زیست شناسی میکروارگانیسم ها

بررسی مقاومت به آنتی بیوتیک‏ها‏ی بتالاکتام در جدایه‏ها‏ی اشریشیا کلی و جستجوی مولکولی اشریشیا کلی O157:H7 در پرندگان زینتی شهرکرد

حسین طهماسبی؛ سارا براتی؛ حسن ممتاز؛ محمد رفیعی دولت آبادی؛ محمد قاسمی؛ وحید احمدی سالیانه؛ سمانه مهرابیان

دوره 3، شماره 9 ، خرداد 1393، ، صفحه 35-44

چکیده

مقدمه : پرندگان زینتی می‏‏توانند عوامل بیماری‏زای انسانی را در خود جای دهند و در انتقال و گسترش عوامل عفونی مقاوم به دارو به انسان نقش داشته باشند. با توجه به علاقه بسیاری از مردم در نگه ‏ داری ... بیشتر مقدمه : پرندگان زینتی می‏‏توانند عوامل بیماری‏زای انسانی را در خود جای دهند و در انتقال و گسترش عوامل عفونی مقاوم به دارو به انسان نقش داشته باشند. با توجه به علاقه بسیاری از مردم در نگه ‏ داری از پرندگان زینتی، مطالعه حاضر با مطالعه بر روی پرندگان زینتی شهرکرد، اشریشیا کلی‏ها‏ی مقاوم به آنتی بیوتیک‏ها‏ی بتالاکتام و جستجوی مولکولی اشریشیا کلی O157:H7 بررسی شدند. شایان ذکر است اشریشیا کلی O157:H7 عامل بیماری‏ها‏ی روده ای انسانی و سندروم مرگبار اورمی همولیتیک در دنیاست‏‏. مواد و روش‏‏ها: در مجموع 256 نمونه مدفوعی از پرندگان زینتی (مرغ عشق، بلدرچین، بلبل، طوطی، مینا، سهره، فینچ، مرغ بهشتی، طاووس و قرقاول) از نقاط مختلف شهرکرد به وسیله ی سواب استریل جمع آوری شدند. سواب‏ها‏ مستقیما درون محیط آبگوشت تریپتون سوی ( TSB ) قرار داده شدند. در آزمایشگاه نمونه‏ها‏ بر روی محیط‏ها‏ی مکانکی آگار و مکانکی محتوی آگار سوربیتول به عنوان محیط‏ها‏ی انتخابی کشت داده شدند. سپس آزمون آنتی‏بیوگرام با استفاده از روش انتشار دیسک انجام شد. کلونی‏ها‏ی مشکوک به اشریشیا کلی O157:H7 به وسیله آزمون واکنش زنجیره ای پلی مراز ( PCR ) ارزیابی شدند. نتایج: اشریشیا کلی از 31 نمونه (1/12 درصد) از 256 نمونه جداسازی شد. میزان مقاومت جدایه‏ها‏ به آنتی‏بیوتیک‏ها‏ی ایمیپنم، سفوتاکسیم، سفیکسیم، سفالکسین، آموکسی سیلین، پنی سیلین جی و اگزاسیلین به ترتیب صفر، 2/3، 1/16، 3/90، 100، 100 و 100 درصد بود. در هیچ کدام از نمونه‏ها‏ اشریشیا کلی O157:H7 یافت نشد. بحث و نتیجه‏گیری: گرچه پرندگان زینتی در این منطقه منبع یا حامل اشریشیا کلی O157:H7 نبودند، اما اشریشیا‏کلی‏ها‏ی مقاوم به آنتی بیوتیک‏ها‏ی بتالاکتام را در خود جای داده بودند و می‏‏توانند عامل مهمی در انتقال عفونت‏ها‏ی مقاوم به دارو از پرندگان زینتی به انسان، به ویژه کودکان تلقی شوند و خطری بالقوه برای سلامت انسان ایجاد کنند. با توجه به آنچه ذکر شد توصیه می‏‏شود، صاحبان پرندگان زینتی و همچنین عموم مردم را از خطرات بالقوه ی نگه داری از پرندگان زینتی آگاه کرد.

ردیابی مولکولی کلامیدوفیلا فلیس در ترشحات چشمی گربه‏ها‏ی خانگی در تهران و اصفهان

حسن ممتاز؛ محمد علی رضایی؛ پیمان کیهانی

دوره 3، شماره 9 ، خرداد 1393، ، صفحه 45-52

چکیده

مقدمه: کلامیدوفیلا فلیس از جمله شایع ‏ ترین اجرام بیماری‏زای جدا شده از ترشحات چشمی در گربه‏ها‏ی خانگی است‏‏. هدف از تحقیق حاضر، ردیابی حضور این میکروارگانیسم در نمونه‏ها‏ی سواب چشمی ... بیشتر

شناسایی ژن‏های حدت ‏yrp1 و yrpE در باکتری یرسینیا راکری به روش PCR در استان چهارمحال و بختیاری

فیروز فدایی فرد؛ سعید سیمین

دوره 3، شماره 9 ، خرداد 1393، ، صفحه 65-74

چکیده

مقدمه: یرسینیا راکری عامل بیماری دهان قرمز آنتروباکتریایی و از بیماری‏های مهم آزاد ماهیان پرورشی است. ‏مطالعه حاضر با هدف شناسایی ژن‏های حدت yrp1 و yrpE در باکتری یرسینیا راکری انجام شد . مواد ... بیشتر مقدمه: یرسینیا راکری عامل بیماری دهان قرمز آنتروباکتریایی و از بیماری‏های مهم آزاد ماهیان پرورشی است. ‏مطالعه حاضر با هدف شناسایی ژن‏های حدت yrp1 و yrpE در باکتری یرسینیا راکری انجام شد . مواد و روش ‏‏ ها: به منظور انجام این تحقیق، ‏ماهیان 10تا 12 سانتی‏متری 6 مزرعه پرورش ماهی استان چهارمحال و بختیاری، بررسی باکتری‏شناسی شدند. ‏به طوری‏که از هر مزرعه 10 عدد ماهی مشکوک به بیماری ‏(‏در مجموع 60 عدد) به طور تصادفی انتخاب و نمونه برداری از انتهای روده آن‏ها، کشت بر روی محیط‏های غنی کننده (‏تریپتیکاز سوی آگار) و اختصاصی ‏(‏واتمن- شاتس) ‏یرسینیا راکری انجام شد‏. ‏سپس سویه‏های مثبت باکتری یرسینیا راکری با آزمایش PCR شناسایی شد . ‏در مرحله بعد بر روی باکتری‏های شناسایی شده با استفاده از زوج پرایمرهای مربوط به دو ژن حدت به نام‏های yrp1 و yrpE آزمون PCR انجام شد . نتایج: از تعداد کل نمونه‏های باکتریایی 24 سویه به عنوان باکتری یرسینیا راکری شناسایی شدند که در بین آن‏ها 12 سویه ‏(‏50 درصد) حامل ژن yrp1 و 11 سویه ‏(‏83/45 درصد) حامل ژن yrpE بودند. ‏به طور هم‏زمان نیز 6 سویه ‏(‏25 درصد) هر دو ژن را داشته اند . بحث و نتیجه ‏ گیری: نتایج تحقیق حاضر نشان از وجود عامل‏‏های حدت yrp1 و yrpE در سویه‏های یرسینیا راکری جدا شده دارد. ‏ yrp1 به عنوان پروتئاز خارج سلولی شناخته شده یرسینیا راکری بوده و نقش مهمی در حدت و بیماری‏زایی این باکتری دارد.

ویژگی‏های سولفور زدایی از دی‏بنزوتیوفن توسط Rhodococcus erythropolis R1 و موتان Dsz-negative آن

زهرا اعتمادی فر؛ سیمون کاپلو؛ سیدحمید زرکش اصفهانی

دوره 2، شماره 8 ، بهمن 1392، ، صفحه 1-14

چکیده

مقدمه: سولفور زدایی زیستی به عنوان یک روش انتخابی برای کاهش میزان گوگرد محصولات نفتی به کار میرود. مواد و روش ‏‏ ها: در این تحقیق ، یک سویه باکتریایی اکسید کننده گوگرد به نام رودوکوکوس اریتروپولیس ... بیشتر مقدمه: سولفور زدایی زیستی به عنوان یک روش انتخابی برای کاهش میزان گوگرد محصولات نفتی به کار میرود. مواد و روش ‏‏ ها: در این تحقیق ، یک سویه باکتریایی اکسید کننده گوگرد به نام رودوکوکوس اریتروپولیس R1 (شماره دسترسی GU570564 ژن بانک NCBI ) برای سولفورزدایی از دیبنزوتیوفن ( DBT ) استفاده شد. نتایج : کشت القا شده سویه R1 توانایی تولید 2-هیدروکسیبایفنیل ( 2-HBP ) از DBT را طی مسیر 4S بدون تجزیه اسکلت کربنی آن داشت. این فرایند به وسیله تحلیل کروماتوگرافی گازی ( GC ) تا ی ید شد. میزان فعالیت اختصاصی سولفورزدایی از DBT بهوسیله سویه R1 45 میکرومول در گرم وزن خشک در ساعت به دست آمد. سولفورزدایی از DBT با افزودن توئین 80 بهعنوان سورفاکتانت و گلیسرول بهعنوان منبع کربن طی 3 روز به میزان 100 درصد تعیین شد. پلاسمید سنگین در سویه R1 تشخیص داده شدکه بهوسیله واکنش PCR وجود ژن‏های dsz مس ؤ ول سولفورزدایی زیستی از DBT در آن نشان داده شد. سویههای موتانی که این پلاسمید را از دست داده بودند فنوتیپ سولفورزدایی را هم از دست دادند. هر دو سویه وحشی ( R1 ) و موتان به غلظتهای بالای 2-HBP و برخی آنتیبیوتیکها حساس بودند. بحث و نتیجه ‏ گیری: سویه R1 از طریق مسیر تجزیه اختصاصی سولفور یا مسیر 4S با شکست انتخابی باندهای C-S بدون کاهش انرژی از DBT سولفورزدایی میکند. افزودن سورفاکتانت سولفورزدایی از DBT را با افزایش قابلیت دسترسی زیستی آن افزایش داده، همچنین میتواند میزان رشد و سولفورزدایی سویه را اصلاح کند. جایگاه ژن‏های سولفورزدایی در سویه R1 بر روی یک پلاسمید سنگین بود. با توجه به نتایج حاصل از این تحقیق رودوکوکوس اریتروپولیس R1 میتواند به عنوان یک سیستم مدل برای سولفورزدایی زیستی موثر از نفت خام بدون کاهش ارزش سوختی نفت بهکار رود.

القا نانو حفره در هموگلوبین باکتریایی

مجتبی توشه؛ گیتی امتیازی؛ پیمان دریکوند

دوره 2، شماره 8 ، بهمن 1392، ، صفحه 23-28

چکیده

مقدمه: تعداد زیادی از پروتئین‏های متصل شونده و انتقال دهنده اکسیژن در ارگانیسم‏های مختلف از جمله باکتری‏ها، پروتوزوآ و قارچ‏ها وجود دارد که همگی پروتئین‏های شبه هموگلوبین هستند. این پروتئین‏ها ... بیشتر

بررسی اینتگرون کلاس 1 و مقاومت آنتی بیوتیکی در سویه‏ها‏ی سالمونلا‏تیفی‏موریوم جداشده از دام و طیور

پریسا مبصری؛ میترا صالحی؛ فرزانه حسینی

دوره 2، شماره 7 ، آبان 1392، ، صفحه 45-52

چکیده

مقدمه : گسترش جدایه‏ها‏ی سالمونلا انتریکا با مقاومت چند‏گانه و مقاومت به آنتی‏بیوتیک در سروتیپ‏ها‏ی سالمونلا یک مشکل حاد جهانی است. اینتگرون‏ها‏ واحدهای ژنتیکی هستند که در انتشار کاست‏های ... بیشتر مقدمه : گسترش جدایه‏ها‏ی سالمونلا انتریکا با مقاومت چند‏گانه و مقاومت به آنتی‏بیوتیک در سروتیپ‏ها‏ی سالمونلا یک مشکل حاد جهانی است. اینتگرون‏ها‏ واحدهای ژنتیکی هستند که در انتشار کاست‏های ژنی متحرک در میان میکروارگانیسم‏ها‏ی گرم منفی شرکت دارند. تحرک اینتگرون‏ها‏ با پلاسمیدها و ترانسپوزون‏ها تسهیل می‏شود . مواد و روش ‏‏ ها: در این پژوهش، فنوتیپ مقاومت به آنتی بیوتیک در 32 سالمونلا تیفی موریوم جدا شده با خواستگاه حیوانی از سال 1390 تا 1391 مطالعه شد. همه نمونه‏ها‏ با استفاده از روش کشت و آزمون استاندارد بیوشیمیایی برای شناسایی سویه‏ها‏ی سالمونلا ارزیابی شدند. پس از استخراج DNA حضور کلاس 1 اینتگرون توسط تکنیک PCR بررسی شد . نتایج: رایج‏تر‏ین فنوتیپ مقاومت نسبت به سفالوتین (100 درصد)، کلرامفنیکل (7/68 درصد)، آمپی سیلین (5/62 درصد)، تتراسایکلین (2/56 درصد)، آموکسی سیلین/ کلاولانیک اسید (50 درصد)، سولفامتوکسازول (7/43 درصد) مشاهده شد. کلاس 1 اینتگرون به ترتیب در 5/55 درصد و 2/64 درصد از جدایه‏ها‏ی سالمونلا جدا شده از دام و طیور یافت شد . بحث و نتیجه ‏ گیری: جدایه‏ها‏ی اینتگرون مثبت در مقایسه با جدایه‏ها‏ی اینتگرون منفی، مقاومت بالاتری نسبت به تتراسایکلین، کلرامفنیکل، سولفامتوکسازول، آمپی سیلین و آموکسی سیلین/ کلاولانیک اسید داشتند. اینتگرون‏ها‏ی حامل ژن‏ها‏ی مقاومت به عوامل ضد میکروبی به عنوان مخازن اصلی برای انتشار مقاومت به آنتی بیوتیک مطرح می ‏ شوند .

شناسایی و تفکیک قارچ‏ها به روش ATR-FTIR در یک مجموعه آثار چرمی مربوط به عصر سلجوقی

علیرضا کوچکزایی؛ حسین احمدی؛ محسن محمدی آچاچلویی

دوره 2، شماره 7 ، آبان 1392، ، صفحه 53-68

چکیده

مقدمه : آسیبهای زیستی نقش مهمی در تخریب آثار تاریخی از جمله چرم، دارند. در این میان میکروارگانیسمها، از مهم‏ترین عوامل تخریب زیستی هستند. شناخت قارچها و سایر میکروارگانیسمهای موجود ... بیشتر مقدمه : آسیبهای زیستی نقش مهمی در تخریب آثار تاریخی از جمله چرم، دارند. در این میان میکروارگانیسمها، از مهم‏ترین عوامل تخریب زیستی هستند. شناخت قارچها و سایر میکروارگانیسمهای موجود بر چرم و سایر آثار تاریخی، در درک بهتر صدمات و خسارات احتمالی ناشی از آنها که زمینهساز انتخاب راهکار صحیح برخورد با اشیاء است، ضرورت و اهمیت دارد. روشهای معمول شناسایی پاتوژنها و قارچها، بسته به نوع روش، معمولاً همراه با مشکلاتی است و در این بین طیفسنجی FTIR بهعنوان روشی موفق در تشخیص و شناسایی میکروارگانیسمها معرفی شدهاست . مواد و روش ‏‏ ها: در این مطالعه، نمونههایی از اشیاء چرمی تاریخی مربوط به عصر سلجوقی، برای شناسایی جنس قارچها، در محیط SDA کشت یافت و بر اساس ویژگیهای ماکروسکوپی، میکروسکوپی و ریخت‏شناسی شناسایی شد. سپس میکروارگانیسمها با هدف امکانسنجی تفکیک و شناسایی بر اساس ویژگی‏ها ساختاری بهروش ATR - FTIR ، ارزیابی شدند. در این راستا، از دو شیوهی ارزیابی ویژگیهای طیفی بر اساس شکل و موقعیت پیک و تحلیل خوشهای بر اساس مساحت زیر نمودار و موقعیت پیک استفاده شد . نتایج: قارچهای شناسایی شده مربوط به جنسهای پنیسیلیوم (9 مورد، 3/33 درصد)، آسپرژیلوس (5 مورد، 5/18 درصد)، کلادوسپوریوم (4 مورد، 8/14 درصد)، رایزوکتونیا (2 مورد، 4/7 درصد)، تریکوفیتون (1 مورد، 7/3 درصد) و مخمر (1 مورد، 7/3 درصد) بود. جنس دو گونه از قارچها (2 مورد، 4/7 درصد) نیز شناسایی نشد و در 3 نمونه (1/11 درصد) نیز رشد میکروارگانیسمها مشاهده نشد. بررسی نوارهای جذبی طیفهای ATR - FTIR نمونههای کشتیافته، گویای برخی تفاوتهای ساختاری در بین میکروارگانیسمها (قارچ، مخمر، باکتری) و نیز در سطح جنس و بعضاً گونهی قارچها بود . بحث و نتیجه ‏ گیری: فعالیت قارچها آسیبهایی چون تجزیه، هیدرولیز و تخریب ساختار چرم و تاننهای گیاهی، تغییرات بصری و نیز مشکلات متعدد برای افرادی که با این آثار در تماساند را در پی دارد. از اینرو، حذف این عوامل و درمان مناسب آثار، برای جلوگیری از گسترش آسیب به ساختار چرم، امری ضروری است. بررسی ساختار قارچ با استفاده از طیفسنجی ATR - FTIR نتایج مناسبی در مورد امکان تفکیک قارچ، مخمر و باکتری بهدست داد. FTIR ، ابزاری کمابیش مناسب برای تفکیک و شناسایی آسان و سریع میکروارگانیسمها و جنسهای مختلف قارچ است. همچنین، در برخی موارد امکان تفکیک در سطح گونه نیز وجود دارد. مزایای این روش در مقایسه با روشهای معمول دیگر، FTIR را به ابزاری مناسب در بررسی قارچها در مقیاس بزرگ تبدیل میکند. از اینرو طیفسنجی IR در کنار سایر روشهای معمول شناسایی، بهبود بهرهوری در طبقهبندی و شناسایی قارچها را در پی دارد. علاوهبر این، با توجه به مشخص کردن ترکیب شیمیایی در این روش، میتوان از آن در درک بهتر فرآیندهای شیمیایی پیچیده در رشد قارچ و تخریب بستر، استفاده کرد .

بررسی ژن‌های stx1، stx2 و eaeA به روش Multiplex PCR در اشریشیاکلی‌های جداسازی شده از گوشت گوسفندان استان چهارمحال و بختیاری

سمانه مهرابیان؛ حسین طهماسبی؛ حسن ممتاز؛ ناصر خسروی؛ حسین کابلی بروجنی؛ ویدا نجف زاده؛ مرضیه طادی بنی؛ فرنوش انصاری

دوره 2، شماره 6 ، تیر 1392، ، صفحه 11-18

چکیده

مقدمه : عوامل بیماری‌زا ممکن است از طریق مصرف گوشت آلوده به انسان منتقل شوند و ایجاد بیماری کنن د. اشریشیاکلی ‌های تولید کننده‌ شیگاتوکسین می‌توانند ایجاد اسهال آبکی خفیف تا کمپلکس‌های جدی از قبیل ... بیشتر

افزایش بازدهی روش طبیعی استفاده از محیط اسپیزیزن برای انتقال پلاسمید به درون باکتری باسیلوس سوبتیلیس با استفاده از یک پپتید کاتیونیک تراوا کننده غشا باکتریایی

حسین آقاملایی؛ محمد هیئت؛ محمد افتخاری شیرکوهی؛ مهرداد موسی زاده مقدم

دوره 2، شماره 6 ، تیر 1392، ، صفحه 31-40

چکیده

مقدمه: تعدادی از گونه‌های باکتریایی قادرند تا مولکول DNA را از محیط اطرافشان در‌یافت نمایند؛ میزان این دریافت به شرایطی مانند بزرگی پلاسمید و نوع میزبان بستگی دارد. در مورد باکتری باسیلوس سوبتیلیس نیز ... بیشتر مقدمه: تعدادی از گونه‌های باکتریایی قادرند تا مولکول DNA را از محیط اطرافشان در‌یافت نمایند؛ میزان این دریافت به شرایطی مانند بزرگی پلاسمید و نوع میزبان بستگی دارد. در مورد باکتری باسیلوس سوبتیلیس نیز این امکان البته با میزان انتقال بسیار پایینی وجود دارد. در حال حاضر روش مرسوم برای انتقال پلاسمید خارجی به درون باکتری باسیلوس سوبتیلیس استفاده از روش طبیعی در یک محیط کشت حداقل (اسپیزیزن) است. در این روش نیز میزان انتقال مطلوب و در خورتوجه نیست. هدف از این مطالعه، بررسی تکنیکی نوین بر پایه پپتید کاتیونیک CM11 به عنوان بک پپتید تراوا کننده غشاء، برای افزایش مؤثر نرخ ترانسفورماسیون DNA به باکتری باسیلوس سوبتیلیس است. مواد و روش‏‏ها: در این روش، از پپتید CM11 به عنوان عاملی برای بهینه‏سازی انتقال pWB980 به باکتری باسیلوس سوبتیلیس استفاده شد. برای این منظور، فرآیند مستعد‏سازی باسیلوس سوبتیلیس با دو روش مجزا و در حضور غلظت‌های مختلف پپتید انجام شد. بدین ترتیب که در روش نخست، باکتری به مدت 14 ساعت در حضور غلظت‌های مختلف پپتید تیمار شد و سپس در معرض پلاسمید قرار گرفت. در روش دوم، غلظت‏ها‏ی مختلف پپتیدی همراه با پلاسمید به شکل همزمان به باکتری عرضه شد. پس از غربال‏گری باکتری‏ها‏ی دریافت کننده پلاسیمد بر روی محیط کشت LB آگار حاوی آنتی بیوتیک کانامایسین تعداد کل باکتری‏ها‏ی ترانسفورم شده به ازای هر میکرو‏گرم DNA پلاسمیدی محاسبه و با کنترل مقایسه شد. نتایج: انتقال پلاسمید pWB980 به باکتری در بهترین حالت معادل 5/6 برابر بیشتر از شرایط استاندارد (کنترل) گزارش شد که از لحاظ آماری دارای اختلاف معنی داری بود (P value <0.001). بحث و نتیجه‏گیری: این مطالعه نشان داد که پپتید CM11 به عنوان یک پپتید تراوا کننده غشاء سلولی می‏تواند ترانسفورماسیون DNA خارجی به باکتری‌ باسیلوس سوبتیلیس را به طور در خور توجهی بهینه نموده و تا حدود زیادی مشکل نرخ پائین انتقال طبیعی را برطرف نماید.

همسانه‏ سازی و بیان قسمت ایمنی‏ زای اگزوتوکسین A از سودوموناس‏آئروژینوزا

سحر نوری قراجلر؛ ملاحت احمدی؛ بهمن حسینی

دوره 1، شماره 4 ، بهمن 1391، ، صفحه 7-14

چکیده

مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا میکروارگانیسم فرصت طلبی بوده که به یکی از عومل اصلی عفونت‏های بیمارستانی در سراسر جهان تبدیل شده است. اگزوتوکسین A یک آنزیم خارج سلولی است که توسط اغلب سویه های بالینی ... بیشتر مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا میکروارگانیسم فرصت طلبی بوده که به یکی از عومل اصلی عفونت‏های بیمارستانی در سراسر جهان تبدیل شده است. اگزوتوکسین A یک آنزیم خارج سلولی است که توسط اغلب سویه های بالینی سودوموناس آئروژینوزا ترشح می‏شود. اگرچه پاتوژنز بیماری‏های ناشی از سودوموناس پیچیده است، ولی شواهد کلینیکی و تجربی فراوان نشان دهنده ارتباط اگزوتوکسین A با موارد ابتلا و مرگ و میر ناشی ازعفونت‏های سودوموناسی است . مواد و روش ‏‏ ها: در مطالعه حاضر، یک قطعه ایمنی زای 490 جفت بازی شامل دومین انتقال دهنده و دومین 1b از اگزوتوکسین A سودوموناس آئروژینوزا سویه PAO1 توسط PCR تکثیرداده شد. محصول PCR در اشرشیا کلی DH5α کلون گشت و سپس در اشرشیا کلی BL21 با استفاده از وکتور پلاسمیدی (pET28a) بیان شد. وزن مولکولی پلی پپتید موردنظر در ژل SDS - PAGE ، 18 کیلو دالتون تعیین شد . نتایج: نتایج PCR و colony PCR تایید کننده صحت همسانه‏سازی دومین ایمنی‏زای اگزوتوکسین A بود. بررسی موقعیت پلی پپتید کلون شده درالکتروفورز عمودی با استفاده از ژل SDS - PAGE نشان داد که پلی پپتید مورد نظر توسط اشرشیاکلی به فضای پری پلاسمی تراوش می‏شود . بحث و نتیجه ‏ گیری: از آنجایی‏که حضور توکسین کامل برای ایجاد پاسخ های ایمنی ضروری نیست واین پلی پپتید نوترکیب از خاصیت آنتی ژنیک برخوردار است، بنابراین ممکن است به عنوان واکسن مؤثری در پیشگیری ازعفونت‏های ناشی از سودوموناس عمل کند .

طراحی و بررسی مقایسه ای روش‏های مولکولی تشخیص سریع مقاومت به داروهای تزریقی ضد سل در سویه‏های کلینیکی میکوباکتریوم توبرکلوزیس

فاطمه صالحی؛ بهاره رحیمیان ظریف؛ اعظم احمدی؛ محمد ارجمند زادگان؛ توکتم پولاد؛ مانا شجاع پور

دوره 1، شماره 3 ، آذر 1391، ، صفحه 13-28

چکیده

مقدمه: در این تحقیق، برای تشخیص سریع مقاومت به کانامایسین، آمیکاسین، کاپرئومایسین، چند روش مولکولی طراحی و مقایسه شدند. مواد و روش‏‏ها: از میان 120 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، 70 سویه برای ... بیشتر مقدمه: در این تحقیق، برای تشخیص سریع مقاومت به کانامایسین، آمیکاسین، کاپرئومایسین، چند روش مولکولی طراحی و مقایسه شدند. مواد و روش‏‏ها: از میان 120 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، 70 سویه برای بررسی موتاسیون‏های احتمالی انتخاب شدند. در روشPCR-RFLP ‏از آنزیم ajii برای تشخیص سویه وحشی و از آنزیمBstFNI برای شناسایی سویه موتانت استفاده شد. علاوه بر این، در طراحی روش آلل اسپسیفیک هم‏زمان (mAs PCR) از سه پرایمر اختصاصی برای تعیین حالت‏های وحشی و نیز موتان کدون‏های 1401 و 1402 استفاده شد. تعدادی از سویه‏ها تعیین توالی (سکوئنس) شدند. نتایج: در روشPCR-RFLP ‏از میان 70 سویه مورد بررسی، با آنزیم BstFNI، 17 سویه موتان از میان 24 سویه مقاوم فنوتیپی و 44 سویه غیر موتان از 46 سویه، حساس تشخیص داده شدند. حساسیت این روش 83/70 و ویژگی آن 65/95 درصد بود. آنزیم ‏ajii از میان 52 سویه مورد بررسی، ‏12سویه موتان از میان 20 سویه مقاوم و29 سویه غیر موتان را از میان 32 سویه حساس فنوتیپی تشخیص داد. حساسیت این روش 60 و ویژگی آن 62/90 درصد بوده است. در روش آلل اسپسیفیک 23 سویه بررسی شدند. این روش قادر به تشخیص 3سویه موتان ازمیان6 سویه مقاوم و12 سویه غیرموتان ازمیان 17 سویه حساس فنوتیپی شد. حساسیت این روش50 و ویژگی آن 58/70 درصد بوده است. نتایج تعیین ترادفاثبات کننده صحت نتایج روش‏های مولکولی استفاده شده، بود. بحث و نتیجه‏گیری: روشPCR-RFLP ‏با آنزیم BstFNI، به عنوان یک روش سریع در تشخیص مقاومت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به داروهای تزریقی خط دوم درمان سل پیشنهاد می‏شود.

ردیابی مولکولی و بیوشیمیایی استافیلوکوکوس اورئوس در موارد ناباروری و سقط گاو در شهرکرد

سارا براتی؛ تقی تکتاز هفشجانی؛ امیر مومنی؛ سمانه مهرابیان؛ حسن ممتاز؛ حمید اسماعیلی؛ احمد رضا صفیان

دوره 1، شماره 3 ، آذر 1391، ، صفحه 53-60

چکیده

مقدمه: ناباروری و سقط جنین می‏توانند به زیان‏های جدی اقتصادی منجر شوند. استافیلوکوکوس اورئوس می‏تواند ناباروری و سقط جنین ایجاد نماید. با توجه به اهمیت آنچه ذکر شد، مطالعه حاضر برای ردیابی استافیلوکوکوس ... بیشتر

ردیابی مولکولی استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس در شیرهای ورم پستانی گاوها در استان اصفهان

حسن ممتاز؛ محمد سید فروتن؛ تقی تکتاز؛ مجتبی صادقی

دوره 1، شماره 2 ، شهریور 1391، ، صفحه 71-76

چکیده

مقدمه: ورم پستان یکی از شایع‏ترین و مهم‏ترین بیماری‏های گله‏های گاو شیری است. ورم پستان یک بیماری التهابی غده پستان است که ‏به‏وسیله‏ عوامل عفونی زیادی ایجاد می‏‏شود. استرپتوکوکوس آگالاکتیه ... بیشتر مقدمه: ورم پستان یکی از شایع‏ترین و مهم‏ترین بیماری‏های گله‏های گاو شیری است. ورم پستان یک بیماری التهابی غده پستان است که ‏به‏وسیله‏ عوامل عفونی زیادی ایجاد می‏‏شود. استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس به فراوانی از نمونه‏های شیر ورم پستانی گاو جدا شده اند. مواد و روش‏‏ها:. درکل 123 نمونه شیر از گاوان مبتلا به ورم پستان بالینی جمع آوری و بلافاصله به آزمایشگاه انتقال داده شد. شیر این مطالعه، به منظور بررسی میزان شیوع استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس در شیر گاوان مبتلا به ورم پستان بالینی در گاوداری‏های صنعتی اطراف اصفهان، انجام شد ‏های ورم پستانی ‏به‏وسیله‏ آزمایش‏ ورم پستان کالیفرنیایی تأیید و همه نمونه‏ها با استفاده از آزمایش‏‏های میکروبی و بیوشیمیایی آزمایش شدند. در نهایت همه 123 نمونه با واکنش زنجیره ای پلیمراز دوباره ارزیابی شدند. نتایج: نتایج روش کشت نشان داد که باکتری‏های استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس به ترتیب در 13 و 31/7 درصد‏ از نمونه‏های شیر، تشخیص داده شدند. واکنش زنجیره ای پلیمراز نشان داد که باکتری‏های استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس به ترتیب در 51/19‏ و56/10 درصد‏ از نمونه‏های شیر تشخیص داده شدند. بحث و نتیجه‏گیری: نتایج این بررسی نشان داد، واکنش زنجیره ای پلیمراز برای تشخیص دو باکتری استرپتوکوکوس آگالاکتیه و استرپتوکوکوس یوبریس از دقت بالایی برخوردار است. ما استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز را برای کنترل کیفیت میکروبی نمونه‏های شیر، پیشنهاد می‏‏کنیم.

جستجوی مولکولی لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای در کبوترهای شهرستان یزد

عبدالکریم زمانی مقدم؛ حسین طهماسبی؛ حسن ممتاز؛ ناصر صالحی؛ سمانه مهرابیان

دوره 1، شماره 1 ، خرداد 1391، ، صفحه 41-46

چکیده

مقدمه: پرندگان می‏توانند عوامل بیماری‏زا‏ی انسانی، از قبیل لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای را در خود جای دهند و به انسان منتقل کنند. با توجه به علاقه بسیاری از مردم در نگهداری ‏از کبوتر، ... بیشتر مقدمه: پرندگان می‏توانند عوامل بیماری‏زا‏ی انسانی، از قبیل لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای را در خود جای دهند و به انسان منتقل کنند. با توجه به علاقه بسیاری از مردم در نگهداری ‏از کبوتر، در این مطالعه به ارزیابی آلودگی به لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای در مدفوع کبوترهای یزد پرداخته شد. مواد و روش‏ها‏: تعداد 150 نمونه مدفوع از کبوتر از مناطق مختلف شهرستان یزد به وسیله سوآب استریل جمع آوری شد. سوآب‏ها‏ مستقیما درون محیط آبگوشت غنی کننده لیستریا قرار داده شدند. یک میلی‏لیتر‏ از محیط‏ها‏ی کشت مغذی اولیه به 9 میلی‏لیتر آبگوشت فریزر اضافه شد. پس از غنی‏سازی، نمونه‏ها‏ بر روی محیط کشت پالکام آگار کشت داده شدند. سپس نمونه‏ها‏ با استفاده از روش PCR برای بررسی وجود لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای ارزیابی شدند. نتایج: گرچه شیوع جنس لیستریا دو درصد (3 از 150) بود، اما در هیچ کدام از نمونه‏ها‏ لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای یافت نشد. بحث و نتیجه گیری: منبع گونه‏ها‏ی لیستریا در پرندگان، غذای مورد استفاده و محیط زندگی آنهاست. احتمالاً به دلیل این‏که سطح بهداشتی، وضعیت تغذیه‏ای و محیط زندگی در کبوترهای شهرستان یزد نسبت به پرندگان وحشی بالاتر است، در هیچ کدام از نمونه‏ها‏ لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای یافت نشد. این مطالعه نشان داد که نمی‏توان کبوترهای این منطقه را به عنوان منبع یا حامل لیستریا مونوسیتوژنز و لیستریا ایوانوای تلقی نمود.

دوره 11 (1401)

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

موضوعات = ژنتیک و زیست شناسی مولکولی میکروارگانیسم ها

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده