌توانند به صنایع تخمیری معرفی شوند . [i] . Lactobacillus sp. [ii] . Acetobacter sp. [iii] . Lactobacillus rhamnosus [iv] . Acetobacter pasteurianus

بررسی سویه ‏های اشرشیاکلی (E.coli) به‏دست آمده از بستنی سنتی بر اساس پروفایل پروتئینی در شهر اصفهان

مریم رنجبر؛ رضا ندائی نیا؛ محمد گلی؛ مصطفی مانیان؛ محمد رضا مراثی؛ منصور فیضی؛ نفیسه کارگران

دوره 5، شماره 17 ، خرداد 1395، ، صفحه 171-184

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.20377

چکیده

مقدمه: باکتری‏هایی که در مواد غذایی حضور دارند، تحت تأثیر فرآیندهای مختلف دمایی نظیر سرما و گرما قرار می‏گیرند. این موارد باعث ایجاد شوک در باکتری‏ها شده و آن‏ها را وادار به تولید پروتئین‏ها ... بیشتر مقدمه: باکتری‏هایی که در مواد غذایی حضور دارند، تحت تأثیر فرآیندهای مختلف دمایی نظیر سرما و گرما قرار می‏گیرند. این موارد باعث ایجاد شوک در باکتری‏ها شده و آن‏ها را وادار به تولید پروتئین‏ها ‏و بعضاً تغییراتی در تولید آنزیم‏ها کرده که این امر می‏تواند ویژگی خاصی به آن‏ها ‏‏داده که اطلاع از این ویژگی در تشخیص به موقع و دقیق‏تر کمک کننده است. مواد و روش ‏‏ها: در پژوهش حاضر، ‏بیش از 100 نمونه‏ به شکل تصادفی از نقاط مختلف شهر اصفهان جمع‏آوری و تعداد 48 جدایه اندول مثبت از آن‏ها جداسازی شد. این جدایه‏ها ‏بر اساس آزمون‏های فنوتیپی و الکتروفورز پروتئین ارزیابی شدند.‏ ‏نتایج: بر اساس آزمون‏های بیوشیمیایی، با بهره‏مندی ‏‏از تحلیل‏‏های عددی و دندروگرام ترسیم شده بر مبنی روش jacard، جدایه‏ها ‏در 8 گروه قرار گرفتند. این گروه‏ها ‏نتیجه تفاوت فنوتیپی بین استرین‏ها ‏و اختلاف آن‏ها ‏‏در استفاده از منابع کربنی مختلف بود. بنابراین، جدایه‏های ‏‏گروه یک و دو به سویه اشرشیا کلی (معادل 79 درصد) تعلق داشتند. جدایه‏های به‏دست آمده از بستنی در الگوی الکتروفورزی دارای دو باند پروتئینی در ناحیه 59/23 و 79/20 کیلو دالتون بودند، که از این لحاظ با جدایه استاندارد تفاوت داشتند. ‏‏‏ بحث و نتیجه‏ گیری: به علت وجود تفاوت‏های ‏بیوشیمیایی و مولکولی، به ویژه در دو باند پروتئینی یاد شده در جدایه‏های به‏دست آمده، در مقایسه با جدایه استاندارد، می‏توان نتیجه گرفت جدایه‏های ‏‏باکتریایی موجود در بستنی به علت آنکه تحت تاثیر فرآیند‏‏های ‏‏مختلف دمایی قرار می‏گیرند، تحریک به تولید پروتئین‏ها و بعضاً تغییراتی در تولید آنزیم‏ها شده، که می‏تواند ویژگی خاصی به این جدایه‏ها ‏داده، و در نهایت، ‏باعث ابهام در تشخیص شود‏.‏‏‏ بنابراین بررسی‏های مولکولی بیشتری در این زمینه نیاز است انجام شود.

جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری لاکتوباسیلوس برویس از سرکه بومی

زینب ابراهیمی؛ ابوالقاسم اسماعیلی؛ طوبی السادات احمدی؛ حمید امامی؛ محمد ربانی

دوره 5، شماره 18 ، شهریور 1395، ، صفحه 95-106

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.20386

چکیده

مقدمه: سرکه یک چاشنی پرمصرف در سراسر جهان است که از مواد اولیه و روش‌های متفاوت برای تولید آن استفاده می‌شود. در ایران نیز انواع سرکه‌های طبیعی با استفاده از میوه‌های مختلف مانند انگور و سیب، بیشتر ... بیشتر مقدمه: سرکه یک چاشنی پرمصرف در سراسر جهان است که از مواد اولیه و روش‌های متفاوت برای تولید آن استفاده می‌شود. در ایران نیز انواع سرکه‌های طبیعی با استفاده از میوه‌های مختلف مانند انگور و سیب، بیشتر به‌صورت خانگی تهیه می‌شود. سرکه طبیعی دارای خواص بسیار زیادی است و طب سنتی ایرانی اسلامی نیز مصرف آن را توصیه کرده است. سرکه حاوی باکتری‌های اسید استیک، اسید لاکتیک و مخمر است. باکتری‌های اسید استیک و مخمرها در تولید سرکه نقش دارند و باکتری‌های اسید لاکتیک باعث بهبود طعم آن می‌شوند. هدف این پژوهش جداسازی و تعیین هویت باکتری‌های اسید لاکتیک از سرکه سنتی به‌ویژه لاکتوباسیلوس برویس به‌منظور ارزیابی میزان تولید گاما آمینوبوتریک اسید (گابا) است‏. ‏‏ مواد و روش ‏‏ها: نمونه‌های سرکه سنتی شامل یک نمونه سرکه سیب و دو نمونه سرکه انگور، در محیط کشت مخصوص باکتری‌های اسید لاکتیک (MRS) که به آن آنتی‌بیوتیک نیستاتین اضافه شد و کشت داده شد. با انجام تعدادی از آزمایش‌های تشخیصی از جمله آزمایش کاتالاز، و تخمیر برخی از کربوهیدرات‌ها، رشد در دما، pH و غلظت‌های متفاوت نمک، حضور لاکتوباسیل‌ها بررسی شد و درنهایت با تکثیر ژن s r DNA 16 و تعیین توالی، پنج گونه لاکتوباسیلوس شناسایی شدند. ‏‏ نتایج: از سه نمونه سرکه سنتی، دوازده جدایه لاکتوباسیلوس جداسازی شد. همه باکتری‌های جداشده کاتالاز منفی و گرم مثبت بودند و در pHهای 5/4 و 5/6 و در غلظت‌های 2، 4 و 5/6درصد نمک رشد کردند. اغلب باکتری‌ها در دمای 15 درجه سانتی‏گراد رشد کردند. جدایه شماره 12 در دمای 45 درجه سانتی‏گراد نیز رشد کرد. آزمایش‌های بیوشیمیایی، حضور لاکتوباسیلوس پلانتارم و لاکتوباسیلوس برویس نمونه‌های مطالعه‌شده را نشان دادند. نتیجه تعیین توالی وجود سه جدایه لاکتوباسیلوس برویس را تأیید کرد. ‏ بحث و نتیجه‏ گیری: لاکتوباسیلوس پلانتارم و لاکتوباسیلوس برویس در سرکه‌های بومی بررسی‌شده تشخیص داده شد. هرچند جداسازی لاکتوباسیلوس پلانتارم از سرکه قبلاً گزارش شده است، جداسازی لاکتوباسیلوس برویس از سرکه برای اولین بار گزارش می‌شود‏. ‏‏

استاندارد کردن PCR تشخیصی به‏ وسیله اینترنال کنترل تکثیری

محمد حسن شاه حسینی؛ مریم قهری؛ محمد امین محمودی؛ الهام مسلمی

دوره 4، شماره 15 ، آذر 1394

چکیده

مقدمه: بروز نتایج متفاوت در آزمایشگاه‏ها به علت استاندارد نبودن، از معایب روش‏‏‏‏های تکثیر مولکولی است. در بیشتر مقالات چاپ شده در زمینه تشخیص PCR عوامل عفونی، ‏اینترنال کنترل تکثیری (IC) وجود ... بیشتر مقدمه: بروز نتایج متفاوت در آزمایشگاه‏ها به علت استاندارد نبودن، از معایب روش‏‏‏‏های تکثیر مولکولی است. در بیشتر مقالات چاپ شده در زمینه تشخیص PCR عوامل عفونی، ‏اینترنال کنترل تکثیری (IC) وجود ندارد. هدف از پژوهش حاضر، طراحی و توسعه یک روش ساده و سریع، برای‏‏‏‏‏‏ ساخت اینترنال کنترل آزمون‏‏ PCR ‏در آزمایشگاه‏های ‏تشخیصی است. ‏ مواد و روش‏‏ ها: در پژوهش حاضر، برای ساخت اینترنال کنترل رقابتی، از پرایمرهای مرکب و روش PCR-Cloning استفاده شد‏‏. بدین ترتیب که پرایمرهای جلویی و عقبی تشخیص PCR ویروس هپاتیت) ‏(HBV، ویروس هرپس سیمپلکس ‏HSV))، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (MTB)،‏‏ مایکوپلاسما پنومونیه (Mpn)،‏‏ کریپتوکوکوس نئوفورمنس ‏(Cne)،‏‏ جنس سالمونلا (Sal. sp) و جنس مایکوپلاسما (M. sp) را در بخش '5 پرایمرهای ژن کینتوپلاست لیشمانیا، به شکل‏‏ دم طراحی و سنتز شد. اینترنال کنترل‏های تکثیری با پلاسمید pTZ57R الحاق و در باکتری اشریشیاکلی JM107 ترانسفورم شد‏‏. تعداد حداقل IC در هر واکنش PCR از طریق رقیق‏سازی ‏‏‏‏و همین‏طور طیف پاسخ PCR همراه با IC بررسی شد‏‏‏‏‏‏‏‏‏. ‏ نتایج: HBV–HSV–MTB–MPN–Cne–Sal. sp– و M. sp با پرایمر‏های اختصاصی به ترتیب برابر با 272bp-284bp-415bp-345bp-245bp-454bp-262bp و محصول اینترنال کنترل هم به ترتیب 672bp-668bp-661bp-669bp-660bp-662bp-660bp جفت باز بود، که از نظر اندازه، اختلاف مطلوبی بین محصول PCR و IC وجود دارد و به آسانی در ژل قابل تفکیک است. تعداد حداقل IC در هر واکنش، 1000 عدد تعیین شد. حداقل و حداکثر حساسیت آزمون‏‏ PCR همراه با IC برای همه عوامل در حد مطلوبی به دست آمد. در آزمون‏‏ ویژگی با عوامل مختلف هم، هیچ محصول ناخواسته‏ای ‏مشاهده نشد. ‏ بحث و نتیجه گیری: نتایج منفی و مثبت کاذب که به علت‏های‏‏‏ مختلف در روش‏‏‏ PCR رخ می‏دهد از مشکلات مهم این روش‏‏‏ جذاب است‏‏‏. استفاده از یک اینترنال کنترل در تشخیص مولکولی به عنوان کنترل داخلی، می‏‏تواند این خطاها را شناسایی کند.

پژوهشی- انگلیسی

رویکرد جدید در حذف میکروارگانیسم‌های عامل فرسودگی آثار تاریخی سنگی توسط بیوسایدها

ماندانا لک؛ پریسا محمدی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 27 شهریور 1400

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.129380.1399

چکیده

مقدمه: فرسودگی زیستی میراث فرهنگی پدیده‌ای جهانی است که ارتباط نزدیکی با حضور ماکروارگانسیم و میکروارگانیسم هایی مانند باکتری‌ها ، آرکی‌ها، قارچ‌ها و گلسنگ‌ها و متابولیت‌های آنها دارد. چنین جوامعی ... بیشتر مقدمه: فرسودگی زیستی میراث فرهنگی پدیده‌ای جهانی است که ارتباط نزدیکی با حضور ماکروارگانسیم و میکروارگانیسم هایی مانند باکتری‌ها ، آرکی‌ها، قارچ‌ها و گلسنگ‌ها و متابولیت‌های آنها دارد. چنین جوامعی منجر به آسیب فیزیکی و شیمیایی و همچنین تغییر زیبایی در آثار فرهنگی می شود. برای کنترل فرسودگی زیستی ناشی از رشد میکروارگانیسم‌های میراث فرهنگی، از مواد ضدعفونی کننده مختلف استفاده شده است. این مطالعه با هدف استفاده موثرنر از ضدعفونی کننده های شیمیایی متداول در حوزه حفاظت از میراث فرهنگی متمرکز شده است و راهی برای کاهش میزان مصرفی میزان ضدعفونی کننده‌ها در کنترل رشد و حذف میکروارگانیسم‌ها پیشنهاد نموده است که منجر به کاهش آسیب‌های زیست‌ محیطی می گردد.مواد و روش‌ها: در این مقاله اثرات ضد میکروبی ضدعفونی کننده های متداول از جمله کلرید بنزالکونیوم ، ایزوتیازولینون، فرمالین، گلوتارآلدئید و پودر ضد عفونی کننده مبتنی بر اکسیژن علیه باکتری‌ها و قارچ‌های جدا شده از سنگ آرامگاه کوروش بزرگ با روش میکروبراث بررسی شد. سپس اثر ترکیبی ضدعفونی کننده‌ها با استفاده از روش چکربورد مطالعه گردید.یافته‌ها: نتایج آزمون ها نشان داد که گلوتارآلدئید و پودر ضدعفونی کننده مبتنی بر اکسیژن، MIC بیشتری نسبت به سایر ضدعفونی کننده‌ها یعنی کلرید بنزالکونیوم ، ایزوتیازولینون و فرمالین داشتند. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که تمام ضدعفونی کننده‌های انتخاب شده در این مطالعه، دارای اثرات ضد میکروبی قابل قبولی بر میکروارگانیسم‌های جدا شده از سنگ آرامگاه کوروش بودند و ترکیب ضدعفونی کننده‌ها موجب شد تا مقدار کمتری از این مواد شیمیایی استفاده شود که به لحاظ زیست محیطی بسیار حائز اهمیت است.

پژوهشی- انگلیسی

اثر برخی قارچ های میکوریزی دارسانه‌ای روی رشد گیاه و کنترل زیستی بیماری برق‌زدگی در دو رقم نخود

ناهید معرف‌زاده؛ هادی خاطری؛ روح‌اله شریفی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 20 مهر 1400

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.130031.1410

چکیده

مقدمه: بیماری برق‌زدگی نخود با عامل قارچی Ascochyta rabiei در بیشتر مناطق دنیا نقش مهمی در کاهش عملکرد و کیفیت دانه نخود دارد. این تحقیق با هدف بررسی قابلیت برخی قارچ‌های میکوریزی دارسانه‌ای (arbuscular mycorrhizal fungi, ... بیشتر مقدمه: بیماری برق‌زدگی نخود با عامل قارچی Ascochyta rabiei در بیشتر مناطق دنیا نقش مهمی در کاهش عملکرد و کیفیت دانه نخود دارد. این تحقیق با هدف بررسی قابلیت برخی قارچ‌های میکوریزی دارسانه‌ای (arbuscular mycorrhizal fungi, AMF) در مهار زیستی این بیمارگر و صفات رشدی در دو رقم نخود انجام شد. مواد و روش‌ها: پنج گونه AMF شامل Funneliformis mosseae، Gigaspora margarita، Glomus fasciculatum، Glomus versiform و Rhizophagus irregularis تهیه شده و اثرشان در مقایسه با قارچ‌کش کلروتالونیل بر مهار برق‌زدگی و نیز تاثیر آن‌ها بر برخی صفات رشدی در دو رقم نخود سارال و بیونیج در حضور بیمارگر بررسی شد. این آزمایش در گلخانه به صورت فاکتوریل و بر پایه طرح کاملاً تصادفی با ۱۶ تیمار و ۶ تکرار انجام شد. نتایج: در هر دو رقم نخود، کلروتالونیل بیشترین میزان بازدارندگی ازA. rabiei را نشان داد و همه گونه‌های AMF (به استثنای G. fasciculatum در رقم سارال)، سبب کاهش معنی‌دار شاخص بیماری نسبت به شاهد آلوده شدند. بیشترین اثر بازدارندگی از بیماری توسط میکوریزهای R. irregularis و G. versiform به ترتیب با 15/46 و 30/42 در رقم سارال و توسط G. fasciculatum با 40 درصد در رقم بیونیج دیده شد. بیشتر گونه‌های AMF در حضور بیمارگر، سبب بهبود شاخص‌های رشدی نخود شدند و بهترین اثر در رقم‌های سارال و بیونیج به ترتیب به R. irregularis و G. fasciculatum تعلق داشت. بیشترین میزان کلنیزاسیون ریشه در هر دو رقم مربوط به G. fasciculatum بود. بحث و نتیجه‌گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که AMF می‌توانند سبب افزایش رشد گیاه و کاهش خسارت A. rabiei در دو رقم نخود شوند. میزان کاهش بیماری و تحریک رشد به ژنوتیپ گیاه و گونه AMF وابسته بود. رابطه‌ای بین میزان کلنیزاسیون ریشه توسط AMF و کاهش بیماری برق‌زدگی مشاهده نگردید.

مشاهده مقاله

پژوهشی- انگلیسی

مطالعه بر روی بهینه سازی تولید آنزیم ال-آسپارژیناز ضد سرطان با استفاده از باسیلوس سوبتیلیس جداسازی شده از خاک استان آذربایجان شرقی

نسرین غلامی؛ غلامحسین ابراهیمی پور؛ محمد یعقوبی آوینی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 مرداد 1400

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.129050.1393

چکیده

مقدمه: آنزیم ال-آسپاراژیناز به طور موثر برای درمان بیماران مبتلا به سرطان از جمله لوسمی لنفوبلاستیک حاد، ملانوسارکوما، لنفوما مورد استفاده قرار می گیرد. منابع باکتریایی جز منابع مهم و قابل توجه برای ... بیشتر مقدمه: آنزیم ال-آسپاراژیناز به طور موثر برای درمان بیماران مبتلا به سرطان از جمله لوسمی لنفوبلاستیک حاد، ملانوسارکوما، لنفوما مورد استفاده قرار می گیرد. منابع باکتریایی جز منابع مهم و قابل توجه برای تولید انبوه آنزیم ال- آسپارژیناز است.مواد و روش ها: در این مطالعه، باکتری تولید کننده ال-آسپارژیناز از خاک های آذربایجان جداسازی شد. بطورکلی بر اساس روش اسپکتروفوتومتری با معرف نسلر، 4 جدایه با فعالیت آسپارژینازی بالا مشاهده شد. جدایه ای که دارای فعالیت آسپارژینازی و فاقد فعالیت گلوتامینازی بود برای ادامه مطالعه انتخاب شد. جدایه مورد نظر بر اساس آزمایشات میکروسکوپی و بیوشیمیایی شناسایی شد. بهینه سازی شرایط محیط کشت از جمله فاکتورهای غذایی (منبع کربن، و نیتروژن) و پارامتر های فیزیکی (pH و دما) برای تولید بالای آنزیم آسپاراژیناز مورد سنجش قرار گرفت.نتایج: مطالعات بهینه سازی نشان می دهد که بالاترین میزان آنزیم ال-آسپارژیناز در 7 pH، دمای 37 درجه سانتیگراد، در حضور 1 درصد آب پنیر به عنوان منبع کربن و 0.2 درصد آسپاراژین به عنوان منبع نیتروژن دیده می شود.بحث و نتیجه گیری: بنابراین از این ارگانیسم می توان برای تولید صنعتی آنزیم ال-آسپاراژیناز و نهایتا درمان سرطان استفاده کرد. در شرایط بهینه بدست آمده، تولید ال- آسپاراژیناز تا 2 برابر (7.8 واحد بر میلی لیتر) افزایش یافته است.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

بهینه‌سازی تولید زیستی ایندول استیک اسید از سوبسترای آب پنیر با استفاده از باکتری‌های جداسازی شده از ریزوسفر و فیلوسفر گیاهان

لیلا یگانه؛ سید محمد مهدی محمودی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 26 دی 1400

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.131740.1433

چکیده

مقدمه: ایندول استیک اسید (اکسین ) یک هورمون گیاهی است که علاوه بر گیاهان، توسط تعدادی از باکتری‌ها نیز تولید می شود. هدف از این پژوهش، بهینه سازی تولید ایندول استیک اسید از سوبسترای آب پنیر توسط باکتری‌های ... بیشتر مقدمه: ایندول استیک اسید (اکسین ) یک هورمون گیاهی است که علاوه بر گیاهان، توسط تعدادی از باکتری‌ها نیز تولید می شود. هدف از این پژوهش، بهینه سازی تولید ایندول استیک اسید از سوبسترای آب پنیر توسط باکتری‌های جداسازی شده از ریزوسفر و فیلوسفر گیاهان بود. مواد و روش ها: باکتری‌های مورد نظر، از فیلوسفر و ریزوسفر گیاهان لوبیا سبز، لوبیا چشم بلبلی، نعناع و جعفری جداسازی و خالص‌سازی شدند. توانایی جدایه‌ها جهت رشد در سوبسترای آب پنیر و تولید اکسین مورد ارزیابی قرار گرفت. تاثیر پارامترهای pH و دما بر عملکرد جدایه‌ها بررسی شد. از کشت باکتری در سوبسترای آب پنیر، پودر ناخالص اکسین تهیه شد و عملکرد آن بر میزان رشد بذر گیاهان عدس و ماش مورد بررسی قرار گرفت. نتایج: از ۲۶ نمونه باکتری جداسازی شده، 5 جدایه (2/19 درصد) از توانایی تولید ایندول استیک اسید و رشد در سوبسترای آب پنیر بطور همزمان برخوردار بودند. 2 جدایه با بیشترین قابلیت تولید اکسین، با استفاده از تعین توالی ناحیه16S rDNA شناسایی شدند. یک جدایه به میزان 97 درصد با انتروباکتر سولی و جدایه دیگر به میزان 99 درصد با انتروباکتر موری شباهت داشتند. این جدایه‌ها به ترتیب در دمای ۳۰ و 35 درجه سلسیوس و در pH 7 بیشترین قابلیت تولید اکسین را نشان دادند. آبیاری بذر گیاهان مورد بررسی با محلول‌های اکسین تولیدی، به صورت معنی‌داری در مقایسه با محلول‌های کنترل توانست رشد طولی ساقه این گیاهان را افزایش دهد. بحث و نتیجه‌گیری: سویه‌های مولد اکسین را می‌توان از خاک و گیاهان جداسازی نمود و با استفاده از سوبستراهای ارزان قیمتی همچون آب پنیر می‌توان این هورمون گیاهی را در مقیاس صنعتی تولید و به عنوان محرک رشد گیاهان مورد استفاده قرار داد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

شناسایی ساختار جمعیت دو اندوفیت قارچی Fusarium sp. و .Thielavia sp و فراوانی مکانی-زمانی آن‌ها در بافت‌های مختلف شش گونه گیاه هالوفیت

سهیلا آقائی درگیری؛ داود صمصام پور؛ مجید عسکری سیاهویی؛ عبدالنبی باقری

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 17 بهمن 1400

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.129745.1405

چکیده

مقدمه: به نظر می‌رسد همه گیاهان در اکوسیستم‌های طبیعی با اندوفیت‌های قارچی همزیست هستند. این گروه بسیار متنوع از قارچ‌ها می-توانند از طریق کمک به تحمل تنش غیرزیستی و زیستی، افزایش زیست توده و کاهش مصرف ... بیشتر مقدمه: به نظر می‌رسد همه گیاهان در اکوسیستم‌های طبیعی با اندوفیت‌های قارچی همزیست هستند. این گروه بسیار متنوع از قارچ‌ها می-توانند از طریق کمک به تحمل تنش غیرزیستی و زیستی، افزایش زیست توده و کاهش مصرف آب، یا تغییر در تخصیص منابع، تأثیرات عمیقی بر جوامع گیاهی داشته باشند. مواد و روش‌ها: در این پژوهش بررسی تنوع زیستی مکانی-زمانی اندوفیت‌های قارچی Fusarium sp. وThielavia sp. جداسازی شده از شش گونه گیاه هالوفیت ‌مورد بررسی قرار گرفت. تنوع زیستی مکانی-زمانی دو اندوفیت قارچی مزبور در بافت‌های مختلف گونه‌های گیاهی هالوفیت با استفاد از شاخص‌های سیمپسون، شانون و غنای مارگالف توسط نرم‌افزار PAST ارزیابی شد. برای شناسایی مولکولی قارچ‌ها از آغارگر اختصاصی ITS استفاده شد. نتایج: نتایج نشان داد که بیشترین فراوانی مربوط به اندوفیت قارچی Thielavia sp. به میزان 75/21 درصد در ساقه بود. با بررسی شاخص‌های تنوع سیمپسون، شانون و غنای مارگالف مشخص شد که بیشترین تنوع اندوفیت قارچی برای شاخص‌های مزبور به ترتیب 498/0، 691/0 و 445/0 در ساقه گونه گیاهی Bienertia cycloptera بود. همچنین نتایج شاخص تنوع سیمپسون و شانون نشان داد که بیشترین میزان تنوع اندوفیت قارچی به میزان 500/0 و 693/0 در گونه‌های گیاهی جزیره ابوموسی و برای شاخص غنای مارگالف بیشترین میزان تنوع اندوفیت قارچی 455/0 در بندر سیریک مشاهده شد. بحث و نتیجه‌گیری: نتایج این پژوهش نشان از تنوع بالای مکانی-زمانی دو گونه اندوفیت قارچی مورد نظر در شش گونه گیاهی شورپسند مورد مطالعه دارد. بر اساس این اطلاعات می‌توان نتیجه گیری کرد که تامین اندوفیت از محل‌های جغرافیایی که در آن گونه‌های گیاهی دارای تنوع بالایی هستند، می‌تواند در موفقیت آمیز بودن برنامه کلونیزاسیون گیاهان موثر باشد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

تولید آنتی ژن پلی اپی توپی نوترکیب HPV16-E6 : بررسی اثر سویه ها و شرایط محیطی متفاوت

بهاره بهمنی؛ زهرا امینی بیات؛ محمد مهدی رنجبر؛ ناهید بختیاری؛ امیرحسن زرنانی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 23 اسفند 1400

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2021.130943.1420

چکیده

زمینه و هدف: سرطان دهانه رحم با حدود 528،000 مورد بیمار و 266،000 مرگ در سال، یکی از سرطان های رایج در بین زنان جهان به شمار می رود و عفونت پایدار با ویروس پاپیلومای انسانی ((HPV عامل اصلی آن می باشد. واکسن های مبتنی ... بیشتر زمینه و هدف: سرطان دهانه رحم با حدود 528،000 مورد بیمار و 266،000 مرگ در سال، یکی از سرطان های رایج در بین زنان جهان به شمار می رود و عفونت پایدار با ویروس پاپیلومای انسانی ((HPV عامل اصلی آن می باشد. واکسن های مبتنی بر پپتید مشتق شده از دو پروتئین انکوژن E6 و E7 به علت ایمنی و پایداری بالا و سهولت در تولید، پتانسیل بالایی برای تولید واکسن درمانی HPV نشان داده اند. در این مطالعه اثر سویه های مختلف اشرشیاکلی در کنار پارامترهای محیطی از جمله دما، زمان القایی و غلظت القا کننده بر روی میزان بیان پروتئین پلی اپی توپ نوترکیبHPV16-E6 مورد بررسی قرار می گیرد. روش: در این مطالعه ژن بهینه شده پروتئین نوترکیب E6، در درون وکتور دارای پروموتور T7 کلون شد. وکتور نوترکیب به سویه های اشرشیاکلی BL21(DE3)، BL21(DE3)-AI، Rosetta، C41(DE3)و BL21(DE3)-pLysS ترانسفورم شد و توانایی این سویه ها برای بیان پروتئین نوترکیب مورد نظر درشرایط مختلف محیطی مقایسه شد. بیان پروتئین نوترکیب E6 در سویه های ذکر شده، در دو دمای 25 و 37 درجه سانتی گراد و غلظت های 0.1 و 1.0 میلی مولار از IPTG و زمانهای مختلف انکوباسیون مورد بررسی قرار گرفتند. یافته ها: پس انجام بهینه سازی بیان، شرایط بهینه برای بیان پروتئین نوترکیب E6 به دست آمد. بیشترین میزان بیان در سویه اشرشیاکلی BL21(DE3)-AI و در شرایط Optical Density (OD)=0.9، غلظت 0.1 میلی مولار IPTG، و مدت زمان القای 16 ساعت در دمای 25 درجه سانتی گراد به دست آمد. نتیجه گیری: نتایج به دست آمده از این مطالعه می تواند جهت تولید پروتئین E6، به عنوان کاندید واکسن درمانی در درمان سرطان های مرتبط با HPV مورد استفاده قرار گیرد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- انگلیسی

بررسی تجزیه زیستی متیل ترشیاری بوتیل اتر به وسیله یک سویه جدید Azotobacter vinelandii جدا شده از خاک‌های آلوده شرکت پتروشیمی بندر امام خمینی (ایران)

فاطمه محمودصالح؛ محمد رعایایی اردکانی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 14 فروردین 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.131098.1422

چکیده

مقدمه: متیل ترشیاری بوتیل اتر (MTBE) مکمل اکسیژنی محلول و کم تجزیه پذیری برای سوخت است که می‌تواند به سرعت خاک و آب را آلوده کند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی باکتری‌های تجزیه کننده MTBE از پساب و خاک ... بیشتر مقدمه: متیل ترشیاری بوتیل اتر (MTBE) مکمل اکسیژنی محلول و کم تجزیه پذیری برای سوخت است که می‌تواند به سرعت خاک و آب را آلوده کند. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی باکتری‌های تجزیه کننده MTBE از پساب و خاک پتروشیمی بندر امام خمینی (ایران)، و همچنین یافتن بهترین دما و pH برای تجزیه MTBE انجام شد. مواد و روش‌ها: نمونه ها از خاک آلوده خط تولید MTBE در شرکت پتروشیمی امام خمینی ماهشهر گرفته شد. غنی سازی و جداسازی باکتری‌های تجزیه کننده MTBE در محیط پایه نمکی (BSM) حاوی 50 میلی‌گرم در لیتر MTBE و به دنبال آن افزایش غلظت MTBE تا 400 میلی‌گرم در لیتر طی 5 مرحله غنی سازی انجام شد. فرایند تجزیه MTBE توسط باکتری جدا شده با روش GC ارزیابی شد. جدایه تجزیه کننده MTBE با تکثیر و تعیین توالی ژن S rRNA 16 شناسایی شد. در نهایت، پتانسیل باکتری برای تجزیه MTBE در دماهای مختلف (25-37 درجه سانتی‌گراد) و مقادیرمختلف pH (5/7-5/6) تعیین شد. نتایج: باکتری تجزیه کننده MTBE به عنوان Azotobacter vinelandii شناسایی شد. نتایج تجزیه MTBE نشان داد که این باکتری یک سویه قدرتمند با قابلیت تجزیه 29/91% MTBE در طول 14 روز است. بیشترین تجزیه MTBE توسط باکتری در دمای 30 درجه سانتی‌گراد و 7 pH = بدون تفاوت معنی دار به دست آمد. بحث و نتیجه‌گیری: سویه Azotobacter vinelandii جدا شده در بررسی حاضر توانایی بالایی برای تجزیهMTBE طی 14 روز انکوباسیون، بدون نیاز به افزودن سوبسترای هم تجزیه داشت و برای حذف این آلاینده از اکوسیستم‌های آلوده خاکی پیشنهاد می‌شود.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

بررسی اثر لاکتوفریسین بدست آمده از لاکتوفرین بر روی باکتری های استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا

شیوا سلیمانی؛ سعید زیبائی؛ معصومه انوری

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 30 فروردین 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132468.1445

چکیده

چکیدهمقدمه: لاکتوفریسین، پپتیدی کاتیونی دارای ۲۵ آمینو اسید بوده و در دامین I لوب N لاکتوفرین قرار دارد. این پپتید در مقایسه با لاکتوفرین دارای فعالیت ضدباکتریایی بیشتری می‌باشد. هدف از این مطالعه بررسی ... بیشتر چکیدهمقدمه: لاکتوفریسین، پپتیدی کاتیونی دارای ۲۵ آمینو اسید بوده و در دامین I لوب N لاکتوفرین قرار دارد. این پپتید در مقایسه با لاکتوفرین دارای فعالیت ضدباکتریایی بیشتری می‌باشد. هدف از این مطالعه بررسی اثر لاکتوفریسین بر رشد استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا است.مواد و روش کار: لاکتوفرین پس از جداسازی از شیر شتر، با استفاده از کروماتوگرافی تعویض یونیCM-Sephadex C-50 خالص ‌سازی شد. سپس لاکتوفریسین به روش تغییر یافته Law و Reiter تهیه شده و بررسی پروتئین با الکتروفورز ژل پلی آکریل آمید انجام گردید و اثر ضدباکتریایی غلظت‌های مختلف لاکتوفریسین علیه باکتری‌های استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا بررسی شد.نتایج: براساس نتایج، غلظت ۵ میکرو‌گرم بر میلی‌لیتر لاکتوفریسین، کمترین اثر مهاری را بر روی باکتری‌های مورد مطالعه داشت. همچنین غلظت‌های ۱۵ و ۲۳ میکرو‌گرم بر میلی‌لیتر لاکتوفریسین با قدرت مهارکنندگی 48-26 و 50-42 درصدی به ترتیب بیشترین اثر مهاری را بر روی استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا داشتند.بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج مشخص گردید لاکتوفریسین به طور معنی‌دار و وابسته به دوز بر رشد باکتری‌های استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا اثر مهاری دارد. نتایح نشان می‌دهد که لاکتوفریسین به عنوان یک ماده ضد باکتریایی می‌تواند در انواع برنامه‌های تجاری برای کنترل رشد و بقای بسیاری از عوامل بیماری‌زا مفید باشد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

بهبود تحمل به اتانول سویه صنعتی مخمر با ترکیبی از جهش‌زایی و مهندسی تکاملی

فاطمه شیخی؛ خسرو رستمی؛ مهرداد آذین؛ محمدعلی اسدالهی؛ منصور ابراهیمی؛ پیام غیاثی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 اردیبهشت 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.130167.1411

چکیده

مقدمه: تحمل در برابر اتانول یکی از ویژگی‌های شاخص ساکارومایسس سرویزیه است. افزایش بیشتر تحمل در برابر اتانول در سویه‌های صنعتی مخمر می‌تواند منجر به تخمیر سریعتر، کامل‌تر و افزایش تولید اتانول گردد. ... بیشتر مقدمه: تحمل در برابر اتانول یکی از ویژگی‌های شاخص ساکارومایسس سرویزیه است. افزایش بیشتر تحمل در برابر اتانول در سویه‌های صنعتی مخمر می‌تواند منجر به تخمیر سریعتر، کامل‌تر و افزایش تولید اتانول گردد. با ماهیت پیچیده صفت تحمل اتانول، به نظر می‌رسد که افزایش تحمل اتانول به تغییر چندین ژن مخمر بستگی دارد. روش‌های مختلفی که به تأثیر تغییرات (تصادفی) تولید شده توسط مهندسی تکامل یا جهش‌زایی تکیه می‌کنند، با افزایش تحمل اتانول، ایجاد سویه‌های کارآمد را درپی دارند. مواد و روش‌ها:در تحقیق حاضر برای بهبود فنوتیپ تحمل اتانول، سویه Ethanol Red که سویه صنعتی، به روش فیزیکی و شیمیایی جهش داده شد و جدایه‌های جهش‌یافته با استفاده محیط حاوی 1- بوتانل غربال شدند. جهش‌یافته‌ها همراه با سویه والد اولیه در طی 144 روز با راهبرد مهندسی تکاملی با الکل خو داده شدند و میزان تولید اتانول در سویه‌های منتخب بررسی شد. نتایج: بعد از آزمون‌های تکامل تطبیقی، با توجه به افزایش حداکثر نرخ ویژه رشد، 8 سویه شامل سویه والدی و جهش‌یافته‌ها انتخاب و میزان تولید اتانول آنها بررسی شد. میزان تولید اتانول دو سویه 103ER و106 ER که قبل از انجام آزمون تکامل تطبیقی با اتیل متان سولفونات جهش یافته و سپس به ترتیب در غلظت 11 و 9 درصد (حجم در حجم) اتانول تکامل یافته بودند، به ترتیب 1±45/112 و9/0± 3/112 گرم در لیتر رسید در حالی که این مقدار برای سویه والد 5/0± 44/103 گرم در لیتر بود. بحث و نتیجه گیری: از راهبرد مهندسی تکاملی در ایجاد سویه های توانمند با هدف افزایش تحمل به اتانول در سویه‌های صنعتی بدلیل قابلیت‌های بالای آن استفاده شد. برای افزایش تنوع ژنتیکی جمعیت اولیه، قبل از شروع فرآیند تکامل تطبیقی، از جهش‌زایی با اتیل متان سولفونات استفاده شد که در سرعت بخشیدن به روند تکامل برای دستیابی به بهبود فنوتیپ مورد نظر کارآمدتر از اشعه فرابنفش عمل کرد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

ارزیابی عملکرد و مقادیر پلی ساکارید کل بازیدیوکارپ جدایه های ایرانی قارچ Agrocybe aegerita و Hypsizygus ulmarius تولید شده روی بسترهای مختلف

سکینه حیدری صادق؛ داریوش رمضان؛ مهدی پیرنیا؛ مهدی آران؛ شیراحمد سارانی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.131681.1432

چکیده

مقدمه: بقایای به ظاهر بی ارزش کشاورزی (کلش گندم، تفاله زیتون) و صنعتی (خرده چوب، باگاس نیشکر) حجم بزرگی از مواد زائد را تشکیل می‌دهند و منجر به آلودگی محیط زیست می‌شوند. قارچ‌ها به عنوان مصرف کننده ضایعات ... بیشتر مقدمه: بقایای به ظاهر بی ارزش کشاورزی (کلش گندم، تفاله زیتون) و صنعتی (خرده چوب، باگاس نیشکر) حجم بزرگی از مواد زائد را تشکیل می‌دهند و منجر به آلودگی محیط زیست می‌شوند. قارچ‌ها به عنوان مصرف کننده ضایعات مواد آلی باعث برقراری چرخه بازیافت مواد شده و مشکلات مربوط به آلودگی هوا در اثر سوزاندن این ضایعات را نیز برطرف می‌سازند. مواد و روشها: این پژوهش به صورت طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در مزرعه سد سیستان در سال 1398 انجام شد. تیمارهای آزمایش شامل بسترهای کشت: تراشه چوب، کلش گندم، باگاس نیشکر، باگاس نیشکر + سبوس گندم (90 به 10)، باگاس نیشکر + تفاله زیتون (90 به 10)، تراشه چوب + سبوس گندم (90 به 10)، تراشه چوب + تفاله زیتون (90 به 10)، کلش گندم + تفاله زیتون (90 به 10)، کلش گندم + سبوس گندم (90 به 10) بودند. اسپان قارچ‌های H. ulmarius و A. aegerita تهیه شد و بسترها به وسیله اسپان مایه‌زنی شدند. نتایج: در قارچ H. ulmarius بیشترین میزان عملکرد (54/467 گرم)، وزن خشک (24/50 گرم)، بیشترین میزان پلی‌ساکارید کل (29/12 میلی‌گرم در گرم ماده خشک) اندام میوه‌ای و کم‌ترین زمان (14 روز) برای پنجه‌دوانی میسلیوم و پیش رسی (26 روز) به بستر کشت ترکیبی کلش گندم همراه با سبوس گندم (90 به 10) اختصاص داشت. هم‌چنین در قارچ A. aegerita بیشترین میزان عملکرد (81/72 گرم)، وزن خشک (22/9 گرم)، بیشترین میزان پلی‌ساکارید کل (33/11 میلی‌گرم در گرم ماده خشک) اندام میوه‌ای و کم‌ترین زمان (15 روز) لازم برای کامل شدن پنجه‌دوانی میسلیوم و پیش رسی (29 روز) به بستر کشت ترکیبی تراشه چوب همراه با سبوس گندم (90 به 10) اختصاص داشت. بحث و نتیجه گیری: بستر کشت کلش گندم برای قارچ H. ulmarius و بستر کشت تراشه چوب برای قارچ A. aegerita به عنوان بهترین بستر کشت معرفی می شوند.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

تولید هیدروژن زیستی توسط میکروارگانیسم‌ها و آنزیم‌های خارج سلولی: انرژی پاک

مهلا باقری؛ گیتی امتیازی؛ مریم جلیلی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.131554.1428

چکیده

مقدمه: گاز هیدروژن به عنوان یک منبع انرژی تجدید پذیر پتانسیل بالایی دارد. اگرچه گاز هیدروژن از سوخت‌های فسیلی به‌دست می‌آید، اما تقاضا برای تولید آن با روش‌های شیمیایی و الکترولیز آب وجود دارد و امروزه ... بیشتر مقدمه: گاز هیدروژن به عنوان یک منبع انرژی تجدید پذیر پتانسیل بالایی دارد. اگرچه گاز هیدروژن از سوخت‌های فسیلی به‌دست می‌آید، اما تقاضا برای تولید آن با روش‌های شیمیایی و الکترولیز آب وجود دارد و امروزه استخراج آن از ماسه‌های نفتی در حال مطالعه است. تولید آن از طریق زیستی به دلیل مصرف گازهای گلخانه‌ای مانند دی‌اکسید‌کربن و/یا تخمیر هوازی و بی‌هوازی پسماندهای کشاورزی یکی از پاک‌ترین انواع تولید سوخت هیدروژنی است و می‌توان آن را راه حلی برای تولید همزمان سوخت و رفع آلودگی‌های زیست‌محیطی دانست. روش: این مقاله به‌طور خلاصه به بررسی میکروارگانیسم‌های تولید‌کننده هیدروژن، مکانیسم‌های تولید و آنزیم‌های موثر پرداخته است. برای این هدف از اطلاعات موجود در پایگاه داده‌های اسکوپوس برای رسم نمودارها و از مقالات معتبر منتشر شده در فاصله زمانی 2006 تا 2021 استفاده شده است. علاوه بر این، برخی از محدودیت‌ها و راه‌های غلبه بر آن‌ها و افزایش تولید هیدروژن زیستی با استفاده از مقالات به‌تفصیل شرح داده شده است. نتایج: تثبیت دی‌اکسید‌کربن، تخمیر، تثبیت نیتروژن، فتوسنتز هوازی و بی‌هوازی از راه‌های تولید زیستی این سوخت است. آنچه در تولید زیستی اهمیت دارد، آنزیم‌های موثر در این واکنش‌ها و امکان استفاده از این آنزیم‌ها در تولید مداوم گاز و تصفیه هیدروژن از گازهای دیگر است. تثبیت این آنزیم‌ها در شرایط خاص خودشان برای تولید انبوه این گاز از اهمیت خاصی برخوردار است. خالص‌سازی گاز هیدروژن تولید شده زیستی به هدف مصرف آن به عنوان سوخت، ضروری است و برخی فناوری‌ها از جمله غشاهای نانو مانند پلی‌سولفونات در خالص‌سازی این گاز از گازهای تولیدی دیگر مانند اکسیژن، ازت، آمونیوم، هیدروژن سولفید و اکسیژن بسیار کمک‌کننده است.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

زیست توده های لیگنوسلولزی: منابعی تجدیدپذیر برای تولید اتانول زیستی

سارا تولایی؛ شراره حریرچی؛ زهرا اعتمادی فر؛ محمد طاهرزاده

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.131065.1425

چکیده

مقدمه: سوخت‌های فسیلی به دلیل آلودگی‌های فراوانی که درمحیط ایجاد می‌کنند، جان انسان‌ها و دیگر موجودات کره زمین را تهدید می‌کنند. با وجود تغییرات اقلیمی و آلودگی‌های فراوان، تعداد قابل توجهی از کشورهای ... بیشتر مقدمه: سوخت‌های فسیلی به دلیل آلودگی‌های فراوانی که درمحیط ایجاد می‌کنند، جان انسان‌ها و دیگر موجودات کره زمین را تهدید می‌کنند. با وجود تغییرات اقلیمی و آلودگی‌های فراوان، تعداد قابل توجهی از کشورهای جهان هنوز از این سوخت‌های آلاینده استفاده می‌کنند. بنابراین، یافتن سوخت‌های جایگزین و پاک دغدغه‌ی بسیاری از پژوهشگران است. یکی از متداول‌ترین این سوخت‌ها، اتانول است که به‌علت گروه‌های هیدروکسیل بیشتر و نداشتن گوگرد و نیتروژن در ساختار خود، تمیزتر می‌سوزد که هم به روش شیمیایی و هم به روش زیستی قابل حصول است. تاکنون چهار نسل از اتانول زیستی معرفی شده که تولید آن از ترکیبات لیگنوسلولزی تحت عنوان نسل دوم شناخته می‌شود. این ترکیبات شامل زیست توده کشاورزی یا صنعتی هستند که از نظر زیست محیطی پایدار و از نظر اقتصادی مقرون به صرفه هستند. روش جستجو: رویکرد کلی این مقاله به صورت مقاله مروری روایتی بوده و تا حد امکان در جستجوی مطالب رویکرد جستجوی منطقی در پیش گرفته شد. در جمع‌بندی و تجزیه و تحلیل نهایی اطلاعات سعی شد در هر بخش از رویکرد مقایسه‌ای بین روش‌های مختلف بیان شده، استفاده گردد. بحث و نتیجه‌گیری: از میان چهار نسل‌ موجود، نسل دوم اتانول زیستی، از جهت عدم رقابت با غذای انسان و قابلیت صنعتی شدن بیشتری که نسبت به نسل سوم و چهارم دارد، مورد توجه ویژه‌ای قرار گرفته است. در نتیجه، بررسی دقیق فرآیند تولید اتانول زیستی نسل دوم از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. شناخت درست اجزای ترکیبات لیگنوسلولزی، بهینه‌سازی روش‌های پیش‌تیمار و یافتن روش هیدرولیز و تخمیر با بازده‌ی بالا از جمله مواردی است که باید به دقت مورد بررسی قرار گیرد تا این فرآیند را به لحاظ صنعتی مقرون به صرفه نماید. با وجود پژوهش‌های گسترده‌ای که برای انتخاب مناسب‌ترین میکروارگانیسم در مرحله‌ی تخمیر انجام شده، همچنان ساکارومایسس سرویزیه و زایموموناس موبیلیس در صدر بررسی‌ها قرار دارند.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

ارزیابی مولکولی رونویسی ژن icaA تحت تیمار ریفامپین و عصاره سیر در استافیلوکوکوس اورئوس

زهرا ابراهیمی شکرباغانی؛ هادی حبیب االهی؛ محمد رضا صفری مطلق

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 18 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132045.1436

چکیده

مقدمه: ریفامپین یک آنتی‌بیوتیک با طیف گسترده است و سیر نیز به دلیل داشتن ماده مؤثره آلیسین دارای اثرات ضد میکروبی مطلوبی است. در این پژوهش، اثر ضدمیکروبی عصاره سیر در سطح فنوتیپی و مولکولی و تأثیر آن ... بیشتر مقدمه: ریفامپین یک آنتی‌بیوتیک با طیف گسترده است و سیر نیز به دلیل داشتن ماده مؤثره آلیسین دارای اثرات ضد میکروبی مطلوبی است. در این پژوهش، اثر ضدمیکروبی عصاره سیر در سطح فنوتیپی و مولکولی و تأثیر آن بر میزان بیان ژن بیوفیلم icaA و مقایسه آن با آنتی‌بیوتیک ریفامپین مورد بررسی قرار گرفت.مواد و روش‌ها: آزمون‌های آنتی‌بیوگرام، حداقل غلظت مهاری و حداقل غلظت کشندگی با آنتی‌بیوتیک ریفامپین و عصاره سیر صورت گرفت. آزمون فنوتیپی بیوفیلم نیز با میکروپلیت 96 چاهکی انجام شد. پس از استخراج RNA از نمونه‌های تیمار شده با ریفامپین و عصاره سیر، سنتز cDNA و Real time PCR صورت گرفت و میزان بیان ژن icaA سنجیده شد.نتایج: آزمون آنتی‌بیوگرام، اثر ضدمیکروبی عصاره سیر را حداقل در مورد سویه استاندارد و یکی از سویه‌های بیماری‌زا به اثبات رساند به طوری‌که این تأثیر در مقایسه با ریفامپین قابل توجه بود. نتایج حداقل غلظت مهاری (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MBC) در مورد هر سه سویه برای ریفامپین و ترکیب توأم ریفامپین و گارسین به ترتیب 375 و 750 میکروگرم بر میلی‌لیتر تعیین شد. نتایج Real time PCR نشان داد که در همه سویه‌های مورد مطالعه، عصاره سیر و ریفامپین قادر به کاهش بیان ژن icaA هستند و استفاده توأم این دو ماده منجر به کاهش چشمگیر بیان این ژن گردید. در مورد سویه استاندارد، ریفامپین و عصاره سیر به ترتیب بیان icaA را به 88% و 60% نمونه کنترل کاهش دادند و ترکیب این دو ماده با یکدیگر منجر به کاهش حدود 50 درصدی بیان ژن بیوفیلم icaA شد.بحث و نتیجه‌گیری: در یک جمع‌بندی کلی می‌توان چنین استنباط نمود که آنتی‌بیوتیک ریفامپین می‌تواند بر مهار باکتری‌های بیماری‌زایی همچون استافیلوکوکوس اورئوس، مؤثر باشد. همچنین عصاره سیر هم در سطح فنوتیپی و هم در سطح مولکولی می‌تواند به عنوان داروی ضد این باکتری مورد استفاده قرار گیرد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

ارزیابی توان مخمر بومی یاروویا لیپولیتیکا به‌عنوان منبع زیستی ایمن در سنتز نانوذره‌ی سلنیوم

مراحم آشنگرف؛ زینب خسروی شادمان

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 23 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132627.1450

چکیده

مقدمه: در بین نانوذرات فلزی، نانوذره‌ی سلنیوم عنصری از یک سو سمیت کمی دارد و از سوی دیگر، عنصری حیاتی برای بدن انسان است و به همین دلیل اهمیت ویژه‌ای دارد. مخمر یاروویا لیپولیتیکا به ‌دلیل داشتن آنزیم‌های ... بیشتر مقدمه: در بین نانوذرات فلزی، نانوذره‌ی سلنیوم عنصری از یک سو سمیت کمی دارد و از سوی دیگر، عنصری حیاتی برای بدن انسان است و به همین دلیل اهمیت ویژه‌ای دارد. مخمر یاروویا لیپولیتیکا به ‌دلیل داشتن آنزیم‌های ردوکتازی، توانایی تجمع و سمیت‌زدایی فلزات سنگین را دارا بوده و قابلیت کاهش نمک‌های فلزی به نانوذراتی با اندازه باریک و پراکندگی کمتر را دارد. هدف از این پژوهش استفاده از مخمر بومی یاروویا لیپولیتیکا سویه MP10 به‌عنوان منبع زیستی ایمن برای سنتز انوذره‌ی سلنیوم بود. مواد و روش: از روش رقت در آگار برای تعیین الگوی مقاومت مخمر یاروویا لیپولیتیکا سویه MP10 نسبت به اکسی آنیون سلنیت استفاده شد. بررسی سنتز نانوذرات سلنیوم تحت استراتژی سلول در حال استراحت انجام شد. اثر غلظت‌های اکسی آنیون سلنیت بر روی نرخ سنتز نانوذرات سلنیوم و همچنین اثر دوره‌ی گرماگذاری بر روی اندازه و پراکندگی نانوذرات سلنیوم در مخلوط واکنش زی تبدیلی بررسی شد. نانوذرات سلنیوم سنتز شده به وسیله‌ی تصاویر به‌دست‌آمده از آنالیز میکروسکوپ الکترونی رویشی (SEM)، طیف‌سنجی پراش پرتو ایکس (EDX)، پراش اشعه ایکس (XRD) و طیف‌سنجی مادون‌قرمز (FTIR) تعیین خصوصیت شدند. نتایج: براساس نتایج به‌دست‌آمده مخمر یاروویا لیپولیتیکا سویه MP10 قابلیت تحمل‌پذیری 10 میلی‌مولار اکسی آنیون سلنیت را دارا بود. سویه مخمری مذکور در شرایط بهینه 4 میلی مولار غلظت اکسی آنیون سلنیت و پس از 24 ساعت گرماگذاری قابلیت سنتز نانوذرات سلنیوم کروی با میانگین اندازه 70 نانومتر را دارا بود. با افزایش زمان گرماگذاری، نانوذرات کروی شکل سلنیوم به یکدیگر نزدیک‌تر و از پراکندگی آن‌ها کاسته شده است و میانگین اندازه‌ی نانوذرات به 117 نانومتر بعد از 72 ساعت افزایش یافت. بحث و نتیجه گیری: پژوهش حاضر گزارشی از عملکرد مخمر بومی یاروویا لیپولیتیکا در سنتز موفقیت آمیز نانوذره‌ی سلنیوم عنصری تحت استراتژی سلول در حال استراحت و بهبود پراکندگی و اندازه‌ی نانوذرات تحت شرایط بهینه زمان گرماگذاری بود.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

اثر ضد میکروبی نانوذرات اکسید ساماریوم سنتز شده با کورکومین روی سودوموناس آئروژینوزا و استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم چند دارویی

حسین زحمتکش زکریایی؛ میرساسان میرپور؛ حجت اله زمانی؛ بهنام راستی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 23 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132621.1449

چکیده

مقدمه: استفاده از فناوری نانو در زمینه‌های مختلف زیست پزشکی و دارویی به سرعت در حال گسترش می‌باشد. هدف از این مطالعه سنتز زیستی نانوذرات اکسید ساماریوم با استفاده از کورکومین و بررسی اثرات ضد میکروبی ... بیشتر مقدمه: استفاده از فناوری نانو در زمینه‌های مختلف زیست پزشکی و دارویی به سرعت در حال گسترش می‌باشد. هدف از این مطالعه سنتز زیستی نانوذرات اکسید ساماریوم با استفاده از کورکومین و بررسی اثرات ضد میکروبی آن می‌باشد.مواد و روش ها: در این پژوهش، از کورکومین به عنوان عامل احیا کننده جهت سنتز نانوذرات اکسید ساماریوم استفاده شد. نانوذرات سنتز شده با استفاده از روش‌های میکروسکوپ الکترونی عبوری (TEM)، پراش اشعه ایکس (XRD)، پراش انرژی پرتو ایکس (EDX)، پراش دینامیک نور (DLS) و آزمون پتانسیل زتا مورد بررسی قرار گرفتند. اثرات ضد میکروبی نانوذرات اکسید ساماریوم علیه سویه‌های بالینی و استاندارد سودوموناس آئروژینوزا PTCC 1430 و استافیلوکوکوس اورئوس PTCC 1431 با روش‌های انتشار از دیسک و کمترین غلظت مهارکنندگی (MIC) و کمترین غلظت کشندگی (MBC) مورد بررسی قرار گرفت. همچنین اثر نانوذرات بر تولید فاکتورهای بیماری‌زایی رنگدانه پیوسیانین و آلژینات در سودوموناس آئروژینوزا بررسی شد.نتایج: بررسی نانوذرات اکسید ساماریوم سنتز شده نشان داد که نانوذرات دارای ساختار مکعبی با اندازه متوسط 61/32 نانومتر و فاز کریستالی خالص هستند. همچنین آنالیز DLS و پتانسیل زتا نشان داد که نانوذرات تولیدی به طور متوسط دارای قطرnm 90 و بار mV 4/9- هستند. نتایج حاصل از تست انتشار از دیسک، اثر بخشی بالای نانوذرات اکسید ساماریوم علیه باکتری‌های مورد مطالعه را نشان داد. بر اساس روش میکرودایلوشن براث، کمترین مقدار MIC برای سویه استاندارد استافیلوکوکوس اورئوس و بیشترین مقدار MIC برای سویه بالینی سودوموناس آئروژینوزا به ترتیب با غلظت های 12/3 و 25 میکروگرم در میلی لیتر بدست آمد. همچنین بررسی اثر نانوذرات بر تولید پیوسیانین و آلژینات، نتایج امیدوار کننده‌ای را نشان داد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

غربالگری و شناسایی مولکولی استرپتومیست بومی تولید کننده نانو ذرات اکسید منگنز از خاک معدن منگنز قم

عطیه سادات حسینی انواری؛ سید سهیل آقایی؛ محمد رضا زند منفرد

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 23 خرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132179.1442

چکیده

مقدمه: نانو ذرات اکسید منگنز به دلایل اقتصادی و داشتن خصوصیات فیزیکی و شیمیایی خاص، به عنوان ماده استراتژیک در صنایع مختلف مانند باتری سازی، تصفیه آب و فاضلاب، صنایع دارویی و غیره کاربرد دارد. تولید نانو ... بیشتر مقدمه: نانو ذرات اکسید منگنز به دلایل اقتصادی و داشتن خصوصیات فیزیکی و شیمیایی خاص، به عنوان ماده استراتژیک در صنایع مختلف مانند باتری سازی، تصفیه آب و فاضلاب، صنایع دارویی و غیره کاربرد دارد. تولید نانو ذرات اکسید منگنز جزء متابولیت‌های ثانویه در باکتری‌ها می‌باشد و با توجه به اینکه معدن منگنز ونارچ استان قم، یکی از مهمترین منابع تامین کننده منگنز برای میکروارگانیسم‌های اکسید کننده منگنز می‌باشد، این پروژه برای اولین بار روی خاک‌های این معدن انجام گرفت. مواد و روش‌ها: تعداد 100 نمونه خاک از مناطق مختلف معدن منگنز جمع آوری و در محیط غنی کننده انتخابی K تلقیح و در انکوباتور شیکر دار گرماگذاری گردید. سویه‌های بدست آمده از کشت در محیط حاوی منگنز توسط آزمایش بنزدین برای ارزیابی توانایی اکسیداسیون منگنز بررسی شدند و ویژگی‌های نانو ذرات اکسید منگنز از جمله مورفولوژی، اندازه و ساختار شیمیایی آن توسط تکنیک‌های تاییدی از جمله (UV-VIS، FTIR، XRD، FESEM، TEM) تعیین شد. با استفاده از نمودار هیستوگرام FESEM اندازه نانو ذرات در محدوده 10 نانومتر مشخص شد و سویه منتخب شناسایی مولکولی شد. نتایج: برای اولین بار یک سویه اکتینومیست بومی با توانایی اکسیداسیون منگنز و تولید نانو ذرات به صورت خارج سلولی از معدن منگنز ونارچ قم جدا سازی و شناسایی بیوشیمیایی و مولکولی شد. سویه مورد نظر بعد از شناسایی مولکولی با نام Streptomyces xantholiticus HA98 و کد شناسایی OM669940 در سایت NCBI ثبت شد. بحث و نتیجه گیری: باتوجه به اهمیت نانو ذرات اکسید منگنز در مصارف پزشکی و صنعتی و دارویی و این که معدن منگنز ونارچ قم منبع بسیار مهمی برای میکروارگانیسم‌های اکسیدکننده منگنز می‌باشد، این پژوهش برای اولین بار در ایران روی خاک‌های این معدن انجام گرفت تا میکروارگانیسمی با خواص فوق شناسایی شود و از آن در صنایع مختلف استفاده شود.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

جذب زیستی و بیوسنتز نانوذرات سرب توسط باسیلوس تروپیکوس جدا شده از خاک‌های حاوی پسماندهای الکترونیکی در اصفهان

فاطمه معینی؛ منیر دودی؛ زرین دخت امامی کرونی؛ مسعود فولادگر

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 12 تیر 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.131079.1423

چکیده

مقدمه: پسماندهای الکترونیکی بدون پردازش در خاک دفن میشوند و حاوی سرب، یکی از فلزات سنگین میباشند که در صورت عدم پردازش صحیح در خاک جمع شده باعث ایجاد سمیت میشود . بنابراین هدف از این مطالعه بررسی جذب زیستی ... بیشتر مقدمه: پسماندهای الکترونیکی بدون پردازش در خاک دفن میشوند و حاوی سرب، یکی از فلزات سنگین میباشند که در صورت عدم پردازش صحیح در خاک جمع شده باعث ایجاد سمیت میشود . بنابراین هدف از این مطالعه بررسی جذب زیستی سرب توسط باسیلوس تروپیکوس جدا شده از خاکهای حاوی پسماندهای الکترونیکی در اصفهان بود. مواد و روش‌ها: در این مطالعه مقطعی، نمونه‌گیری از خاکهای آلوده چندین منطقه از تپه‌های گردنه زینل اصفهان انجام شد و پس از اندازه‌گیری دما، pH، TOC و میزان فلزات در نمونه ها، جداسازی باکتریهای‌ مقاوم به سرب انجام و میزان رشد باکتریها در غلظتهای 5 تا 35 میلی‌مولار سرب بررسی شد، سپس حداقل غلظت ممانعت کننده از رشد (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MBC) تعیین گردید. بررسی مورفولوژی، آنتی بیوگرام و شناسایی مولکولی باکتری‌ مورد نظر به روش کلنی-واکنش زنجیره‌ای پلیمراز انجام و جذب زیستی باکتری با ICP-OES ارزیابی شد. در نهایت بمنظور ارزیابی ساخت نانوذرات سرب الگوی XRD، تصاویر SEM و EDS سنجش شد. داده‌های خام با نرم‌افزار SPSS و آزمون آماری Independent t-test ارزیابی شد. نتایج: براساس یافته‌ها ، pH خاک مورد ارزیابی 4/9، دمای آن Cͦ 8/27، TOC 8/1 % و میزان سرب خاک بر اساس آنالیز ICP-OES برابرppm 4/658 سنجش شد . سویه باکتریایی دارای 99% قرابت ژنتیکی با باسیلوس تروپیکوس بود که توان حذف زیستی بالایی (37/56 %) نسبت به سرب را داشت. نتایج الگوی XRD، SEM و EDS حاکی از تبدیل فلز سرب جذب‌شده به نانوذره بود.. بحث و نتیجه‌گیری: با توجه باینکه باسیلوس تروپیکوس مقاومت و جذب بالایی را نسبت به سرب از خود نشان داد، میتواند در آینده پس از حذف ژنهای مقاومت آنتی بیوتیکی گزینه مناسبی برای حذف زیستی این فلز از پسماندهای الکترونیکی و سایر پسماندهای صنعتی باشد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- انگلیسی

تاثیر فرمولاسیون ارزان قیمت کود زیستی تهیه شده از سودوموناس پوتیدا سویه PT و مکمل‌های غذایی بر صفات رویشی ریحان

زهرا اعتمادی فر؛ مریم مرادی؛ محمد ربانی خوراسگانی؛ ساناز خاشعی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 06 مرداد 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132813.1457

چکیده

مقدمه: در سال های اخیر تقاضای جهانی برای محصولات کشاورزی افزایش یافته است. یکی از روش‌های افزایش میزان محصولات همراه با کاهش مصرف کودهای شیمیایی، استفاده از کودهای زیستی است. هدف از مطالعه حاضر تولید ... بیشتر مقدمه: در سال های اخیر تقاضای جهانی برای محصولات کشاورزی افزایش یافته است. یکی از روش‌های افزایش میزان محصولات همراه با کاهش مصرف کودهای شیمیایی، استفاده از کودهای زیستی است. هدف از مطالعه حاضر تولید یک فرمول کم هزینه از کود زیستی تهیه شده از سودوموناس پوتیدا سویه PT است. مواد و روش‌ها: ویژگی‌های مختلف محرک رشد گیاه سودوموناس پوتیدا سویه PT مانند محلول‌سازی فسفر، تثبیت نیتروژن و تولید ایندول-3-استیک اسید با استفاده از محیط Pikovskaya’s (PVK)، معرف سالکوفسکی و محیط فاقد نیتروژن، مورد سنجش قرار گرفت. اثر سوبستراهای کم هزینه برای تهیه کود زیستی ارزان قیمت با اندازه‌گیری وزن خشک باکتری مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. کود زیستی به روش غوطه‌وری بذر تهیه شد و آزمایش‌‌عای گلدانی با استفاده از کود زیستی تهیه شده از سودوموناس پوتیدا سویه PTو مکمل‌های غذایی انجام شد. اثر تیمارهای مختلف بر رشد و نمو گیاه Ocimum basilicum (ریحان) با اندازه‌گیری طول ریشه و اندام‌های هوایی، وزن تر اندام‌های هوایی و وزن خشک اندام‌های هوایی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج : سودوموناس پوتیدا سویه PT قابلیت محلول‌سازی فسفات (OD430nm = 1.1)، تولید(OD530nm = 0.86) IAA و تثبیت نیتروژن را نشان داد. بالاترین زیست توده باکتریایی در حضور آب پنیر و به دنبال آن ملاس با درجه بریکس 2.5 همراه با آمونیوم سولفات مشاهده شد. کود زیستی تهیه شده از این باکتری به ویژه در صورت استفاده با فسفات نامحلول، رشد گیاه را به طور قابل توجهی افزایش داد. افزودن کود زیستی و فسفات نامحلول به ترتیب باعث افزایش 6/41، 7/83 و 25 درصدی طول اندام‌های هوایی، وزن تر اندام‌های هوایی و وزن خشک اندام‌های هوایی نسبت به گیاهان شاهد تیمار نشده شد. بحث و نتیجه گیری: نتایج نشان می‌دهد که سودوموناس پوتیدا سویه PT می ‌تواند برای تهیه کود زیستی مقرون به صرفه جهت افزایش رشد گیاه مورد استفاده قرار گیرد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

بررسی ساختار و عملکرد پروتئین اسپایک کروناویروس سندرم حاد تنفسی ۲ (SARS-CoV-2) با داکینگ مولکولی

نوید محمدجانی؛ مراحم آشنگرف؛ فرشاد درویشی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 02 شهریور 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.133412.1468

چکیده

مقدمه: بیش از دو سال از شیوع سندرم حاد تنفسی ویروس کرونا 2 (SARS-CoV-2) در ووهان چین می گذرد. SARS-CoV-2 یک پاندمی بی سابقه (COVID-19) در عصر مدرن ایجاد کرده و تمام ساختارهای علمی، اقتصادی و اجتماعی جهان را به چالش کشیده ... بیشتر مقدمه: بیش از دو سال از شیوع سندرم حاد تنفسی ویروس کرونا 2 (SARS-CoV-2) در ووهان چین می گذرد. SARS-CoV-2 یک پاندمی بی سابقه (COVID-19) در عصر مدرن ایجاد کرده و تمام ساختارهای علمی، اقتصادی و اجتماعی جهان را به چالش کشیده است. با توجه به اهمیت فراوان پروتئین اسپایک SARS-CoV-2، سعی شد در این مطالعه ساختار و تعامل آن با گیرنده‌های سلولی با استفاده از ابزار بیوانفورماتیک بررسی شود. علاوه بر این، اثر داروها و واکسن‌های موجود بر وارینت های مختلف SARS-CoV-2 بررسی شد. مواد و روش‌ها: روش‌های بیوانفورماتیک و داکینگ مولکولی برای مطالعه عملکرد اتصال پروتئین اسپایک به گیرنده‌های سلولی مختلف آن در بدن انسان مورد استفاده قرار گرفت. برای انجام فرآیند داکینگ مولکولی از وب سرور HDOCK و در مرحله بعد از وب سرور PDBsum برای بررسی های پس از داکینگ و اطمینان از صحت داده های به دست آمده استفاده شد. همچنین از نرم افزار PyMOL برای مطالعه و تجسم جهش های جایگزین و حذف در پروتئین اسپایک استفاده شد. نتایج: داده‌های حاصل از جهش‌های گسترده در پروتئین اسپایک واریانت اومیکرون نشان دهنده نوعی بازطراحی دوباره پروتئین اسپایک بود. این جهش‌های وسیع، تغییرات گسترده‌ای در ساختار و عملکرد پروتئین اسپایک به همراه دارد. بر اساس داده‌های حاصل از داکینگ مولکولی و مقایسه میزان سطح انرژی (امتیاز داکینگ) اتصال پروتئین اسپایک واریانت‌های مختلف ویروس با گیرنده‌های مختلف، نشان از بالا بودن تمایل اتصال - با سطح انرژی پایین‌‌تر و پایدارتر پروتئین اسپایک - با گیرنده KREMEN1 نسبت به گیرنده اصلی ACE2 دارد. بحث و نتیجه گیری: تفاوت زیادی در تمایل اتصال پروتئین اسپایک واریانت‌های نوظهور و مهم ویروس (اصلی، آلفا، دلتا و اومیکرون) با گیرنده ACE2 وجود ندارد اما میزان تمایل اتصال به گیرنده KREMEN1 رو به افزایش است و در واریانت دلتا به اوج خود رسیده است.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

بررسی اثر سینرژیستی پروتئین‏های نوترکیب درماسپتین B1 و اسانس گیاه پونه علیه باکتری‌های بیماری‌زا گرم منفی گیاهی با استفاده از شاخص غلظت مهاری نسبی(FIC)

حسین میرزایی؛ میترا خادمی؛ فرهاد نظریان فیروزابادی؛ فاطمه دریکوند

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 08 شهریور 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.132629.1451

چکیده

مقدمه: با توجه به افزایش نگرانی به مقاومت باکتری‌ها به انواع آنتی‌بیوتیک‌های رایج، لازم است تا دارو‌های جدیدی جهت درمان بیماری‌های باکتریایی عرضه شود. بنابراین تلاش فراوان برای یافتن ترکیبات ضدمیکروبی ... بیشتر مقدمه: با توجه به افزایش نگرانی به مقاومت باکتری‌ها به انواع آنتی‌بیوتیک‌های رایج، لازم است تا دارو‌های جدیدی جهت درمان بیماری‌های باکتریایی عرضه شود. بنابراین تلاش فراوان برای یافتن ترکیبات ضدمیکروبی با مکانیسم عمل‌ متنوع ممانعت از رشد باکتری باید صورت گیرد. بنابراین درمان ترکیبی شامل آنتی‌بیوتیک‌های فعلی و سایر مولکول‌های بیولوژیکی یا شیمیایی ممکن است راهکار جدید و کارامدتری باشد. مواد و روش‎ها: در مطالعه حاضر فعالیت ضدباکتریایی سینرژیستی پپتید نوترکیب درماسپتین B1 جدا شده از گیاهان توتون تراریخت در حالت منفرد و ترکیبی با اسانس گیاه پونه علیه پنج باکتری‌های زانتوموناس ترانس لوسنس، زانتوموناس پرفورانس، زانتوموناس سیتری، زانتوموناس گاردنری و سودوموناس سرینگه پتوار سرینگه با استفاده از شاخص غلظت بازدازنده افتراقی (FIC) در غلظت‌های مختلف بررسی شد. نتایج: نتایج نشان داد که حداقل غلظت بازدارندگی پپتید‌های نوترکیب درماسپتین B1 و اسانس پونه علیه باکتری‌ها نشان دهنده کاهش میزان اثر پپتیدهای نوترکیب50 میکروگرم بر میلی لیتر و برای اسانس 6/4 میکروگرم بر میلی لیتر بود. محاسبه غلظت بازدارنده افتراقی (FIC شاخص) حاکی از اثرات هم افزایی با 49/0 FIC=اسانس پونه با پپتید‌های نوترکیب علیه باکتری‌ها بود. بحث و نتیجه‎گیری: نتایج این بررسی پیشنهاد می‌کند که پپتید‌های نوترکیب درماسپتین B1 می‌توانند به تنهایی یا در ترکیب با اسانس پونه برای کنترل بیماری‌های باکتریایی موثر می‌باشد، با این حال به نظر می‌رسد که بین پروتئین‌های نوترکیب و مواد موثره گیاه پونه ارتباط سینرژیتیکی وجود دارد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- فارسی

اثرات سمیت سلولی عصاره سیتوپلاسمی لاکتوباسیلوس جدا شده از محصولات لبنی استان گیلان بر روی رده سلولی سرطان روده بزرگ (HT-29)

نسیم پاداشت؛ خسرو عیسی زاده؛ مرجان شاه ایلی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 14 شهریور 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.133373.1466

چکیده

مقدمه: باکتری‌های پروبیوتیک از جمله لاکتوباسیلوس‌ها به عنوان یکی از عوامل پیشگیری از ابتلا به بسیاری از سرطان‌ها شناخته شده‌اند. هدف از این مطالعه بررسی اثرات ضد سرطانی عصاره سیتوپلاسمی لاکتوباسیوس ... بیشتر مقدمه: باکتری‌های پروبیوتیک از جمله لاکتوباسیلوس‌ها به عنوان یکی از عوامل پیشگیری از ابتلا به بسیاری از سرطان‌ها شناخته شده‌اند. هدف از این مطالعه بررسی اثرات ضد سرطانی عصاره سیتوپلاسمی لاکتوباسیوس جدا شده از محصولات لبنی استان گیلان بر رده سلولی سرطان روده بزرگ HT-29 می‌باشد. مواد و روش ها: در این مطالعه باکتری‌های لاکتوباسیلوس توسط روش‌های متداول کشت و بر اساس ویژگی‌های بیوشیمیایی از محصولات لبنی جداسازی و شناسایی شدند. سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، ژن 16S rRNA باکتری‌ها تکثیر شد و نمونه‌های مورد تایید پس از تعیین توالی، با توالی‌های موجود در NCBI مقایسه گردیدند. غلظت‌های مختلف 5/0، 75/0، 1، 5/1 و 2 میلی‌گرم/میلی‌لیتر از عصاره سیتوپلاسمی سویه منتخب ساخته شد. در نهایت اثرات سمیت سلولی عصاره سیتوپلاسمی لاکتوباسیلوس بر رده سلولی سرطانی HT-29 و سالم HUVEC توسط روش MTT بررسی شد. نتایج: نتایج تست MTT بیانگر آن بود که عصاره سیتوپلاسمی لاکتوباسیلوس به صورت وابسته به دوز، بقا و تکثیر سلول‌های سرطانی روده بزرگ را در مدت زمان 24 ساعت کاهش می‌دهد که بیشترین اثر مهاری مربوط به غلظت 2 میلی‌گرم/میلی‌لیتر بود. غلظت‌های 1، 5/1 و 2 میلی‌گرم بر میلی‌لیتر، زنده‌مانی سلول‌ها را به ترتیب 87/4±50، 8.61±40 و 80/5±25 درصد کاهش دادند. همچنین میزان IC50 عصاره سیتوپلاسمی بر رده سلولی HT29 معادل 43/1 میلی‌گرم/ میلی‌لیتر بدست آمد. همچنین اثرات سایتوتوکسیک بر رده سلولی نرمال HUVEC مشاهده نشد. بحث و نتیجه گیری: بر اساس نتایج، عصاره سیتوپلاسمی لاکتوباسیلوس جدا شده از محصولات لبنی موجب کاهش رشد سلول‌های سرطانی HT-29 شد که با انجام مطالعات بیشتر می‌تواند به عنوان یک محصول بیولوژیک در درمان و پیشگیری از سرطان روده بزرگ مورد استفاده قرار گیرد .

مشاهده مقاله

پژوهشی- انگلیسی

بهینه سازی تولید اگزوپلی ساکارید سنتز شده توسط Lacticaseibacillus paracasei AS20(1) و پتانسیل آن به عنوان عامل ضدبیوفیلمی و ضد سرطانی

الهه امینی؛ فاطمه سلیمی؛ سمیه ایمان پرست

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 04 مهر 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.133302.1465

چکیده

مقدمه: اگزوپلی ساکاریدهای (EPSs) سنتز شده توسط باکتری‌های اسید لاکتیک پلی‌ ساکاریدهایی با فعالیت‌های درمانی متنوع هستند. EPSs به دلیل ایمن بودن می‌توانند در تهیه غذاهای فراسودمند به کار گرفته شوند. مصرف ... بیشتر مقدمه: اگزوپلی ساکاریدهای (EPSs) سنتز شده توسط باکتری‌های اسید لاکتیک پلی‌ ساکاریدهایی با فعالیت‌های درمانی متنوع هستند. EPSs به دلیل ایمن بودن می‌توانند در تهیه غذاهای فراسودمند به کار گرفته شوند. مصرف این محصولات می‌تواند راهکاری نوید بخش به منظور جلوگیری از بیماری‌های مهلک و مقاوم به درمان همانند سرطان و عفونت‌های بواسطه‌ی بیوفیلم‌های میکربی به کار گرفته شود. با این حال، راندمان پایین سنتز، کاربرد صنعتی آنها را بسیار دشوارتر می‌کند. مطالعه‌ی حاضر با هدف بررسی فعالیت ضدسرطانی و ضدبیوفیلمی اگزوپلی ساکارید بدست آمده از Lacticaseibacillus paracasei AS20(1) و بهینه سازی تولید آن انجام شد. مواد و روش‌ها: در مطالعه‌ی حاضر، سنتز EPS توسط Lacticaseibacillus paracasei AS20(1) بوسیله‌ی Central Composite Design بهینه‌سازی شد. همچنین تاثیر این EPS بر مهار تشکیل بیوفیلم Staphylococcus aureus (mg/ml 75/0- 25/0)، بقای رده سلولی سرطان کولون انسانی (HT-29) (mg/ml2-005/0) و القای آپوپتوز (mg/ml 2) در آنها مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت سمیت این اگزوپلی ساکارید میکربی با استفاده از آزمون همولیز گلبول های قرمز انسانی (mg/ml 100 و 50) بررسی شد. یافته‌ها و نتیجه‌گیری: با توجه به مدل پیش بینی شده، حداکثر تولید EPS در 2/7 pH ، غلظت عصاره مخمر 3/2% (وزنی/حجمی) و غلظت سوکروز g/L 3/33 بدست آمد. EPS مورد مطالعه فعالیت ضد بیوفیلمی (%70-11) و فعالیت ضد سرطانی نویدبخشی را در برابر HT-29 نشان داد .(IC50=1451.42 µg/ml) تیمار EPS درصد سلول‌ها را در حالت آپوپتوز اولیه (8/28 درصد) افزایش داد. این EPS میکربی دارای سمیت ناچیز (<5%) علیه گلبول های قرمز بود. بحث و نتیجه گیری: در مجموع، شرایط بهینه سازی شده ی ایده‌آل می‌تواند برای تولید EPS در مقیاس بزرگ توسط Lacticaseibacillus paracasei AS20 (1) که دارای فعالیت‌های زیستی ارزشمندی است، مفید باشد.

مشاهده مقاله

پژوهشی- انگلیسی

مقایسه انواع روش های حفظ باکتری های اسید لاکتیک برای استفاده به صورت کشت آغازگر

نفیسه سادات نقوی؛ گلنوش رضایی زاده؛ فهیمه صرامی؛ منصوره سادات خیام نکویی؛ کیانوش خسروی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 04 مهر 1401

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2022.133007.1459

چکیده

مقدمه: در صنایع غذایی برای تولید انواع مختلف محصولات تخمیری از تک‌سویه‌ها یا مخلوط مزوفیل و ترموفیل باکتری‌های اسید لاکتیک به عنوان کشت‌های آغازگر استفاده می‌شود. نگهداری این کشت‌های آغازگر مرحله ... بیشتر

مشاهده مقاله

دوره 11 (1401)

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

بانک ها و نمایه نامه ها

ابر واژگان