<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE ArticleSet PUBLIC "-//NLM//DTD PubMed 2.7//EN" "https://dtd.nlm.nih.gov/ncbi/pubmed/in/PubMed.dtd">
<ArticleSet>
<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه اصفهان</PublisherName>
				<JournalTitle>زیست شناسی میکروبی</JournalTitle>
				<Issn>3060-7647</Issn>
				<Volume>13</Volume>
				<Issue>50</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2024</Year>
					<Month>08</Month>
					<Day>22</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Purification of Fusobacterium nucleatum from periodontal pockets</ArticleTitle>
<VernacularTitle>خالص سازی فوزوباکتریوم نوکلئاتوم از پاکت های پریودنتال دندانی</VernacularTitle>
			<FirstPage>105</FirstPage>
			<LastPage>123</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">28650</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.22108/bjm.2024.140998.1589</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>فاطمه</FirstName>
					<LastName>اسکندری ملایری</LastName>
<Affiliation>کارشناسی ارشد ایمنی شناسی، دانشکده پژشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>مرضیه</FirstName>
					<LastName>رضائی</LastName>
<Affiliation>گروه ایمنی شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>تهمینه</FirstName>
					<LastName>نریمانی</LastName>
<Affiliation>استادیار گروه باکتری و ویروس شناسی، دانشکده پژشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</Affiliation>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2024</Year>
					<Month>04</Month>
					<Day>09</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>Introduction: &lt;em&gt;Fusobacterium nucleatum (F. nucleatum)&lt;/em&gt; is an anaerobic, gram-negative bacterium, morphologically an elongated bacillus with a sharp end belonging to the Bacteroidaceae. It is the normal flora of the mouth that is present in other organs in some diseases. Given the role of &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; in the creation and development of human diseases, it is very important to investigate its characteristics and functions. However, due to the obligate anaerobic nature of &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt;, purification and long-term storage of the bacteria pose problems. The aim of this study is to find an optimal method for the purification of &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; to enable a detailed study of the functions and mechanisms of the bacteria to provide new therapeutic approaches to control or treat the diseases caused by &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; for future studies. Materials and Methods: Samples were taken from deep periodontal pockets of 16 patients using 40 size paper points with tryptic soy broth transfer medium (first method) and Columbia agar culture medium with gas pack type A and anaerobic jar (second method). The samples were then examined for the presence of &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; by macroscopic and microscopic observations, biochemical tests, PCR  and sequencing. Results: The results showed that the tryptic soy broth transfer medium was not able to preserve and keep the bacteria alive, and the purified &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; was isolated by direct transfer to  Columbia agar culture medium with gas pack type A and anaerobic jar. Discussion and Conclusion: Due to the obligate anaerobic nature of &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt;, the use of transfer medium is not efficient for isolation due to the greater exposure of bacteria to air oxygen, and the optimal method for purification of &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; is the second sampling method.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">فوزوباکتریوم نوکلئاتوم (&lt;em&gt;F&lt;/em&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;. &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;nucleatum&lt;/em&gt;) یک باکتری بی‌هوازی و گرم منفی و ازنظر ریخت‌شناسی باسیلی کشیده با انتهای تیز است که متعلق به خانواده&lt;em&gt;Bacteroidaceae&lt;/em&gt;  است. &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; فلور طبیعی دهان است؛ اما در برخی بیماری‌ها در سایر اندام‌ها نیز وجود دارد. با توجه به نقش &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; در ایجاد و توسعه بیماری‌های انسانی، بررسی ویژگی‌ها و عملکردهای آن بسیار مهم است. برای انجام چنین مطالعاتی باید امکان جداسازی باکتری از نمونه‌های مختلف وجود داشته باشد؛ اما به‌دلیل بی‌هوازی اجباری بودن &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt;، خالص‌سازی و نگهداری طولانی‌مدت باکتری‌ها با مشکلاتی مواجه است. هدف از انجام این مطالعه دستیابی به روشی بهینه به‌منظور خالص‌سازی &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; است تا بتوان زمینة مطالعه دقیق عملکردها و مکانیسم‌های عمل باکتری به‌منظور ارائه رویکردهای درمانی جدید برای کنترل یا درمان بیماری‌های ایجادشده توسط &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; را برای مطالعات آینده فراهم کرد. با&lt;em&gt; &lt;/em&gt;استفاده از&lt;strong&gt;&lt;em&gt; &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;paper point&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;با سایز 40 از پاکت‌های پریودنتال عمیق 16 بیمار با استفاده از محیط انتقالی Tryptic Soy&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;Broth (روش اول) و محیط کشت کلمبیا آگار همراه با گاز پک نوع A و جار بی‌هوازی (روش دوم) نمونه‌گیری انجام شد. سپس نمونه‌ها به‌منظور تأیید حضور &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt;&lt;strong&gt; &lt;/strong&gt;با مشاهدات ماکروسکوپی و میکروسکوپی، تست‌های بیوشیمیایی، تست PCR و توالی‌یابی بررسی شدند. نتایج نشان دادند محیط انتقالی Tryptic Soy Broth قادر به حفظ و زنده نگه داشتن باکتری نبوده است و &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt;&lt;em&gt; &lt;/em&gt;های&lt;em&gt; &lt;/em&gt;خالص‌شده با انتقال مستقیم آنها به محیط کشت کلمبیا آگار همراه با گاز پک نوع A و جار بی‌هوازی جداسازی شدند. با توجه به بی‌هوازی اجباری بودن &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt;&lt;em&gt;،&lt;/em&gt; استفاده از محیط انتقالی به‌علت مواجهه بیشتر باکتری با اکسیژن هوا برای جداسازی کارآمد نیست و روش بهینه برای خالص‌سازی &lt;em&gt;F. nucleatum&lt;/em&gt; دومین روش نمونه‌گیری است.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">فوزوباکتریوم نوکلئاتوم</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">باکتری بی‌هوازی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">فلور سیستم گوارش</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">پاکت پریودنتال</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">سرطان روده بزرگ</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://bjm.ui.ac.ir/article_28650_db0ae964fbd205c2d9da2d652bf969f2.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>
</ArticleSet>
