دانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Vol.7, No.27, Autumn 2018سال هفتم، شماره 27، پاییز 139723343FAJournal Article20190218https://bjm.ui.ac.ir/article_23343_bdbb665472ec9168f5030e1966aa54d2.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Study on effect feedings with probiotics in increasing resistance to Aeromonas hydrophila and Changes in gut bacterial communities Sander luciopercaبررسی تأثیر غذادهی با پروبیوتیک بر افزایش مقاومت در برابر آئروموناس هیدروفیلا و تغییر جوامع باکتریایی دستگاه گوارش ماهی سوف سفید1122281810.22108/bjm.2017.77642.0FAمنیرهفئیددکترای میکروبیولوژی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، انزلی، ایرانروحاکسری کرمانشاهیاستاد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، دانشکدۀ علوم زیستی، دانشگاه الزهرا، تهران، ایرانمحمدپورکاظمیاستاد ژنتیک آبزیان، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایرانمجتبیداربوییاستاد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد شیراز، ایرانسمیهحقیقی کارسیدانیاستادیار بهداشت و بیماریهای آبزیان، گروه شیلات، دانشگاه آزاد انزلی، ایرانJournal Article20160713<strong>Introduction:</strong> This study evaluated the effect of dietary administration<em> Lactobacillus brevis</em> MF01 on survival rate of total bacteria, lactic acid bacteria intestinal tract fish and changes in gut bacterial communities <em>Sander lucioperca</em>.
<strong>Materials and methods:</strong> <em>Lactobacillus brevis</em> was isolated and identified from intestine of <em>Sander lucioperca</em>by biochemical and molecular tests<strong><em>.</em></strong>Fish were fed with dietary administration containing A1 (<em>L.brevis</em> MF01 10 <sup>10</sup> CFU / g), A2 (<em>L. brevis</em> MF01 10 <sup>8</sup>CFU / g) and the control group (without <em>Lactobacillus</em>) for 45 days. At the end of the feeding period, fish were challenged with 4.5× 10 <sup>8</sup>CFU /ml <em>Aeromonas hydrophila</em>. The intestinal micro biota includes lactic acid bacteria and total bacteria at different times (15,30, 45 days) and 15 days after stopping feedings with probiotics were performed by using MRS agar, Plate count agar media.
<strong>Results:</strong> The lactic acid bacteria levels were significantly increased compared to the control group following probiotics administration in diet (<em>P</em>,< 0.05). The highest number of intestinal micro biota was observed in <em>Lactobacillus brevis</em> 10<sup>10</sup>Cfu /g treatment (A1)(<em>P </em>< 0.05). Any lactic acid bacteria of the intestine, was not detected in the control group after 15 days. After the end of feeding, the number of total bacteria and Lactic acid bacteria in all groups was decreased. The highest and lowest survival rate, respectively were treatments A1 (86%) and the control group (60%).
<strong>Discussion and conclusion:</strong> The results showed that addition of <em>Lactobacillusbrevis </em>as an additive in feeding of<em> sander lucioperca</em>, significantly increased the lactic acid bacteria, the intestinal bacteria and the survival rate was compared to the control group (injected).<strong>مقدمه:</strong> در پژوهش حاضر، اثر غذادهی <em>لاکتوباسیلوس برویس </em>MF01 بر میزان بقای باکتریهای کل و باکتریهای لاکتیکاسید روده ماهی و تغییر جوامع باکتریایی دستگاه گوارش ماهی سوف سفید بررسی شد.
<strong>مواد و روشها:</strong> باکتری <em>لاکتوباسیلوس برویس</em> از روده ماهی سوف سفید جداسازی و با آزمایشهای بیوشیمیایی و مولکولی تأیید شد. ماهیان شش هفته با <em>لاکتوباسیلوس برویس</em> در دوزهای 10<sup>8</sup> و 10<sup>10</sup> (تعداد کل فلور باکتریایی بر گرم) و شاهد غذادهی و خونگیری در پایان دوره غذادهی انجام و سپس با 10<sup>8</sup>× 5/4 (تعداد کل فلور باکتریایی بر میلیلیتر) باکتری <em>آئروموناس هیدروفیلا</em> مواجههسازی شدند. نرخ بقای ماهیان بهطور روزانه طی دوره هفت روزه ارزیابی شد. باکتریهای رودهای شامل لاکتیکاسید باکتریها و باکتریهای کل روده در زمانهای مختلف (دو، چهار و شش هفته) و دو هفته پس از توقف غذادهی با پروبیوتیک روی محیط پلیتکانت آگار و محیط لاکتوباسیلوس آگار (امآراس آگار) بررسی شد.
<strong>نتایج: </strong>تعداد باکتریهای لاکتیکاسید و تعداد کل باکتریهای میکروبیوتای رودهای در تیمارهای پروبیوتیک بهطور معناداری بیشتر از گروه شاهد بودند (05/0<strong><em>P</em></strong><strong><</strong>). بیشترین تعداد باکتریهای لاکتیکاسید در تیمار 10<sup>10 </sup>(تعداد کل فلور باکتریایی بر گرم) <em>لاکتو باسیلوس برویس</em> مشاهده شدند. در دو هفته اول، باکتریهای لاکتیکاسید از روده گروه شاهد جداسازی شدند و پس از آن، هیچ باکتری لاکتیکاسیدی از روده شاهد جداسازی نشد. پس از قطع غذادهی با پروبیوتیک، تعداد باکتریهای کل و پروبیوتیک در تمام تیمارها کاهش یافتند و بیشترین و کمترین میزان بقا بهترتیب در تیمارهای <strong>A1</strong> (86 درصد) و شاهد (60 درصد) دیده شد.
<strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> نتایج بررسی حاضر نشان دادند افزودن <em>لاکتوباسیلوس برویس </em>به جیره ماهی سوف سفید سبب افزایش معنادار میزان باکتریهای لاکتیکاسید، باکتریهای کل رودهای ماهی و میزان بقای آن نسبت به گروه شاهد (تزریق) میشود.https://bjm.ui.ac.ir/article_22818_4a9c8a9b2456919d4847d4262fa152ef.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Changes in ahpF and tviA genes expression in Salmonella
enterica PTCC 1230upon osmotic and oxidative stress using Real-Time PCRتغییر در بیان ژنهای ahpF و tviA در Salmonella enterica PTCC 1230 ناشی از تنشهای اسمزی و اکسیداتیو با روش Real-Time PCR13232284910.22108/bjm.2018.108142.1097FAمحمدفائزی قاسمیگروه زیستشناسی سلولیمولکولی، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد لاهیجان، ایرانحسینزحمتکش زکریاییگروه میکروبیولوژی ، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد لاهیجان، ایرانJournal Article20171122<strong>Introduction:</strong><em>Salmonella</em> is a member of the <em>Enterobacteriaceae</em>family causing infectious disease in human and animals. The diseases caused by this bacterium are typhoid, bacteremia, enterocolitis, salmonellosis which are a health problem worldwide. The aim of this study was to evaluate the changes in expression of <em>ahpF</em> and <em>tviA</em>genes in <em>Salmonella enterica</em> PTCC 1230 exposed to osmotic and oxidative stresses. <br /><strong>Materials and Methods: </strong>For osmotic stress, <em>S.enterica</em> PTCC 1230 was subjected to 6, 8, 10, 12, and 14% (W/V) NaCl concentrations and for the oxidative stress, H<sub>2</sub>O<sub>2</sub>at concentrations of 1200, 2400, 4800, 6000 and 7200 ppm were used. Change in expression of <em>ahpF</em> and <em>tviA </em>genes were quantified using Real-time PCR method. <br /><strong>Results:</strong>Based on the obtained results, NaCl at concentrations of 14% and 10% and H<sub>2</sub>O<sub>2</sub>atconcentrations of 7200 (ppm) and 6000 (ppm) had maximum effects on the bacterial growth, respectively. In concentration of 7200 ppm, the expression of <em>ahpF</em>gene increased about 1.8 and 2.5-fold more thanH<sub>2</sub>O<sub>2</sub>at 6000 ppm concentration and reference gene (16S rRNA).Also, in 14% (W/V) sodium chloride concentration the expression of <em>tviA</em>gene increased about1.3 and 1.5 fold more than 10% and the reference gene (16S rRNA), respectively. <br /><strong>Discussion and Conclusion:</strong>In this study, changes in expression level of <em>ahpF</em> and <em>tviA</em>genes upon oxidation and osmotic stresses were studied in <em>Salmonella enterica</em>PTCC 1230. The overall results of this study showed that the expression level of both <em>ahpF</em> and <em>tviA</em>genes were increased in stress condition and we recommend the study of the other genes incorporate in responses to environmental stresses. <strong>مقدمه:</strong> <em>سالمونلا</em> یکی از اعضای خانوادۀ <em>انتروباکتریاسه </em>است که باعث ایجاد بیماریهای عفونی در انسان و حیوانات میشود. این باکتری بیماریهایی نظیر تب رودهای (تیفوئید)، باکتریمی، انتروکولیت و سالمونلوز ایجاد میکند که امروزه معضل بهداشتی در جهان محسوب میشوند. هدف بررسی و مطالعۀ حاضر، ارزیابی تغییرات ناشی از تنشهای اسمزی و اکسیداتیو بر بیان ژنهای <em>tviA</em>و <em>ahpF</em> در <em>سالمونلا انتریکا </em>PTCC 1230 است.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> برای اعمال تنش اسمزی، باکتری در معرض غلظتهای 6، 8، 10، 12 و 14 درصد وزنی/حجمی سدیمکلراید قرار گرفت و برای اعمال تنش اکسیداتیو از غلظتهای 1200، 2400، 4800، 6000 و 7200 پیپیام آباکسیژنه استفاده شد. میزان کمّی تغییر بیان ژنهای <em>tviA</em>و <em>ahpF</em>با Real-Time PCR اندازهگیری شد.<br /> <strong>نتایج: </strong>غلظتهای 14 و 10 درصد سدیمکلراید و غلظتهای 7200 و 6000 پیپیام آباکسیژنه بیشترین اثر را روی رشد <em>سالمونلا انتریکا </em>PTCC 1230 داشتند. میزان بیان ژن <em>ahpF</em>در غلظت 7200 پیپیام آباکسیژنه نسبت به شرایط 6000 پیپیام و ژن مرجع (<em>16S rRNA</em>) بهترتیب 8/1 و 5/2 برابر افزایش یافت. همچنین بیان ژن <em>tviA</em> در غلظت 14 درصد سدیمکلراید نسبت به غلظت 10 درصد و ژن مرجع (<em>16S rRNA</em>) بهترتیب 3/1 و 5/1 برابر افزایش یافت.<br /> <strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> در پژوهش حاضر، میزان تغییر بیان ژنهای <em>tviA</em> و <em>ahpF </em>در شرایط تنشهای اسمزی و اکسیداتیو در باکتری <em>سالمونلا انتریکا </em>PTCC 1230 با روش Real-Time PCR بررسی شد. باتوجهبه نتایج، مشخص شد بیان ژنهای<em>ahpF </em>و <em>tviA </em>در شرایط تنش افزایش مییابد و بررسی پاسخ سایر ژنها به تنشهای محیطی پیشنهاد میشود.https://bjm.ui.ac.ir/article_22849_e6c8ba6cc8b189436be4ce28ba007c84.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Identification of some Cyanobacterial Isolates of Khabr National Park of Kerman using Classic and Molecular Methods شناسایی برخی جدایههای سیانوباکتریایی پارک ملی خبر کرمان با روشهای کلاسیک و مولکولی25352288210.22108/bjm.2018.109584.1110FAزهراحجتی1دانشجوی دکترا، گروه میکروبیولوژی ،دانشگاه الزهرا(س)، تهران، ایران
2مربی، گروه میکروبیولوژی دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بناب، ایرانپریسامحمدیدانشیار ،گروه میکروبیولوژی، دانشگاه الزهرا(س)، تهران، ایرانعزتعسگرانیدانشیار ، گروه ژنتیک، دانشگاه الزهرا(س)، تهران، ایرانJournal Article20180213<strong>Introduction:</strong> Khabr national park is one of the invaluable natural sources in our country and its microbial variety has not been investigated. Cyanobacteria are of those organisms that are present in all terrestrial and water ecosystems and some minerals are limiting factors in their growth. The goal of this study is to investigate the present cyanobacteria in the soils of the grazed and non-grazed plots in two cold and hot steppes of Khabr Park in the autumn season by means of classic and molecular methods. <br /><strong>Materials and Methods:</strong> 32 different regions of Khabr Park were sampled in autumn and were cultured in BG11 medium. Isolation of cyanobacteria was conducted by various sub-cultures. Then the pure colonies were morphologically studied by valid taxonomic keys. Molecular identification of mentioned isolates was performed by amplification and sequencing of <em>16srRNA gene</em>. The features of mentioned soils were analyzed physically and chemically. <br /><strong>Results:</strong> The results showed that for the soil texture of sandy loam, the average electrical conductivity was 99.12 µSiemens/cm and the average acidity of soil was 8.29. The isolates of Cyanobacteria belonged to <em>Chroococcidiopsis, </em><em>Leptolyngbya</em>, <em>Synechococcus, </em><em>Nodularia</em>. The results of DNA sequencing were compared to NCBI and its results were subjected to BLAST alignment. <br /><strong>Discussion and conclusion:</strong> The present work revealed that the variety and the number of the Cyanobacteria in this desert area are dependent on different parameters such as weather, humidity, source of nutrients, the amount of light absorbed by the surface and the temperature. The results of molecular identification validated the results of morphological tests.<strong>مقدمه:</strong> پارک ملی خبر یکی از ذخیرهگاههای طبیعی بسیار باارزش کشور است که تاکنون تنوع میکروبی آن بررسی نشده است. سیانوباکتریها ازجمله موجودات زندهای هستند که در بیشتر اکوسیستمهای خاکی و آبی وجود دارند و برخی مواد معدنی عامل محدودکنندۀ رشد این موجودات هستند. هدف پژوهش حاضر، بررسی حضور و شناسایی سیانوباکتریهای موجود در خاکهای مناطق دستخورده و دستنخورده در دو منطقۀ استپ سرد و گرم پارک خبر با استفاده از روشهای کلاسیک و مولکولی است.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> از 32 نمونۀ مختلف خاک پارک خبر که در فصل پاییز نمونهبرداری شده بودند در محیط BG11کشت داده شد و جداسازی سیانوباکتریها با استفاده از واکشتهای متعدد انجام شد؛ سپس کلنیهای خالص ازنظر ریختشناسی با استفاده از کلیدهای شناسایی معتبر بررسی شدند. شناسایی مولکولی جدایههای یادشده با استفاده از تکثیر و تعیین توالی ژنوم ناحیۀ gene <em>16S rRNA</em> انجام شد. ویژگیهای خاک مناطق یادشده ازنظر فیزیکی و شیمیایی تجزیهوتحلیل شدند.<br /> <strong>نتایج: </strong>نتایج بررسی نشان دادند نوع بافت خاک لوم- شنی، میانگین میزان هدایت الکتریکی 12/99 میکروزیمنس بر سانتیمتر و میانگین اسیدیتۀ خاک 29/8 است. جدایههای سیانوباکتریها متعلق به جنسهای <em>Chroococcidiopsis</em> sp.، <em>Leptolyngbya</em> sp.، <em>Nodularia </em>sp. و <em>Synechococcus</em> sp. بودند. نتایج تعیین توالیDNA با بانکهای اطلاعاتی NCBI مقایسه و نتایج آن همتراز (Blast) شد.<br /> <strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> پژوهش حاضر نشان داد تنوع و تعداد سیانوباکتریهای موجود در مناطق بیابانی به عوامل مختلفی ازجمله شرایط آبوهوایی، میزان رطوبت، مقدار تابش نور جذبشده بر سطح و دمای منطقه بستگی دارد. نتایج شناسایی مولکولی نتایج ریختشناسی را تأیید کردند.https://bjm.ui.ac.ir/article_22882_676d80f2856ff5d73f70711cb47fa0ff.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Assessing the Genetic Diversity of Isolated Cd and Cu Resistant Non-fermenting Gram-negative Bacilli from Waste Water by Using Molecular Markersبررسی تنوع ژنتیکی باکتریهای میلهای غیرتخمیرکنندۀ مقاوم به فلزهای کادمیوم و مس جداشده از پسابهای صنعتی با استفاده از نشانگرهای مولکولی37512289910.22108/bjm.2018.107479.1092FAمحمدحسینحبیب الهیگروه میکروبیولوژی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج ، ایرانامینباقی زادهگروه بیوتکنولوژی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته کرمان، ایرانآذرسبکبارگروه میکروبیولوژی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی، کرج ، ایرانJournal Article20171025<strong>Introduction: </strong>One of the best methods to remove pollutions resulted from heavy metals in industrial wastewater is biological removing. The first step in this way is identifying and clustering microorganisms especially, resistant bacteria to these metals. <br /><strong>Material and methods: </strong>In this research, 17 non-fermenting gram-negative bacilli were isolated and identified from industrial wastewater. Their MIC was determined by different concentrations of Cu and Cd. With CTAB and Dellaporta, methods were extracted bacterial DNA. Then evaluated genetic diversity by 7 RAPD, 3 ISSR markers. The similarity matrix was calculated by using NTSYS-pc software based on Jaccard’s coefficient for genotypes and dendrogram was drawn in UPGMA method. <br /><strong>Results: </strong>133 bands were identified by using 10 markers that they included 122 polymorphic bands and 11 monomorphic bands. This markers show high level of polymorphism among the bacteria studied. <br /><strong>Discussion and Conclusion</strong>: In the study cluster analysis and dendrogram drawn based on RAPD and ISSR markers together, there was a significant match between genetic diversity of markers and genetic diversity based on the MIC values. The combined use of both markers for genetic clustering based on resistance to copper and cadmium was more accurate. Principal component analysis was performed to complete the results of cluster analysis and 2-D, 3-D plots were drawn. The results of comparing these two methods showed that these markers had been properly selected for studying genetic diversity, and it was recommended using cluster analysis.<strong>مقدمه:</strong> حذف زیستی بهترین روش برای رفع آلودگیهای ناشی از فلزهای سنگین در پسابهای صنعتی است و نخستین قدم در این مسیر، شناسایی و طبقهبندی ریزموجودات مناسب بهویژه باکتریهای مقاوم به این فلزهاست.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> در پژوهش حاضر، 17 باکتری گرم منفی غیرتخمیرکننده از پسابهای صنعتی جداسازی و شناسایی شدند و کمترین غلظت بازدارنده (MIC) آنها نسبت به غلظتهای مس و کادمیوم ارزیابی شد؛ DNA باکتریهای یادشده با دو روش CTAB و دلاپورتا استخراج و تنوع ژنتیکی آنها با 7 نشانگر RAPD و 3 نشانگر ISSR بررسی شد. ماتریس تشابه بر اساس ضریب تشابه جاکارد با نرمافزار 2.02) NTSYS-pc (Ver برای ژنوتیپها محاسبه و دندروگرام به روش UPGMA رسم شد.<br /> <strong>نتایج: </strong>133 باند با استفاده از 10 نشانگر DNA شناسایی شدند که از این تعداد، 122 باند چندشکل و 11 باند یکشکل بودند. این نشانگرها سطح بالایی از چندشکلی را در میان باکتریهای مطالعهشده نشان دادند.<br /> <strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> تنوع ژنتیکی حاصل از بررسی توأم نشانگرهای ISSR و RAPD در تجزیۀ خوشهای و دندروگرام رسمشده با تنوع ژنتیکی مشاهدهشده بر اساس مقادیر MIC تطابق زیادی داشت و استفادۀ توأم از هر دو نوع نشانگر برای دستهبندیهای ژنتیکی بر اساس مقاومت به فلزهای مس و کادمیوم دقیقتر بود. برای تکمیل نتایج روش خوشهای، تجزیه به مؤلفههای اصلی نیز انجام شد و پلاتهای دوبعدی و سهبعدی رسم شدند.نتایج مقایسۀ این دو روش نشاندهندۀ انتخاب مناسب نشانگرها برای بررسی تنوع ژنتیکی میباشد واز بین دو روش، انجام تجزیه خوشهای نوصیه میشود.https://bjm.ui.ac.ir/article_22899_790c3489eba069d428f4c218a96962e6.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Expression of RecF and GyrB Genes in a Low Ciprofloxacin-resistant Escherichia coli Mutantبیان ژنهای recF و gyrB در جهشیافتۀ اشریشیاکلی با مقاومت کم به سیپروفلوکساسین53602292210.22108/bjm.2018.109936.1115FAمرضیه ساداتموسویدانشجو-گروه ژنتیک- دانشکده علوم-دانشگاه شهرکرد-شهرکرد-ایرانراضیهپوراحمددانشیار ژنتیک، گروه ژنتیک-دانشکده علوم، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد-ایرانمحمدرضامحزونیهاستاد میکروبیولوژی دامپزشکی-گروه پاتوبیولوژی-دانشکده دامپزشکی -دانشگاه شهرکرد-شهرکرد-ایرانJournal Article20180303<strong>Introduction:</strong> Replication and recombination are two fundamental cellular processes. GyrB and RecF are two proteins that are involved in these processes, respectively. GyrB is a subunit of DNA gyrase, the enzyme maintains negative supercoil in genomic DNA. RecF helps to load RecA in a single-strand gap, which is then repaired by RecA. Genes encoding these proteins are located in the same operon. Besides the general promoter, which is used in logarithmic phase, RecF has its own promoter, which is activated in stationary phase. The aims of this study were to investigate the expression of these genes and to estimate the pattern of <em>RecF</em> expression in the presence of ciprofloxacin. <br /><strong>Materials and Methods:</strong> RNAs of the cells were first extracted in logarithmic phase and after cDNA synthesis, the relative expression of these genes was determined in the <em>E. coli</em> mutant with low resistance to ciprofloxacin by Real-Time PCR. <br /><strong>Results:</strong> Results showed that both genes are overexpressed similarly in the mutant cell treated with a low amount of ciprofloxacin in the exponential phase of growth. <br /><strong>Conclusion</strong><strong>:</strong> The present work revealed that the variety and the number of the Cyanobacteria in this desert area are dependent on different parameters such as weather, humidity, source of nutrients, the amount of light absorbed by the surface and the temperature. The results of molecular identification validated the results of morphological tests.<strong>مقدمه:</strong> همانندسازی و نوترکیبی دو فرایند اساسی سلولی هستند و GyrB و RecF دو پروتئین هستند که بهترتیب در فرایندهای یادشده شرکت میکنند. GyrB زیرواحد آنزیم DNAجیراز است؛ آنزیمی که ابرپیچش منفی در DNA ژنومی را حفظ میکند. RecF به سوارشدن RecA در شکاف تکرشته کمک میکند و بعداً RecA تکرشته را ترمیم میکند. ژنهای کدکنندۀ این پروتئینها در یک اپرون قرار دارند. علاوهبر پروموتر عمومی که در فاز نمایی استفاده میشود، RecF دارای پروموتر خودی است که در فاز رکود فعال میشود. هدف مطالعۀ حاضر بررسی بیان این ژنها و پیشگویی الگوی بیان RecF در حضور سیپروفلوکساسین است.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> ابتدا RNA سلولها در فاز نمایی استخراج و پساز سنتز cDNA، بیان نسبی ژنهای <em>recF</em> و <em>gyrB</em> در جهشیافتۀ اشریشیا کلی دارای مقاومت کم به سیپروفلوکساسین به روش Real Time PCR ارزیابی شد.<br /> <strong>نتایج: </strong>نتایجنشان دادند هر دو ژن یادشده بهطور مشابه در فاز نمایی سلول جهشیافتۀ تیمارشده با مقدار کم سیپروفلوکساسین بیشبیان میشوند.<br /> <strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> طبق نتایج، سیپروفلوکساسین بیشبیان ژنهای یادشده را القا میکند؛ هرچند سطح مشابه بیان ممکن است رونویسی RecF توسط پروموتر خودی را پیشنهاد نکند و در نتیجه RecF برای ترمیم آسیب ناشی از سیپروفلوکساسین لازم است؛ هرچند حیات سلول بهطور کامل وابسته به این پروتئین نیست.https://bjm.ui.ac.ir/article_22922_619d5333c878eb55dd95d951c7c524d4.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Isolation and Biochemical and Molecular Identification of Lactobacillus Plantarum Bacteria from Rhizosphere of Lenjan Riceجداسازی و شناسایی بیوشیمیایی و مولکولی باکتری لاکتوباسیلوس پلانتاروم از ریزوسفر ریشۀ برنج لنجان61712292310.22108/bjm.2018.109730.1112FAصابرهنوریکارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا0000-0002-3520-1705سنبلناظریاستادیار، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سیناپرهامحسینیکارشناسی ارشد، گروه بیوشیمی، دانشگاه اوتاگو (نیوزیلند)Journal Article20180310<strong>Introduction:</strong> Probiotics refers to a group of living microorganisms that have beneficial effects on host health. <em>Lactobacilli </em>are one of the most important probiotic bacteria. The stimulatory effects of the immune system, besides reduction of gastrointestinal infections and the risk of inflammation of intestines in humans and animals, are some of Lacobacillus benefits. The effect of rhizospher bacteria, like <em>Lactobacillus</em>, on production of plant hormones, dissolving plant nutrient, facilitates the absorption of nutrients (like nitrogen), and the reduction of plant diseases were reported. Isolation of <em>Lactobacillus</em> has been reported of various sources of dairy and non-dairy sources. The purpose of this study was to investigate the presence of <em>L. plantarum</em>, one of most important probiotic bacteria, in rice rhizosphere, along with examination of the morphological, molecular, biochemical and probiotic properties of the isolated microorganisms.
<strong>Materials and Methods:</strong> Sampling of rhizosphere rice variety was carried out in Lenjan (Lenjan, Isfahan) carried out. Dillutions of samples were transferred to MES medium. Biochemical test, as sugar fermentation and enzyme activity, performed on gram-positive isolate bacilli. The ability of bacteria to grow in presence of Bile salt, and different pH and temperatures was investigated. Antibiotic resistance of isolates was examined. Specific primers of<em> L. plantarum</em> was used for molecular identification.
<strong>Results:</strong> Of 16 microorganisms, isolated from the rice's rhizosphere, there were 10 bacillus-shaped bacteria, which eight gram-positive isolates were oxidase and catalase negative (characteristic of <em>Lactobacillus</em> species). Sugar fermentation experiments identified six isolates with <em>L. plantarum</em> characteristics. Molecular experiments with the specific primers of <em>L. plantarum</em> confirmed the results. The bacteria grew very well (similar to control samples) in acidic medium at pH 3.5, 40ºC, and in presence of 0.3% bile. Resistance to seven of 12 antibiotics was detected.
<strong>Discussion and conclusion</strong>: The present study showed that rhizosphere of rice is the natural source for isolationof<em> L. plantarum</em>.<strong>مقدمه:</strong> پروبیوتیک به گروهی از ریزموجودات زنده اطلاق میشود که آثار سودمندی بر سلامتی میزبان دارند. لاکتوباسیلوسها از مهمترین باکتریهای پروبیوتیک هستند. تحریککنندگی سیستم ایمنی و کاهش عفونت دستگاه گوارش و خطر بیماری التهاب رودهای با تولید ترکیبات ضدمیکروبی ازجمله آثار مفید لاکتوباسیلوسها در انسان و حیوان هستند. اثر باکتریهای ریزوسفر خاک مانند لاکتوباسیلوسها در تولید هورمون، انحلال ترکیبات غذایی گیاهی، تسهیل جذب مواد غذایی نظیر نیتروژن و کاهش بیماریهای گیاهی گزارش شده است. جداسازی لاکتوباسیلها از منابع مختلف لبنی و غیرلبنی گزارش شده است. هدف پژوهش حاضر بررسی حضور لاکتوباسیلوس پلانتاروم، یکی از مهمترین باکتریهای پروبیوتیک، در ریزوسفر گیاه برنج و مطالعۀ ویژگیهای مولکولی، بیوشیمیایی و پروبیوتیکی این ریزموجود است.
<strong>مواد و روشها:</strong> نمونهبرداری از ریزوسفر برنج رقم لنجان (منطقۀ لنجان، اصفهان) انجام شد. رقتهای صفر تا <sup>4-</sup>10 از نمونه به محیط MRS منتقل و آزمایشهای بیوشیمیایی شامل تخمیر قندها و فعالیت آنزیمی روی جدایههای باسیلیشکل گرم مثبت انجام شدند. توانایی رشد جدایهها در حضور نمک صفراوی و اسیدیتهها و دماهای مختلف بررسی و سپس، مقاومت جدایهها به آنتیبیوتیک مطالعه شد. آغازگر اختصاصی لاکتوباسیلوس پلانتاروم برای شناسایی مولکولی استفاده شد.
<strong>نتایج: </strong>از بین 16 ریزموجود جداشده از ریزوسفر گیاه مطالعهشده، 10 باکتری باسیلیشکل و 8 جدایه گرم مثبت، اکسیداز و کاتالاز منفی (ویژگی لاکتوباسیلوسها) بودند. آزمایشهای تخمیر قند، 6 جدایه را با ویژگی لاکتوباسیلوس پلانتاروم مشخص کردند. استفاده از آغازگرهای اختصاصی لاکتوباسیلوس پلانتاروم این نتایج را تأیید کرد. این باکتریها در محیط اسیدی با اسیدیتۀ برابر 5/3، دمای 40 درجۀ سانتیگراد و حضور 3/0 درصد صفرا بهخوبی (مشابه نمونههای شاهد) رشد کردند. باکتریها به 7 آنتیبیوتیک از 12 آنتیبیوتیک بررسیشده مقاومت نشان دادند.
<strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> پژوهش حاضر نشان داد ریزوسفر برنج منبعی طبیعی برای جداسازی <em>لاکتوباسیلوس پلانتاروم</em> است.https://bjm.ui.ac.ir/article_22923_943c43c29293f6f051a2def677e90f3f.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Investigating the L-asparaginase Production in the Yeast Yarrowia Lipolyticaبررسی تولید آنزیم ال -آسپاراژیناز در مخمر یارروویا لیپولیتیکا73792296610.22108/bjm.2018.111339.1133FAفرشاددرویشیگروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران.فرشتهشمسیگروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران.Journal Article20180602<strong>Introduction</strong>: L-Asparaginase catalyzes the hydrolysis of L-asparagine to L-aspartic acid and ammonia. This enzyme is used for the treatment of patients with acute lymphoblastic leukemia, melanosarcoma and lymphosarcoma. It is also used in the production of acrylamide-free foods. Considering the important applications of this enzyme, the aim of this study was to introduce a new microbial source for the production of eukaryotic L-asparaginase. <br /><strong>Materials and Methods</strong>: The quality and quantity production of L-asparaginase was investigated in four strains of yeast <em>Yarrowia lipolytica</em>. The quality assessment of L-asparaginase production was done on asparagine minimal agar. Quantitative assay of the enzyme was done in Czapex Dox’s medium by spectrophotometric method using Nessler’s reagent. <br /><strong>Results</strong>: All of four strains show that they are able to produce asparaginase making a purple halo around the colony. <em>Y. lipolytica</em> DSM3286, DSM70562, DSM3218 and CBS6303 were produced 17/14, 11, 6/98 and 5/61 U/mL of asparaginase in Czapex Dox’s medium after 24 h, respectively. <br /><strong>Discussion and Conclusion: </strong><em>Y. lipolytica</em> DSM3286 was selected as the best asparaginase producer strain with the largest halo and the highest asparaginase production. The <em>Y. lipolytica</em> could be used as a potential source of L-asparaginase production.<strong>مقدمه:</strong> آنزیم ال- آسپاراژیناز تجزیۀ ال- آسپاراژین را به ال- آسپاراتیکاسید و آمونیاک تسریع میکند. این آنزیم در درمان بیماران مبتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حاد، ملانوسارکوما و لنفوما استفاده میشود و در تولید مواد غذایی بدون آکریلآمید کاربرد دارد. باتوجهبه کاربردهای مهم این آنزیم، هدف پژوهش حاضر معرفی منبع جدید میکروبی برای تولید ال- آسپاراژیناز یوکاریوتی است.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> تولید کمّی و کیفی ال-آسپاراژیناز در چهار سویۀ مخمر <em>یارروویا لیپولیتیکا</em> بررسی شد. بررسی کیفی تولید ال-آسپاراژیناز روی محیطکشت حداقل آسپاراژینآگار و سنجش کمّی ال- آسپاراژیناز در محیطکشت سیزپکس داکس به روش طیف نورسنجى با معرف نسلر انجام شد.<br /> <strong>نتایج: </strong>هر چهار سویه با ایجاد هالۀ ارغوانیرنگ اطراف کلنی نشان دادند قادر به تولید آنزیم آسپاراژیناز هستند. پساز 24 ساعت، سویههای DSM3286، DSM70562، DSM3218 و CBS6303 بهترتیب 14/17، 11، 98/6 و 61/5 واحددرمیلیلیتر آسپاراژیناز در محیطکشت سیزپکس داکس تولید کردند.<br /> <strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> <em>یارروویا لیپولیتیکا</em> سویۀ DSM 3286 با ایجاد بیشترین قطر هاله و تولید بیشترین مقدار آنزیم آسپاراژیناز بهترین سویۀ تولیدکنندۀ آسپاراژیناز انتخاب شد. امکان استفاده از مخمر یارروویا لیپولیتیکا بهشکل منبع بالقوهای از ال- آسپاراژیناز وجود دارد.https://bjm.ui.ac.ir/article_22966_09fa94a50f8cdda018b3f2164b844159.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Biosynthesis of silver nanoparticles using Aspergillus flavus and investigation of some effective factors on its productionتولید زیستی نانوذرات نقره با استفاده از قارچ Aspergillus flavus و بررسی برخی عوامل موثر بر آن81942297610.22108/bjm.2017.106628.1086FAافسانهقبولیگروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایرانسهیلامیرزاییگروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایرانJournal Article20170925<strong>Introduction:</strong> <strong>:</strong> Using fungi as sources of enzymes that can catalyze specific reactions conducing to inorganic nanoparticles, is being developed. <em>Aspergillus flavus</em> has a great potential in extracellular biosynthesis of silver nanoparticles. Since this fungus can grow on simple media quickly and adequately, it is cheaper to use it in silver nanoparticles biosynthesis than other methods. <br /><strong>Materials and methods:</strong> Extracellular biosynthesis of silver nanoparticles was carried out by adding 1mM silver nitrate to <em>A. flavus</em> cell filtrate. Nanoparticles production was confirmed by visual observation of color change in the cell filtrate and UV-vis spectrophotometry. More investigation was conducted using XRD, FTIR and TEM. The stability of nanoparticles and the effect of culture media and silver nitrate concentration on nanoparticles’ production were studied too. <br /><strong>Results:</strong> The color change of cell filtrate from pale to brown confirmed the extracellular production of silver nanoparticles. The absorption spectra indicated a peak at 420nm attributable to the sliver nanoparticles. X-ray diffraction showed crystalline nature of the biosynthesized nanoparticles. Characterization of sliver nanoparticles’ shape and size using TEM showed that they were spherical and 18.2 nm in diameter. These nanoparticles were stable for 11 months and FTIR demonstrated the presence of proteins as capping agents which lead to their stability. More silver nitrate caused more nanoparticles production and PDB was the best media in this process. <br /><strong>Discussion:</strong> Biosynthesized nanoparticles were crystalline in nature, small in size and monodispersed. Besides, they were very stable due to capping by fungal secreted proteins; this stability is reported for the first time in the world. The fungal-mediated green and ecofriendly approach towards the synthesis of nanoparticles can be used as an alternative to the more popular physical and chemical methods for the synthesis of nanoparticles<strong>مقدمه:</strong> قارچها، منابع آنزیمی برای کاتالیز واکنشهای ویژهای هستند که به ساخت نانوذرات غیرآلی منجر میشوند و استفاده از قارچها در حال توسعه است. قارچ <strong>Link</strong><em>Aspergillus flavus</em> پتانسیل زیادی برای سنتز خارجسلولی نانوذرات نقره دارد و به علت رشد سریعی که این قارچ در محیط ساده دارد، استفاده از آن در مقایسه با سایر روشها بسیار ارزان است.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> تولید نانوذرات نقره با افزودن نیتراتنقره 1 میلیمولار به عصارۀ سلولی قارچ <em>A. flavus</em>انجام شد. وجود نانوذرات بهطور چشمی و باتوجهبه تغییررنگ عصاره و طیفسنجی نور فرابنفش- مرئی تأیید شد. بررسیهای بیشتر با روشهای XRD، FTIR و TEM انجام شدند. پایداری نانوذرات بیوسنتزشده و اثر محیطکشت و غلظت نیتراتنقره روی تولید نانوذرات نیز بررسی شد.<br /> <strong>نتایج: </strong>رنگ عصارۀ سلولی قارچ از بیرنگ به قهوهای تغییر یافت که تولید خارجسلولی نانوذرات نقره را نشان میدهد. دادههای طیفسنجی، وجود پیک در 420 نانومتر را نشان دادند که ویژۀ نانوذرات نقره است. طیف حاصل از پراش اشعۀ ایکس نیز ماهیت کریستالی نانوذرات تولیدشده را نشان داد. بررسی شکل و اندازۀ نانوذرات با TEM مشخص کرد نانوذرات نقرۀ تولیدشده کرویشکل و پراکنده هستند و میانگین اندازۀ آنها 2/18 نانومتر است. نانوذرات نقرۀ حاصل تا 11 ماه پایداری نشان دادند و تجزیهوتحلیل FTIR، حضور پروتئینها را، عامل پایدارکنندهای نشان داد که نانوذرات نقره را احاطه میکند. محیط سیبزمینیدکستروز (PDB)کارایی زیادی در تولید نانوذرات نقره داشت و میزان بیوسنتز با افزایش غلظت نیتراتنقره افزایش یافت.<br /> <em><strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> نانوذرات حاصل در پژوهش حاضر علاوه بر ماهیت کریستالی، اندازۀ بهنسبت کوچک و یکنواختی زیادی که داشتند به علت پوششیافتن با پروتئینهای ترشحشده از قارچ بهشدت پایدار بودند. این میزان پایداری تاکنون گزارش نشده است و این امکان وجود دارد که روش یادشده بهعنوان روشی زیستسازگار و سبز جایگزین روشهای فیزیکی و شیمیایی معمول شود.<br /></em>https://bjm.ui.ac.ir/article_22976_840ba4e30ad8f6c9a2acd048f6c86cb2.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Investigation the UV Effect on Uranium Bioleaching Process in Acidithiobacillus sp FJ2 and its Possible Consequences on the CoxB Gene Sequence بررسی اثر UV روی فرایند فروشویی زیستی اورانیوم در باکتری Acidithiobacillus sp. FJ2 و اثر احتمالی آن روی توالی ژن coxB951112297910.22108/bjm.2018.109405.1108FAرقیهجعفرپورگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایرانفائزهفاطمیگروه پژوهشی مواد اولیه و فناوری سوخت، پژوهشکده مواد و سوخت هسته ای، پژوهشگاه علوم و فنون هسته ای، تهران، ایرانفرامرزمهرنژادگروه نانوبیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فنون نوین، دانشگاه تهران، تهران، ایراناکرمعیدیگروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایرانJournal Article20180224<strong>Introduction:</strong> The increasing use of uranium as a suitable source of energy in various industries has led to the depletion of high-grade uranium mines in different countries. Today, the uranium bioleaching process has been used in different countries for easy and cheap access to uranium. In this process, microorganisms are used to extract uranium from low-grade mines. <br /><strong>Materials and methods:</strong> The <em>Acidithiobacillus</em> sp. FJ2 bacterium was exposed to UV radiation. Then, the uranium bioleaching process was conducted in the presence of bacteria exposed to UV and non-exposed bacteria. In followings, this gene was amplified by PCR technique after DNA extraction from bacterial species and <em>coxB</em> gene primer design. Subsequent to gene sequencing and editing with bioedit software, the final sequence of the <em>coxB</em> gene was determined from both bacterial species. Later than, the sequences were examined and compared to prove the presence or absence of the mutation in the radiation sample. <br /><strong>Results:</strong> The amount of uranium extraction in the presence of bacteria exposed to UV reached to 100% on the second day at the 5% pulp density, whereas the 96.36% extraction yield was obtained on the thirteenth day in pulp density of 50%. This amount was recorded in an unexposed bacterium, in the third and thirteenth days at 5& 50% pulp densities, respectively. The <em>coxB</em> gene sequence was identical in both bacterial specimens. <br /><strong>Discussion and conclusion:</strong> In this study, UV irradiation to <em>Acidithiobacillus</em> sp. FJ2 increased the rate of uranium bioleaching in the pulp density of 5%, whereas uranium extraction yield was sustained in the 50% pulp density. These effects were independent to the <em>coxB</em> gene.<strong>مقدمه:</strong> استفادۀ روزافزون از اورانیوم برای منبع مناسب تأمین انرژی در صنایع گوناگون و کشورهای مختلف باعث تخلیۀ معادن با عیار بالای این عنصر شده است. امروزه فرایند فروشویی زیستی اورانیوم برای دستیابی آسان و ارزان به اورانیوم لازم در کشورهای مختلف استفاده میشود. در این فرایند، ریزموجودات برای استخراج اورانیوم از معادن با عیار پایین آن استفاده میشوند.<br /> <strong>مواد و روشها:</strong> ابتدا باکتری اسیدی تیوباسیلوس سویۀ FJ2 در معرض UV قرار گرفت، سپس فرایند فروشویی زیستی اورانیوم در حضور باکتریهای قرارگرفته و قرارنگرفته در معرض UV انجام شد. پساز استخراج DNA از هر دو نوع باکتری و طراحی آغازگر ژن <em>coxB</em>، تکثیر ژن با استفاده از PCR انجام شد. پساز تعیین توالی ژن و ویرایش با نرمافزار بیوادیت، توالی نهایی ژن <em>coxB</em> هر دو نوع باکتری تعیین و برای اثبات وجودداشتن یا نداشتن جهش در نمونۀ قرارگرفته در معرض UV بررسی و مقایسه شد.<br /> <strong>نتایج: </strong>میزان استخراج اورانیوم در باکتری قرارنگرفته در معرض UV در چگالی پالپ 5 درصد در نیمۀ روز سوم به 100 درصد و در چگالی پالپ 50 درصد در روز سیزدهم به 62/94 درصد رسید. این میزان در حضور باکتری قرارگرفته در معرض UV در چگالی پالپ 5 درصد در روز دوم به 100 درصد و در چگالی پالپ 50 درصد در روز سیزدهم به 34/96 درصد رسید. توالی ژن <em>coxB</em> در هر دو نمونه باکتری یکسان بود.<strong> </strong><br /> <strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> در پژوهش حاضر، پرتودهی با UV در باکتری اسیدی تیوباسیلوس سویۀ FJ2 سرعت فروشویی زیستی اورانیوم در چگالی پالپ 5 درصد را افزایش داد؛ درحالی که میزان استخراج اورانیوم در چگالی پالپ 50 درصد ابقا شد. نتیجۀ یادشده غیروابسته به ژن <em>coxB</em> است.https://bjm.ui.ac.ir/article_22979_c7b34b4138dae2f07c6db2edab3069b3.pdfدانشگاه اصفهانزیست شناسی میکروبی3060-764772720180923Biosurfactant Production and Biological Removal of Bulk Oil using Native Strains Isolated from the Southern Shore Lines of Caspian Seaتولید بیوسورفکتانت و حذف زیستی لکههای نفتی با استفاده از جدایههای بومی باکتریهای سواحل جنوبی دریای خزر1131282302010.22108/bjm.2018.109256.1105FAجیناتن زادهدانشجوی دکتری گروه میکروبیولوژی، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد لاهیجان، ایرانمحمدفائزی قاسمیدانشیار گروه میکروبیولوژی، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد لاهیجان، ایرانمعصومهانوریدانشیار گروه میکروبیولوژِی، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد رشت، ایرانخسروعیسی زادهاستادیار گروه میکروبیولوژی، دانشکدۀ علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد لاهیجان، ایرانJournal Article20180205<strong>Introduction:</strong> Nowadays, biodegradation of oil pollution using native bacteria isolates is considered in different research programs. The purpose of this study was to investigate biosurfactant production and degradation of oil spills on Caspian Sea coastlines using native bacterial isolates.
<strong>Materials and methods:</strong> Sediment and oil spills samples were isolated from seven stations in the coasts of Bandar Anzali and Kiah Shahr. Biosurfactant production was evaluated using quantitative and qualitative methods such as hemolysis on blood agar, oil spreading method, droplet disintegration, emulsification activity and surface tensile test. Also, total hydrocarbon of oil was estimated. Biodegradation of compounds in sediments and petroleum analyzed using gas chromatography mass spectrometry (GC-MS) method. Identification of strains was performed using different morphological, biochemical and sequencing of 16S rRNA genes.
<strong>Results:</strong> Amongst 115 isolates, 57 isolates showed biosurfactant activity based on qualitative methods, and 15 strains with highest biological removal efficiency were selected for further studies. The spectrophotometry results showed the J3 isolate could remove 94.6% of oil within 7 days, was the most potent isolate in removal of hydrocarbons. Gas chromatography analysis indicated that 90% of aliphatic compounds were removed byJ3 strain in 21 days. The isolates J3, J5, and J12, which showed highest biosurfactant activity, were identified as strains of Bacillus cereussenso latu, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa, respectively.
<strong>Discussion and conclusion:</strong> The results of this study showed that the isolated strains showed suitable decreasing hydrophobicity and removal of oil hydrocarbons. So, it can be concluded that isolated J3, J5 and J12 are potent microorganisms in cleaning of contaminated waters by oil and other hydrocarbons.<strong>مقدمه:</strong> امروزه تجزیۀ زیستی آلودگیهای نفتی با استفاده از باکتریهای بومی درخور توجه است. هدف پژوهش حاضر، جداسازی باکتریهای بومی تولیدکنندۀ بیوسورفکتانت با قابلیت حذف زیستی لکههای نفتی موجود در سواحل دریای خزر است.
<strong>مواد و روشها:</strong> نمونهبرداری از رسوبات و لکههای نفتی هفت ایستگاه داخل سواحل بندر انزلی و کیاشهر انجام شد. تولید بیوسورفکتانت با استفاده از روشهای کمّی و کیفی شامل همولیز در محیط آگار خوندار، روش گسترش نفت، آزمایش انهدام قطره، فعالیت امولسیونکنندگی (آمیزندگی) و آزمون کشش سطحی انجام شد. میزان تجزیۀ زیستی ترکیبات در رسوبات و لکههای نفتی به روش کروماتوگرافی گازی (GC-MS) و شناسایی باکتریها با آزمونهای بیوشیمیایی و تعیین توالی ژن <em>16S rRNA</em> انجام شد.
<strong>نتایج: </strong>از میان 115 جدایۀ حاصل، 57 جدایه بر اساس آزمونهای کیفی تولیدکنندۀ ترکیبات فعال سطحی بودند. 15 جدایه از 57 جدایه برای مراحل بعدی و آزمونهای تکمیلی انتخاب شدند؛ نتایج اسپکتروفتومتری این جدایهها نشان دادند جدایۀ 3J با میزان حذف نفت 6/94 درصد طی 7 روز توانمندترین جدایه در حذف هیدروکربنهای نفتی است. تجزیهوتحلیل کروماتوگرافی گازی حذف 90 درصد ترکیبات آلیفاتیک طی 21 روز را توسط این جدایه نشان دادند. سه جدایۀ برتر تولیدکنندۀ ترکیبات بیوسورفکتانت شامل J3، J5 و J12 بر اساس آزمونهای بیوشیمیایی و مولکولی بهترتیب در گروههای <em>باسیلوس سرئوس</em>، <em>استافیلوکوکوس همولیتیکوس</em> و <em>سودوموناس آئروژینوزا</em> شناسایی شدند.
<strong>بحث و نتیجهگیری:</strong> نتایج نشان دادند سویههای جداسازیشده سطح آبگریزی، توانایی تولید ترکیبات فعالکنندۀ سطحی و ویژگی تجزیۀ ترکیبات هیدروکربنی را در حد مناسبی دارند. جدایههای J3 و J5 و J12 بیشترین درصد حذف نفتی را نشان دادند و نمونۀ J3 پساز 21 روز با استفاده از کروماتوگرافی گازی (GC-MS) میزان TPH را به میزان6/94 درصد در نفت خام کاهش داد.https://bjm.ui.ac.ir/article_23020_6eadf76c5245f5c10459277617599dd9.pdf