زیست شناسی میکروارگانیسم ها

همسانه‌سازی ژن پیروات دکربوکسیلاز مؤثر در تولید بیواتانول در باکتری اشرشیا کلای

معصومه زینالی؛ بهمن حسینی؛ سدابه جهانبخش؛ محمود رضا زاد باری؛ میثم طباطبایی

دوره 5، شماره 18 ، شهریور 1395، ، صفحه 11-28

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.20380

چکیده

مقدمه: اتانول ساخته‌شده از زیست‌توده یکی از راهبردهای بی‌نظیر و سودمند از لحاظ اقتصادی و محیطی است و می‌تواند به‌عنوان یک سوخت پاک و ایمن، جایگزین سوخت‌های فسیلی شود‏. ‏‏ مواد و روش‏ ‏ها: ... بیشتر مقدمه: اتانول ساخته‌شده از زیست‌توده یکی از راهبردهای بی‌نظیر و سودمند از لحاظ اقتصادی و محیطی است و می‌تواند به‌عنوان یک سوخت پاک و ایمن، جایگزین سوخت‌های فسیلی شود‏. ‏‏ مواد و روش‏ ‏ها: در این پژوهش کلیدی‌ترین آنزیم مؤثر در مسیر تولید اتانول زیستی (پیروات دکربوکسیلاز) از زایموموناس موبیلیس انتخاب و در اشرشیا کلای به‌روش ذوب-انجماد همسانه‌سازی شد. برای همسانه‌سازی ژن مدِنظر از آغازگرهای اختصاصی ژن پیروات دکربوکسیلاز و واکنش پی‌سی‌آر استفاده شد. سپس ژن پیروات دکربوکسیلاز و پلاسمید pET 28a را آنزیم‌های محدودکننده Sal I و Xho I برش دادند؛ محصولاتی که آنزیم لیگاز برش دادند در دمای ۱۶ درجه سانتی‌گراد و در مدت ۱۶ ساعت به همدیگر متصل شدند. ‏‏ نتایج: کشت باکتری‌ها در محیط کشت LB انتخابی نشان داد که تنها کلونی‌های حاوی پلاسمید pET 28a قادر به رشد هستند. نتایج کلونی پی‌سی‌آر با آغازگرهای اختصاصی باندهایی در اندازه تقریبی ۱۷۰۰ جفت باز را نشان داد. نتایج مربوط به پی‌سی‌آر پلاسمیدهای نوترکیب توسط آغازگر رفت راه‌انداز T7 و آغازگر برگشت ژن پیروات دکربوکسیلاز، جهت صحیح درج ژن در داخل پلاسمید را ثابت کرد و باندی به‌اندازه ۱۸۸۵ جفت باز را نشان داد و نتایج هضم آنزیمی پلاسمیدpET 28a pdc نوترکیب توسط آنزیم‌های Sal I و Xho I باندهای مشابهی را آشکار کرد. درنهایت واکنش RT باند مورد انتظار ۱۷۰۰ جفت باز را نشان داد که حاکی از بیان ژن مورد نظر در این نمونه‌ها بود. ‏ بحث و نتیجه‏ گیری: از مهم‌ترین مشکلات در بیوسنتز اتانول، محدودیت عملکرد آنزیم‌های درگیر در مسیر بیوسنتز اتانول از مواد اولیه نظیر ضایعات کشاورزی است؛ این آنزیم‌ها در تبدیل مواد اولیه پلی‌مری به مواد اولیه با ساختار ساده و قابل تخمیر نقش اساسی دارند. به نظر می‌رسد افزایش بیان ژن پیروات دکربوکسیلاز تحت کنترل پروموتور قوی T7 منجر به افزایش تولید محصول نهایی خواهد شد‏. ‏‏

شناسایی، همسانه‌سازی و بررسی ویژگی‌های ژن انتقال‌دهنده هگزوز 6 (HXT6) مخمر ساکارومیسس سرویزیه سویه بومی IBRC-M30069

سولماز عزیزی؛ علیرضا تاری نژاد؛ محمد پاژنگ

دوره 5، شماره 18 ، شهریور 1395، ، صفحه 29-40

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.20381

چکیده

مقدمه: مخمر ساکارومایسس سروزیه از جمله مهم‌ترین میکروارگانیسم‌ها برای تولید اتانول است که به‌دلیل کارایی بالای این موجود در جذب و تخمیر قندهای هگزوز است. این گونه مخمر دارای 20 ژن کدکننده پروتئین‌های ... بیشتر مقدمه: مخمر ساکارومایسس سروزیه از جمله مهم‌ترین میکروارگانیسم‌ها برای تولید اتانول است که به‌دلیل کارایی بالای این موجود در جذب و تخمیر قندهای هگزوز است. این گونه مخمر دارای 20 ژن کدکننده پروتئین‌های انتقال‌دهنده هگزوز است. از میان این خانواده ژنی، هفت ژن HXT1-HXT7 نقش مهمی در فرایند تولید الکل دارند. پژوهشگران ثابت کردند که با افزایش میزان بیان این ژن‌ها سرعت تخمیر الکلی افزایش و در نتیجه آن میزان تولید اتانول افزایش می‌یابد.‏‏ مواد و روش ‏‏ها: جداسازی ژن HXT6 با پرایمرهای اختصاصی ژن از طریق PCR از ساکارومیسس سرویزیه سویه بومی IBRC-M30069 انجام شد. با انجام لیگاسیون قطعه تکثیریافته به پلاسمید pGEM-T کلون و به باکتری اشرشیا کلای ترانسفرم شد و تحلیل توالی انجام شد. نتایج: توالی نوکلئوتیدی چارچوب بازخوانی این ژن به‌طول 1713 جفت باز است و یک پروتئین با 570 اسیدآمینه را رمز می‌کند. براساس تجزیه و تحلیل‌های نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی، وزن مولکولی تخمین‌زد‌ه‌شده و نقطه ایزوالکتریک پیش‌بینی‌شده پروتئین به‌ترتیب 68/62 کیلودالتون و 89/7 بود.‏ بحث و نتیجه‏ گیری: توالی پروتئینی به‌دست‌آمده شباهت زیادی با Hxt6p VL31(EGA76254.1) سویه دیگر ساکارومیسس سرویزیه موجود در NCBI دارد و از بین ژن‌های انتقال‌دهنده هگزوز، بیشترین شباهت و ارتباط را با HXT7 دارد و به نظر می‌رسد این‌ها از یک ژن اجدادی در اثر موتاسیون در طی زمان با تغییر کارکرد دومین‌شان حاصل شده‌اند.

تولید بیوفیلم در میان سویه‌های استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس جداسازی‏شده از افراد سالم

فاتح رحیمی؛ محمد رضا عربستانی

دوره 5، شماره 18 ، شهریور 1395، ، صفحه 107-116

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.20387

چکیده

مقدمه: استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس به‌عنوان باکتری بیماری‌زای بیمارستانی شناخته می‌شود که به‌علت تشکیل بیوفیلم در بیماران و افراد سالم مهم است. این مطالعه با هدف بررسی تولید بیوفیلم در میان سویه‌های ... بیشتر مقدمه: استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس به‌عنوان باکتری بیماری‌زای بیمارستانی شناخته می‌شود که به‌علت تشکیل بیوفیلم در بیماران و افراد سالم مهم است. این مطالعه با هدف بررسی تولید بیوفیلم در میان سویه‌های استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس جداسازی‌شده از افراد سالم در طی سال‌های 1393-1392 به انجام رسیده است‏. ‏‏ مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه در مجموع 200 فرد سالم انتخاب شدند. با استفاده از سوآب استریل، نمونه‌گیری از ناحیۀ بازو، ساعد و زیربغل این افراد انجام گرفت و سوآب‌ها به محیط آبگوشت تایوگلیکولات انتقال داده شدند. سپس نمونه‌ها بر روی محیط ژلوز مانیتول نمک کشت شدند و شناسایی سویه‌ها تا حد گونه با استفاده از آزمون‌های بیوشیمیایی انجام گرفت. برای تعیین تولید بیوفیلم از روش کیفی ژلوز قرمز کنگو و کمی میکروتیتر پلیت استفاده شد و حضور ژن‌های icaA و icaD با استفاده از آزمون واکنش زنجیره‌ای آنزیم پلیمراز مشخص شد. ‏‏ نتایج: در مجموع 104 سویۀ استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس از افراد سالم جداسازی شد که 66 (63درصد) سویه به‌عنوان سویه‌های مولد بیوفیلم و 38 (37درصد) سویه نیز به عنوان بیوفیلم منفی شناسایی شدند. در تمامی 66 سویۀ مدنظر، هر دو ژن icaA و icaD شناسایی شدند. ‏ بحث و نتیجه‏گیری: شیوع سویه‌های استافیلوکوکوس اپیدرمایدیس مولد بیوفیلم در میان افراد سالم نشان‌دهندۀ کلونیزه‌شدن این افراد با سویه‌های بیمارستانی است. شیوع چنین سویه‌هایی خطری جدی برای سلامت جامعه است‏. ‏‏

تأثیر یون‌های فلزی بر فعالیت و پایداری آنزیم‌های پیرازین‌آمیداز نوع وحشی و جهش‌یافته

مهرنوش صفرزاده؛ محمد پاژنگ؛ فرامرز مهرنژاد؛ فرحنوش دوستدار؛ نادر چاپارزاده؛ داود ربیعی فرادنبه

دوره 5، شماره 18 ، شهریور 1395، ، صفحه 169-182

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.20391

چکیده

مقدمه: پیرازین‌آمیداز یک متالوآنزیم مونومری با فعالیت هیدرولازی است و مسئول تبدیل داروی ضدسل پیرازین‌آمید به شکل فعالش یعنی پیرازینوئیک اسید است. جایگاه اتصال به فلز در آنزیم پیرازین‌آمیداز مایکوباکتریوم ... بیشتر مقدمه: پیرازین‌آمیداز یک متالوآنزیم مونومری با فعالیت هیدرولازی است و مسئول تبدیل داروی ضدسل پیرازین‌آمید به شکل فعالش یعنی پیرازینوئیک اسید است. جایگاه اتصال به فلز در آنزیم پیرازین‌آمیداز مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حاوی یک آسپارتیک اسید (آسپارتیک اسید49) و سه هیستیدین (هیستیدین 51، هیستیدین57 و هیستیدین71) است. بروز جهش در ژن پیرازین‌آمیداز (pncA) مسؤول اصلی مقاومت پیرازین‌آمیدی است و می‌تواند جایگاه اتصال به فلز را تغییر دهد. ازاین‌جهت، بررسی تأثیر یون‌های فلزی مختلف بر فعالیت و پایداری آنزیم پیرازین‌آمیداز نوع وحشی و جهش‌یافته می‌تواند مهم باشد.‏‏ مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه ناقل بیانی حاوی ژن پیرازین‌آمیدازهای نوع وحشی و جهش‌یافته به اشرشیا کلی سویۀ BL21 منتقل شد سپس پروتئین‌های نوترکیب بیان و تخلیص شدند. میزان تخلیص با روش الکتروفورزSDS-PAGE ارزیابی شد؛ سپس فعالیت و پایداری آنزیم‌های خالص‌شده در حضور غلظت یک میلی‌مولار از یون‌های دوظرفیتی نیکل (Ni2+)، آهن (Fe2+) و منگنز (Mn2+) بررسی شد.‏‏ نتایج: بررسی ژل حاصل از الکتروفورز SDS-PAGE نشان داد که آنزیم‌های بیان‌شده، خالص شده‌اند. بررسی فعالیت و پایداری در حضور فلزات نشان داد که نیکل باعث افزایش فعالیت و پایداری آنزیم‌های نوع وحشی و جهش‌یافته‌ها (جهش‌یافته ۱: L151S و جهش یافته 2 (سه‌گانه): A143T/T168A/E173K) شد. آهن باعث کاهش فعالیت و پایداری جهش‌یافتۀ 1 شد؛ اما بر سایر آنزیم‌ها تأثیر چشمگیری نداشت. منگنز باعث کاهش فعالیت و پایداری آنزیم‌ها شد.‏ بحث و نتیجه‏ گیری: یون نیکل نسبت به یون‌های آهن و منگنز میان‌کنش‌های مساعدتری با جایگاه اتصال به فلز در پیرازین‌آمیداز نوع وحشی و جهش‌یافته‌ها برقرار کرد و بنابراین باعث افزایش فعالیت و پایداری آنزیم‌ها شد.‏‏

تعیین توالی ژن، کلونینگ و بیان آل- آسپاراژیناز نوترکیب از سودوموناس آیروجینوزا سویه SN4 در اشریشیاکلی

ارسطو بدویی دلفارد؛ زهرا کرمی؛ نرجس رمضانی پور

دوره 4، شماره 16 ، اسفند 1394، ، صفحه 11-20

چکیده

مقدمه: ال- آسپاراژیناز جایگاه با ارزشی از جنبه کاربردهای پزشکی و صنایع غذایی دارد. تقاضا برای این آنزیم دارویی هرساله چندین برابر می‏شود. مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش، یک آسپاراژیناز از سودوموناس ... بیشتر مقدمه: ال- آسپاراژیناز جایگاه با ارزشی از جنبه کاربردهای پزشکی و صنایع غذایی دارد. تقاضا برای این آنزیم دارویی هرساله چندین برابر می‏شود. مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش، یک آسپاراژیناز از سودوموناس ایروجینوزا سویه SN4، تعیین توالی و در اشریشیاکلی کلون شد. پرایمر‏ها بر اساس آل- آسپاراژیناز از سودوموناس ایروجینوزا سویه DSM50071 طراحی شدند که بر اساس توالی ژن 16S rRNA شباهت بالایی را نسبت به سویه SN4 نشان می‏داد. ژن آسپاراژیناز در معرض هضم آنزیمی توسط آنزیم‏های برشی NdeI و XhoI قرار گرفت و سپس، به داخل پلاسمید pET21a الحاق شد. محصول الحاق به درون سلول‏های مستعد E. coli (DE3) pLysS DH5a با روش CaCl2 ترانسفورم شد. سلول‏های E. coli ترانسفورم شده در محیط LB آگار حاوی 100 میکروگرم/ میلی‏لیتر آمپیسیلین و IPTG (1mM) رشد داده شدند. نتایج: ال-‏آسپاراژیناز نوترکیب در باکتری BL21 E. coli پس از 9 ساعت انکوباسیون، به میزان بالایی القا شد و فعالیت آسپاراژینازی بالایی به میزان 4/93 واحد در میلی‏لیتر را نشان داد. ال- آسپاراژیناز نوترکیب تعیین توالی شد و نتایج همردیفی نشان داد که توالی پیشنهادی اسید آمینه‏ایی آن از 350 اسید آمینه تشکیل شده که شباهت بالایی با ال- آسپاراژیناز‏های سایر سودوموناس ایروجینوز‏ها در حدود 99 درصد را نشان می‏دهد. نتایج نشان می‏دهد که آل- آسپاراژیناز SN4، باقی‏مانده‏های کاتالیزی و نواحی حفظ شده مشابه با سایر آسپاراژینازها را داراست. بحث و نتیجه‏ گیری: پژوهش حاضر نخستین گزارش در مورد کلونینگ و بیان آل- آسپاراژیناز نوترکیب از سودوموناس آایروجینوزا در اشریشیاکلی است که منبع بالقوه‏ایی از ال- آسپاراژیناز را برای بررسی اثر ضدسرطانی آن هم در شرایط آزمایشگاه و هم در موجود زنده فراهم می‏کند.

گزارش گونه‏ های نوکاردیای جدا‏سازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن 16S rRNA، اصفهان، ایران

سمانه بوربور؛ جمشید فقری؛ شراره مقیم

دوره 4، شماره 16 ، اسفند 1394، ، صفحه 33-42

چکیده

مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست‏های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری‏های ساکن خاک را شامل می‏شوند، که در جهان پخش شده‏اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون‏های تشخیصی رایج، مرسوم و ... بیشتر مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست‏های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری‏های ساکن خاک را شامل می‏شوند، که در جهان پخش شده‏اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون‏های تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزوله‏های نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ‏‏ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روش‏ها، سویه استاندارد DSM 43757 Nocardia asteroides استفاده شد. در ادامه، روش PCR با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام شد. نتایج: با تحلیل اطلاعات فنوتیپی و مولکولی، به‏ویژه تعیین توالی ژن 16S rRNA، ژن‏های نوکاردیای‏های جداسازی شده از خاک اصفهان، که در ادامه به آن‏ها اشاره شده است، درپایگاه داده NCBI باAccession number مربوط به هر ژن ثبت شدند. نوکاردیاهای ثبت شده در NCBI: Nocardia cyriacigeorgica KC577151, Nocardia asteroides KC577152, Nocardia cummidelens KC577153, Nocardia asteroides KC577155, Nocardia asteroides KC577155, Nocardia coubleae KC577156 .. بحث و نتیجه ‏گیری: در این پژوهش 6 گونه نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد، که برخی از این گونه‏های جداسازی شده از خاک ایران، اصفهان، در زمان جداسازی و تشخیص،گونه‏های جدیدی بودند. برای تشخیص بیشترگونه‏های مختلف نوکاردیا می‏توان در مطالعات بعدی از تکثیر و تعیین توالی ژن‏های دیگر این باکتری از جمله ITS,hsp65 secA, rpoB و sod بهره گرفت.

جداسازی یرسینیا و سالمونلا از سگ و گربه ‏های به ظاهر سالم در تهران، ایران

شبنم هاشمی؛ محمد رضا محزونیه؛ مهوش قربانی

دوره 4، شماره 16 ، اسفند 1394، ، صفحه 49-54

چکیده

مقدمه: حیوانات خانگی مانند گربه و سگ منبع بالقوه انتقال آلودگی به انسان، به ویژه کودکان هستند. آن‏ها حامل عوامل بیماری‏های مشترک دستگاه گوارش هستند که می‏توانند به صاحبانشان منتقل شوند. باکتری‏های ... بیشتر

سنجش ‏فعالیت ‏ضد ‏میکروبی ‏باکتری‏ های ‏جداسازی ‏شده ‏از ‏دریای ‏خزر ‏و ‏شناسایی ‏مولکولی ‏سویه ‏های ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میکروبی

سجاد هارون آبادی؛ سید خلیل شکوهی مصطفوی؛ پروانه اقبالی شمس آباد؛ سید منصور میبدی

دوره 4، شماره 15 ، آذر 1394، ، صفحه 167-178

چکیده

مقدمه: ‏دسترسی ‏آسان ‏و ‏استفاده ‏گسترده ‏از ‏ترکیبات ‏ضد ‏میکروبی، ‏به ‏پیدایش ‏مقاومت ‏در ‏میان ‏میکروارگانیسم‏ها ‏منجر ‏شده ‏است. ‏بنابراین، ‏غربال‏گری ‏و ... بیشتر مقدمه: ‏دسترسی ‏آسان ‏و ‏استفاده ‏گسترده ‏از ‏ترکیبات ‏ضد ‏میکروبی، ‏به ‏پیدایش ‏مقاومت ‏در ‏میان ‏میکروارگانیسم‏ها ‏منجر ‏شده ‏است. ‏بنابراین، ‏غربال‏گری ‏و ‏شناسایی ‏ترکیبات ‏ضد ‏میکروبی ‏با ‏اثر ‏بخشی ‏بالا ‏از ‏میکروارگانیسم‏های ‏ساکن ‏در ‏محیط‏های ‏مختلف ‏امری ‏ضروری ‏است. ‏استفاده ‏از ‏میکروارگانیسم‏ها ‏برای ‏اهداف ‏زیست ‏شناختی، ‏آن‏ها ‏را ‏به ‏عنوان ‏یک ‏ابزار ‏مؤثر ‏برای ‏کنترل ‏پاتوژن‏ها ‏تبدیل ‏کرده ‏است. ‏یکی ‏از ‏این ‏میکروارگانیسم‏ها، ‏باکتری ‏استرپتومایسس ‏گریزئوس ‏است. ‏هدف ‏از ‏مطالعه ‏حاضر، ‏جداسازی ‏باکتری‏های ‏آبزی ‏با ‏اثر ‏ضد ‏میکروبی ‏بر ‏پاتوژن‏های ‏مقاوم ‏گرم ‏مثبت ‏و ‏گرم ‏منفی ‏و ‏در ‏نهایت، ‏شناسایی ‏مولکولی ‏سویه‏های ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میکروبی ‏است. ‏ مواد ‏و ‏روش‏ها: ‏در ‏مطالعه ‏حاضر، ‏162 ‏سویه ‏از ‏دریای ‏خزر ‏جداسازی ‏شد. ‏پس ‏از ‏کشت ‏روی ‏محیط ‏اختصاصی ‏میکروب‏ها، ‏خاصیت ‏ضد ‏میکروبی ‏باکتری‏های ‏آبزی ‏روی ‏سویه‏های ‏مرجع، ‏سنجیده ‏شد. ‏4 ‏سویه ‏که ‏بیش ‏ترین ‏خاصیت ‏ضد ‏میکروبی ‏را ‏داشتند ‏انتخاب ‏و ‏با ‏روش ‏واکنش ‏زنجیره‏ای ‏پلیمراز ‏و ‏تعیین ‏توالی ‏ژن ‏S ‏rDNA16 ‏به ‏عنوان ‏سویه ‏جدید ‏شناسایی ‏و ‏در ‏بانک ‏اطلاعات ‏ژنی ‏NCBI ‏ثبت ‏شد. ‏ نتایج: ‏از ‏مجموع ‏162 ‏نمونه ‏جداشده، ‏4 ‏باکتری ‏بیش ‏ترین ‏فعالیت ‏آنزیمی ‏را ‏داشتند، ‏نتایج ‏سنجش ‏فعالیت ‏ضد ‏میکروبی ‏آن‏ها ‏نشان ‏دادکه ‏بیش‏ترین ‏اثر ‏ضد ‏میکروبی ‏را ‏روی ‏استافیلوکوکوس ‏اورئوس ‏و ‏باسیلوس ‏سوبتیلیس ‏و ‏کم ‏ترین ‏اثر ‏را ‏روی ‏اشریشیاکلی ‏و ‏سودوموناس ‏آئروجینوزا ‏داشتند. ‏در ‏انتها، ‏پس ‏از ‏تعیین ‏توالی ‏ژنی ‏باکتری‏های ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میکروبی، ‏مشخص ‏شد ‏که ‏سویه‏ها ‏به ‏استرپتومایسس ‏گریزئوس ‏متعلق ‏هستند. ‏ بحث ‏و ‏نتیجه ‏گیری: ‏در ‏مطالعه ‏حاضر ‏4 ‏سویه ‏باکتریایی ‏دارای ‏اثر ‏ضد ‏میکروبی ‏شناسایی ‏شد. ‏با ‏توجه ‏به ‏قدرت ‏این ‏سویه‏ها ‏در ‏کنترل ‏رشد ‏باکتری‏های ‏پاتوژن ‏مقاوم ‏به ‏آنتی‏بیوتیک ‏می‏توان ‏با ‏خالص‏سازی ‏‏بیشتر ‏مواد ‏ضد ‏میکروبی ‏این ‏میکروارگانیسم‏ها ‏در ‏شرایط ‏بهینه ‏و ‏کنترل ‏شده، ‏در ‏صنایع ‏دارویی ‏و ‏برای ‏درمان ‏پاتوژن‏های ‏خطرناک ‏از ‏آن‏ها ‏استفاده ‏کرد. ‏

ردیابی شایع ‏ترین ژن‏ های مقاومت آنتی ‏بیوتیکی در ایزوله ‏های اسینتوباکتر بومانی جدا شده از عفونت‏ های بیمارستانی و بررسی الگوی مقاومت آنتی‏ بیوتیکی در آن ‏ها

مرضیه توکل؛ حسن ممتاز

دوره 4، شماره 14 ، شهریور 1394، ، صفحه 71-82

چکیده

مقدمه: اسینتو باکتر بومانی یک کوکوباسیل گرم منفی است که در طبیعت انتشار وسیعی داشته و به عنوان یکی از عوامل مهم عفونت‏های بیمارستانی محسوب می‏شود. به واسطه ایجاد مقاومت‏های آنتی‏بیوتیکی در این ... بیشتر مقدمه: اسینتو باکتر بومانی یک کوکوباسیل گرم منفی است که در طبیعت انتشار وسیعی داشته و به عنوان یکی از عوامل مهم عفونت‏های بیمارستانی محسوب می‏شود. به واسطه ایجاد مقاومت‏های آنتی‏بیوتیکی در این باکتری، مشکلات فراوانی در درمان موفقیت آمیز بیماران و در پی آن مرگ و میر آن‏ها ایجاد شده است. مطالعه حاضر با هدف ردیابی شایع‏ترین ژن‏های کد کننده مقاومت آنتی‏بیوتیکی در ایزوله‏های اسینتو باکتر بومانی جدا شده از عفونت‏های بیمارستانی انجام شده است‏‏. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ها: این مطالعه توصیفی در دو بیمارستان شهر تهران بر روی 121 ایزوله اسینتوباکتر بومانی جدا شده از عفونت‏های بالینی انجام شد. پس از شناسایی ایزوله‏ها با استفاده از روش‏های بیوشیمیایی، الگوی مقاومت آنتی‏بیوتیکی ایزوله‏ها به دو روش انتشار دیسک و روش مولکولی (برای ردیابی ژن‏های کد کننده مقاومت آنتی‏بیوتیکی) تعیین شد. ‏‏‏نتایج: از تعداد 121 ایزوله اسینتوباکتر بومانی جدا شده از نمونه‏های عفونی، بیش‏ترین مقاومت به آنتی‏بیوتیک تتراسایکلین با فراوانی 90/90 درصد و بیش‏ترین حساسیت به آنتی‏بیوتیک‏های کلرامفنیکل، نیتروفورانتوئین و مروپنم با فراوانی 65/1 درصد مشاهده شد. فراوانی حضور ژن‏های dfrA1، tet (A)، aac (3) - IV، sul1، tet (B)، aadA1، qnr، CITM، blaSHV، sim، vim، Oxa-58-like، Oxa-24-like، imp، Oxa-51-like، Oxa-23-like، cat1، cmlAبه ترتیب 79 (28/65 درصد)، 71 (67/58 درصد)، 68 (19/56 درصد)، 67 (37/55 درصد)، 44 (36/36 درصد)، 41 (88/33 درصد)، 29 (96/23 درصد)، 28 (14/23 درصد)، 24 (83/19 درصد)، 17 (04/14 درصد)، 16 (22/13 درصد)، 14 (57/11 درصد)، 12 (91/9 درصد)، 10 (26/8 درصد)، 9 (43/7 درصد)، 8 (61/6 درصد)، 5 (13/4 درصد) و 3 (47/2 درصد) بود. ‏‏‏ بحث و نتیجه ‏گیری: وجود مقاومت آنتی‏بیوتیکی چندگانه در ایزوله‏های مورد مطالعه، استفاده از روش‏های مولکولی در کنار آزمون آنتی بیوگرام برای انتخاب مؤثرترین آنتی‏بیوتیک در درمان عفونت و لزوم برقراری نظام مراقبت آنتی‏بیوتیکی به منظور موفقیت در‏ برنامه کنترل عفونت را در آینده نشان می‏دهد.

پایش اینتگرون کلاس 1 در سویه‏ های اشریشیاکلی اسهال ‏زا جدا شده از کودکان شهر یاسوج

محمد کارگر؛ زهرا محمدعلی پور؛ عباس دوستی؛ شاهرخ لرزاده؛ فتانه معین جهرمی

دوره 4، شماره 14 ، شهریور 1394، ، صفحه 131-140

چکیده

مقدمه: اینتگرون‏ها عناصر ژنتیکی متحرکی هستند که توانایی کسب و درج کاست‏های ژنی مقاومت آنتی‏بیوتیکی را دارند و نقش مهمی در گسترش مقاومت دارویی ایفا می‏کنند. هدف از این پژوهش، ارزیابی نقش اینتگرون ... بیشتر مقدمه: اینتگرون‏ها عناصر ژنتیکی متحرکی هستند که توانایی کسب و درج کاست‏های ژنی مقاومت آنتی‏بیوتیکی را دارند و نقش مهمی در گسترش مقاومت دارویی ایفا می‏کنند. هدف از این پژوهش، ارزیابی نقش اینتگرون کلاس 1 در مقاومت دارویی جدایه‏های اشریشیاکلی اسهال‏زا در کودکان زیر 5 سال است‏‏. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ ها: 164 جدایه‏ی اشریشیاکلی اسهال‏زا در کودکان زیر 5 سال از نظر حضور ژنintI1 و کاست ژنی درج شده در اینتگرون کلاس یک ارزیابی شد. همچنین، مقاومت آنتی‏بیوتیکی با استفاده از استاندارد CLSI بررسی شد. ‏‏‏ نتایج: میزان شیوع ژن intI1 و کاست ژنی در جدایه‏های اشریشیاکلی به ترتیب 73/70‏ و 63/64‏ درصد بود. اندازه کاست‏های ژنی در این نمونه‏ها از 750 تا 2000 جفت باز متغییر بود. همچنین، بین حضور اینتگرون کلاس 1 و کاست ژنی آن و مقاومت نسبت به استرپتومایسین، جنتامایسین، کانامایسین، آمیکاسین، کلرامفنیکل، تتراسایکلین، نالیدیکسیک‏اسید و کوتریموکسازول ارتباط معناداری به دست آمد. ‏‏‏ بحث و نتیجه ‏گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که اینتگرون کلاس 1 و کاست‏های ژنی درج شده در آن، در بین اشریشیاکلی‏های اسهال‏زا در منطقه مورد پژوهش شیوع در خور توجهی دارد. با توجه به امکان شیوع گسترده سویه‏های مقاوم به دارو، ضرورت پایش مولکولی جدایه‏های ‏اشریشیا‏کلی در سایر مناطق کشور وجود دارد. ‏‏‏

مطالعه‏ لایه‏ سطحی و پارا اسپورال ‏بادی ‏‏‏(‏‏‏MH14) ‏‏‏Bacillus thuringiensis Israelensis و پیش‏بینی پایدارسازی ‏‏‏(‏‏‏Cry4Ba) ‏‏‏با ایجاد جهش نقطه ‏ای بر اساس یافته‏ های بیوانفورماتیک

غزال باب المراد؛ گیتی امتیازی

دوره 4، شماره 14 ، شهریور 1394، ، صفحه 153-166

چکیده

مقدمه: باسیلوس تورنجینسیس مهم‏ترین‏‏‏ عامل زیستی است که با تولید پارا اسپورال بادی، ‏‏‏نقش مهمی در مقابله با آفات کشاورزی دارد. ‏‏‏همچنین، لایه‏ سطحی تولید می‏کند که ساختاری کریستالی ... بیشتر مقدمه: باسیلوس تورنجینسیس مهم‏ترین‏‏‏ عامل زیستی است که با تولید پارا اسپورال بادی، ‏‏‏نقش مهمی در مقابله با آفات کشاورزی دارد. ‏‏‏همچنین، لایه‏ سطحی تولید می‏کند که ساختاری کریستالی از جنس پروتئین یا گلیکوپروتئین است و کاربرد وسیعی در نانوبیوتکنولوژی دارد. ‏‏‏بنابراین، ‏‏‏مطالعه آن دارای اهمیت است‏‏. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، پارا اسپورال بادی خالص‏سازی ‏‏‏شده، مخلوط کریستال/ اسپور با کوماسی‏بلو G250 رنگ‏آمیزی و با میکروسکوپ نوری مشاهده شدند. ‏‏‏با ایجاد جهش نقطه‏ای، ‏‏‏افزایش پایداری در پروتئین CRY4Ba پیش‏بینی شد و جایگاه حفره‏ها در این پروتئین توسط نرم افزار molegro پیش‏بینی‏شد. در نهایت، لایه ‏سطحی استخراج و شکل و وزن مولکولی آن بررسی شد. ‏‏‏به منظور مقایسه لایه ‏سطحی و پاراسپورال‏بادی، ‏‏‏برخی ویژگی‏های پروتئین آن‏ها توسط پایگاه Protparam تعیین شد. ‏‏‏ نتایج: یافته‏ها گویای‏‏‏ وجود کریستال‏های پروتئینی چند وجهی بود که پس از آزاد شدن از اسپور مجتمع می‏شوند و کریستال‏های درشت‏تر تشکیل می‏دهند. ‏‏‏همچنین، در این پژوهش‏‏‏ پیش‏بینی می‏شود‏‏‏ که با جایگزینی اسید آمینه‏ آسپارتیک‏اسید موقعیت 451 با ایزولوسین، ‏‏‏پروتئین مقاوم‏تر کشنده حشرات CRY4Ba ایجاد می‏شود‏‏‏. ‏‏‏این پروتئین سه زیر واحدی حاوی 59 حفره است و همانند لایه‏سطحی از همین سویه، ‏‏‏درصد حضور اسیدهای آمینه‏ متیونین، ‏‏‏هیستیدین، ‏‏‏سیستئین و تریپتوفان درآن بسیار پایین است. ‏‏‏ بحث و نتیجه ‏گیری: باسیلوس تورنجینسیس در فاز اسپورزایی، کریستال‏های کشنده حشرات تولید می‏کند که این کریستال‏ها پس از رها شدن از اسپور مجتمع می‏شوند و کریستال‏های درشت‏تر را تشکیل می‏دهند. ‏‏‏پیش‏بینی می‏شود‏‏‏ که جایگزینی آسپارتیک‏اسید موقعیت 451 با ایزولوسین، ‏‏‏موجب افزایش پایداری پروتئین CRY4Ba می‏شود. ‏‏‏این باکتری در فاز رویشی پروتئین سطحی KD100 تولید می‏کند که از لحاظ ریخت‏شناسی و درصد برخی اسید‏های آمینه به پارا اسپورال‏بادی شباهت بسیاری دارد. ‏‏‏

"مقاله کوتاه" مطالعه‌ سرمی و مولکولی بروسلوز شتر در نجف آباد

محمدرضا محزونیه؛ مهدی سلیمی

دوره 4، شماره 14 ، شهریور 1394، ، صفحه 167-174

چکیده

مقدمه: بروسلوز ‌یکی از مهم‏ترین بیماری‌های زئونوز است که در کشورمان یافت می‏شود. شتر از جمله حیواناتی است که به فراوانی به ایران وارد می‏شود و هیچ برنامه نظارتی برای بیماری بروسلوز آن وجود ندارد. ... بیشتر مقدمه: بروسلوز ‌یکی از مهم‏ترین بیماری‌های زئونوز است که در کشورمان یافت می‏شود. شتر از جمله حیواناتی است که به فراوانی به ایران وارد می‏شود و هیچ برنامه نظارتی برای بیماری بروسلوز آن وجود ندارد. هدف از انجام این پژوهش، تعیین میزان آلودگی فعال و غیر فعال با استفاده از روش‎های جستجوی سرولورژی و ژنومی بروسلا در شتران کشتار شده در مرکز ایران در سال‏های 1391 تا 1392 است. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ها: از تعداد 150 نفر شتر که در کشتارگاه نجف آباد کشتار شده بودند نمونه خون تهیه و در ظرف یخ به آزمایشگاه منتقل شد. ابتدا نمونه‏ها به وسیله آزمایش‏های سرولوژی شامل: آزمون رزبنگال، رایت لوله ای و 2ME ارزیابی شدند. نمونه‌هایی که تیتر آنتی بادی ضد بروسلا را برابر یا بیشتر از1:80 در آزمون رایت و تیتر ‏برابر یا بیشتر از 1:40 را در آزمون 2-ME نشان دادند، مثبت تلقی شدند. سپس، اسید نوکلئیک نمونه‌ها استخراج و به وسیله واکنش زنجیره ای پلیمراز آزمون شد. ‏‏‏ نتایج: نتایج نشان داد میزان آلودگی در روش‎های سرولوژی رزبنگال، رایت و 2-ME، به ترتیب 12، 8 و 6 درصد بود. اگر چه 3/1 درصد نمونه‌ها در آزمون PCR مثبت بودند. ‏‏‏ بحث و نتیجه‏ گیری: با توجه به تیتر 2ME، نتایج مطالعه سرولوژی گویای مزمن بودن عفونت در این حیوانات است. در این مطالعه قطه‏ای از ژن pb26 ردیابی شد که در بیشتر گونه‌ها مشترک است. پژوهش حاضر نشان داد که شتر بالقوه می‏تواند حامل باکتری باشد و از این رو ورود شتر به کشور، یکی از راه‏های ‏گسترش ‏باکتری به بخش‌های مرکزی ایران است. ‏‏‏

کنترل‏ زیستی‏ علف‏ هرز‏ پیچک‏ صحرایی Convolvulus arvensis با‏ استفاده‏ از پروتئین‏ نوترکیب‏ Nep1‏ حاصل‏ از Fusarium oxysporum‏

جواد حامدی؛ حمید مقیمی؛ الهام رضازاده؛ علی محمد لطیفی؛ ضرغام سپهری زاده

دوره 4، شماره 13 ، خرداد 1394، ، صفحه 1-10

چکیده

مقدمه:‏ پروتئین‏ Nep1‏ یک‏ علف‏کش‏ زیستی‏ است‏ که‏ به‏ طور‏ مؤثر‏‏‏‏ی‏ باعث‏ از‏ بین‏ رفتن‏ تعداد‏ زیادی‏ از‏ گیاهان‏ دولپه‏‏ای‏ و‏ از‏ جمله‏ طیف‏ وسیعی‏ ... بیشتر مقدمه:‏ پروتئین‏ Nep1‏ یک‏ علف‏کش‏ زیستی‏ است‏ که‏ به‏ طور‏ مؤثر‏‏‏‏ی‏ باعث‏ از‏ بین‏ رفتن‏ تعداد‏ زیادی‏ از‏ گیاهان‏ دولپه‏‏ای‏ و‏ از‏ جمله‏ طیف‏ وسیعی‏ از‏ علف‏های‏ هرز‏ می‏‏شود. این‏ پروتئین‏ برای‏ نخستین‏ بار‏ در‏ سال‏ 1995‏ از‏ مایع‏ تخمیر‏ قارچ‏ Fusarium oxysporum‏‏ خالص ‏سازی‏ ‏‏شد‏‏. مواد‏ و‏ روش‏‏ ها:‏ در‏ این‏ پژوهش،‏ ژن‏ nep1‏ از‏‏ F. oxysporum‏ جداسازی‏ و پس ‏‏از‏ حذف‏ سیگنال‏ نشانه‏ از‏ ابتدای‏ ژن، ساختار‏ نهایی‏ در‏ حامل‏ pET16b‏ کلون‏ و‏ به‏ باکتری (DE3) BL21 E. coli‏ انتقال‏ داده‏ شد. پروتئین‏ نوترکیب‏ پس‏ از‏ تولید‏ در‏ باکتری، خالص‏سازی‏ ‏‏و‏ رقت‏های‏ ‏‏مناسب‏ از‏ آن‏ برای‏ سنجش‏ زیستی‏ روی‏ گیاه‏ هرز‏ تهیه‏ شد. نتایج:‏ دو‏ میلی ‏‏‏‏لیتر‏ از‏ پروتئین‏ نوترکیب‏ تولید‏ شده‏ با‏ غلظت‏ 60 میکروگرم‏ در‏ میلی‏‏‏‏ لیتر‏ به‏ گیاه‏ بالغ‏ پیچک‏ صحرایی‏ اسپری‏ شد. نتایج‏ به‏ دست‏ آمده‏ نشان‏ داد‏ که‏ برگ‌های‏ گیاه پس ‏‏از‏ حدود‏ 2‏ روز‏ شروع‏ به‏ زرد‏ شدن‏ و‏ نکروز‏ وسیع‏ کردند. نکروز‏ کامل‏ و‏ مرگ‏ گیاه‏ هرز،‏ 5‏ روز‏ پس‏ از‏ اسپری‏ مشاهده‏ شد. از‏ اسپری‏ بافر‏ بدون‏ پروتئین‏ نوترکیب‏ و‏ همچنین،‏ پروتئین‏ Nep1‏ نوترکیب‏ تقلیب‏ شده‏ از‏ طریق‏ 15‏ دقیقه‏ تیمار‏ حرارتی‏ در‏ 100‏ درجه‏ سانتی‏گراد‏ به‏ عنوان‏ شاهد‏ استفاده‏ شد‏ که پس ‏‏از‏ گذشت‏ 5‏ روز‏ هیچگونه‏ علامتی‏ روی‏ برگ‏های‏ ‏‏گلدان‏های‏ ‏‏شاهد،‏ مشاهده‏ نشد. بحث‏ و‏ نتیجه‏ گیری:‏ نتایج‏ به‏ دست‏ آمده‏ در‏ این‏ پژوهش‏ نشان‏ داد‏ که‏ می‏‏توان‏ از‏ پروتئین‏ نوترکیب‏ Nep1‏ به‏ عنوان‏ یک‏ عامل‏ زیستی‏ توانمند‏ در‏ کنترل‏ گیاه‏ هرز‏ C. arvensis‏ استفاده‏ کرد.

ردیابی ژن‏ های مولد انتروتوکسین در ایزوله‏ های استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از ناگت مرغ در استان اصفهان به روش PCR

هاجر مداحی؛ ابراهیم رحیمی؛ محمد جلالی

دوره 4، شماره 13 ، خرداد 1394، ، صفحه 25-34

چکیده

مقدمه: استافیلوکوکوس اورئوسمولد انتروتوکسین به عنوان رایج‏ترین عامل مسمومیت غذایی استافیلوکوکی و به دنبال آن وقوع گاستروانتریت، اسهال و استفراغ شناخته شده است که وجود ژن‏های مولد انتروتوکسین در ... بیشتر مقدمه: استافیلوکوکوس اورئوسمولد انتروتوکسین به عنوان رایج‏ترین عامل مسمومیت غذایی استافیلوکوکی و به دنبال آن وقوع گاستروانتریت، اسهال و استفراغ شناخته شده است که وجود ژن‏های مولد انتروتوکسین در این باکتری می‏تواند علت اصلی بروز این علایم باشد. این مطالعه با هدف بررسی شیوع و فراوانی ژن‏های مولد انتروتوکسین در ایزوله‏هایاستافیلوکوکوس اورئوس جدا‏شده از ناگت مرغ و غذای آماده مصرف در استان اصفهان به روش PCR انجام شده است‏‏. مواد و روش‏‏ها: در تابستان 1391، 420 نمونه انواع ناگت مرغ از مراکز فروش استان اصفهان به شکل تصادفی جمع‏آوری شد. تمام نمونه‏ها از نظر حضور استافیلوکوکوس اورئوس به روش کشت میکروبی آزمایش شدند. سپس، به منظور بررسی فراوانی ژن‏های مولد انتروتوکسین، سویه‏های استافیلوکوکوس اورئوس جدا‏شده آزمون PCR شدند. نتایج: در این مطالعه، از 420 نمونه ناگت مرغ 24 نمونه (7/5 درصد) از نظر حضور استافیلوکوکوس اورئوس، مثبت بودند. از 24 ایزوله جداسازی ‏شده، 23 ایزوله (83/95 درصد) حامل حداقل یک ژن مولد انتروتوکسین بودند. اصلی‏ترین ژن‏های ردیابی‏شده در بین استافیلوکوکوس اورئوس‏های مورد مطالعه sea (25 درصد)، sec (5/12 درصد)، sed +sej (16/4 درصد)، sed + seg (16/4 درصد)، seg + sei (16/4 درصد)، sea + seg (33/8 درصد)، seb + sej + sei (16/4 درصد)، sea + sed (5/12 درصد) و sea + sec + sej (5/12 درصد) بودند که شایع‏ترین ژن مولد انتروتوکسین ردیابی شده ژن seaو پس از آن ژن sec گزارش شد. بحث و نتیجه‏ گیری: استافیلوکوکوس اورئوس می‏تواند به‏راحتی از طریق آلوده کردن ناگت مرغ سبب شیوع مسمومیت غذایی استافیلوکوکی شود. بنابراین، می‏توان با اجرای استاندارد‏های کنترل کیفیت و امنیت مواد غذایی در حین فرآیند تولید، از حضور و رشد این باکتری در مواد غذایی جلوگیری کرد. از طرف دیگر به علت افزایش تمایل مردم به سرو غذاهای آماده مصرف و اهمیت سلامت عمومی جامعه، بررسی شیوع و فراوانی ژن‏های مولد انتروتوکسین در ایزوله‏های استافیلوکوکوس اورئوس در ناگت مرغ ضروری به نظر می‏رسد.

شناسایی ژن متالوبتالاکتاماز blaSPM-1 در سویه‏ های مقاوم به ایمی‏پنم سودوموناس آئروژینوزا جدا شده از بیماران بستری بیمارستان ‏های شهر اصفهان

منصور صدیقی؛ حاجیه قاسمیان صفایی؛ حمید واعظ؛ محسن موقوفه ای؛ شیما هادی فر؛ گلفام عریان؛ جمشید فقری

دوره 4، شماره 13 ، خرداد 1394، ، صفحه 161-170

چکیده

مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا یک پاتوژن فرصت طلب است که باعث بروز مشکلات جدی به خصوص در افراد دچار نقص ایمنی می‏شود. به تازگی، مقاومت به واسطه آنزیم‏های متالوبتالاکتاماز (MBLs) در این باکتری باعث اختلال ... بیشتر مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا یک پاتوژن فرصت طلب است که باعث بروز مشکلات جدی به خصوص در افراد دچار نقص ایمنی می‏شود. به تازگی، مقاومت به واسطه آنزیم‏های متالوبتالاکتاماز (MBLs) در این باکتری باعث اختلال در درمان عفونت‏های ناشی از آن شده است. خانواده ژن‏های متالوبتالاکتاماز از جمله blaSPM-1 باعث ایجاد مقاومت نسبت به آنتی‏بیوتیک‏های بتالاکتام به ویژه کارباپنم‏ها (مانند ایمی‏پنم) شده و با شیوع بالایی در سراسر جهان گزارش شده‏اند. هدف از این مطالعه، تشخیص ژن blaSPM-1 در سویه‏های سودوموناس آئروژینوزا مقاوم به ایمی‏پنم جدا شده از بیماران بستری در بیمارستان‏های شهر اصفهان است‏‏. مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، 252 نمونه از عفونت‏های مختلف بیمارستانی جدا شد. سویه‏های سودوموناس آئروژینوزا با استفاده از آزمون‏‏های بیوشیمیایی شناسایی شدند. برای تعیین الگوی مقاومت باکتری از روش دیسک دیفیوژن (کربی- بائر) استفاده شد. کم‏ترین غلظت مهار کنندگی (MIC) ایمی‏پنم در سویه‏های مقاوم به روش E-testبررسی شد. برای شناسایی MBL از روش دیسک ترکیبی استفاده شد. درنهایت، وجود ژن متالوبتالاکتاماز blaSPM-1 با روش PCR بررسی شد. نتایج: در کل، 106 سویه سودوموناس آئروژینوزا جداسازی شد. در این میان، 62 (5/58 درصد) از سویه‏ها به ایمی‏پنم مقاومت نشان دادند. میزان MIC ایمی‏پنم در تمامی سویه‏های مقاوم به ایمی‏پنم بالاتر یا مساوی 32 میکروگرم بر میلی‏لیتر بود. 26 (48 درصد) از سویه‏های مقاوم به ایمی‏پنم تولید کننده MBL بودند. ژنblaSPM-1 در هیچکدام از این سویه‏ها شناسایی نشد‏. بحث و نتیجه ‏گیری: نتایج این مطالعه نشان می‏دهد که میزان مقاومت به ایمی‏پنم ناشی از تولید MBL در سویه‏های سودوموناس آئروژینوزا به طور چشمگیری افزایش یافته است. تشخیص سریع و کنترل عفونت اولیه بهترین استراتژی ضدمیکروبی برای مقابله با این ارگانیسم‏هاست‏. هیچ یک از سویه‏های تولید کننده MBL در این مطالعه حامل ژن ‏blaSPM-1 نبودند. بنابراین، ژن‏های دیگری خانواده MBLs باید بررسی شوند.

تاثیر کمبود فسفر روی مسیر سگینالینگ quorum sensing در Sinorhizobium meliloti

نجمه پاکدامن؛ اکبر مستاجران

دوره 3، شماره 12 ، بهمن 1393، ، صفحه 33-42

چکیده

مقدمه: فسفر یک از مهم‏ترین عناصر ضروری پرمصرف برای رشد باکتری‌هاست. به طور معمول باکتری‌ها در محیط با کمبود فسفر مواجه هستند و مکانیسم‌هایی در آن‌ها برای رویارویی با چنین شرایطی تکامل یافته ‌است. ... بیشتر مقدمه: فسفر یک از مهم‏ترین عناصر ضروری پرمصرف برای رشد باکتری‌هاست. به طور معمول باکتری‌ها در محیط با کمبود فسفر مواجه هستند و مکانیسم‌هایی در آن‌ها برای رویارویی با چنین شرایطی تکامل یافته ‌است. ژن‌های ناقل فسفات (pstS) و مسیر انتقال سیگنال حس‌گر حد نصاب (Quorum sensing) ، به واسطه تنطیم‌کننده PhoB ، در پاسخ باکتری به این شرایط استرسی دخالت دارند. مسیر حس‌گر حد نصاب در باکتری Sinorhizobium meliloti حداقل از سه ژن sinI ، sinR و expR تشکیل یافته است و در کنترل فعالیت‌های باکتری در شرایط آزاد-زی و همزیستی دخالت دارد . مواد و روش ‏‏ ها: تراکم جمعیت در گونه‌های تراریخت باکتری S. meliloti حامل پلاسمیدهای pLK004 (ترکیب راه‌انداز pstS و ژن egfp )، pLK64 (ترکیب راه‌انداز sinI و ژن egfp )، pLK65 (ترکیب راه‌انداز sinR و ژن egfp )، pLK66 (ترکیب راه‌انداز expR و ژن egfp ) و کنترل (ژن egfp بدون راه‌انداز) در غلظت‌های مختلف 1/0 (کمبود فسفات)، 5/0 و 2 (غلظت کافی فسفات) میلی‌مولار فسفات در زمان‌های مختلف 16، 24 و 40 ساعت اندازه‌گیری شد. همچنین، فعالیت پروموتر ژن‌های مختلف pstS ، sinI ، sinR و expR با تقسیم واحد فلورسنس ساطع شده بر تراکم جمعیت باکتری در غلظت‌ها مختلف فسفات محاسبه شد . نتایج: سرعت رشد باکتری‌های تراریخت با کاهش غلظت فسفات در محیط کشت، به‌ویژه 40 ساعت پس از کشت آن‌ها، کاهش یافت. فعالیت پروموتر ژن‌ ناقل فسفات (pstS) و همچنین، برخی ژن‌های مسیر کروم‌سنسینگ ( sinI و sinR و نه expR ) به‌دنبال کاهش غلظت فسفات در محیط کشت، افزایش یافت . بحث و نتیجه ‏ گیری: از جمله پاسخ‌های باکتری S. meliloti به کمبود فسفات می‌توان به افزایش بیان ژن ناقل فسفات (pstS) اشاره کرد که تاحدودی می‌تواند این کمبود در محیط را جبران نماید. بیان ژن‏ sinR نیز در شرایط کمبود فسفات به کمک تنظیم کننده PhoB القا می‌شود. پروتئین SinR به‌عنوان فعال کننده ژن sinI عمل می‌کند و بنابراین، مسیر حس‌گر حد نصاب در شرایط کمبود فسفات فعال می‌شود که احتمالاً موجب تسهیل فعالیت‌های باکتری در شرایط آزاد- زی و همزیستی می‌شود .

شناسایی باکتری ‏های اشریشیا کلی وروتوکسیژن جداشده از ماهیان سرد آبی به‏ وسیله واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه در استان چهارمحال و بختیاری

مجتبی بنیادیان

دوره 3، شماره 12 ، بهمن 1393، ، صفحه 53-58

چکیده

مقدمه: این مطالعه به منظور شناسایی میزان شیوع سویه‏های وروتوکسیژن باکتری اشریشیا کلی در ماهی سرد آبی غزل آلای رنگین کمان توسط روش واکنش پلیمراز زنجیره ای چندگانه انجام شد. مواد و روش ‏‏ ها: ... بیشتر مقدمه: این مطالعه به منظور شناسایی میزان شیوع سویه‏های وروتوکسیژن باکتری اشریشیا کلی در ماهی سرد آبی غزل آلای رنگین کمان توسط روش واکنش پلیمراز زنجیره ای چندگانه انجام شد. مواد و روش ‏‏ ها: تعداد 100 نمونه مدفوع، پوست و گوشت ماهی در مراحل آخر تولید از استخرهای پرورش اخذ و آزمون‏های میکروب‏شناسی و بیوشیمیایی برای تشخیص باکتری اشریشیا کلی انجام شد. سپس، سویه‏های باکتری اشریشیا کلی جدا شده توسط روش واکنش پلیمراز زنجیره‏ای چندگانه برای شناسایی ژن‏های حدت Stx1 ، Stx2 ، eae و hly آزمون شدند. نتایج: نتایج این مطالعه نشان داد که ماهیان سرد آبی به سویه‏های غیر از O157 که وروتوکسیژن هستند، آلوده بودند. در 14 درصد موارد باکتری‏های جدا شده از پوست و در 4 درصد موارد باکتری‏های جدا شده از مدفوع حاوی ژن‏های Stx1 ، Stx2 و eae بودند. بحث و نتیجه ‏ گیری: این مطالعه نشانگر این است که ماهیان سرد آبی پرورشی می‏توانند حامل سویه‏های وروتوکسیژن باکتری اشریشیا کلی بوده و موجب انتقال این سویه‏ها به انسان شوند. از علت‏های این مسأله ممکن است آلودگی آب استخرهای پرورش ماهی توسط مدفوع حیوانات، پرندگان، غذای ماهیان یا کارگران به باکتری را نام برد. توجه بیشتر برای محدود‏سازی عوامل آلوده کننده توصیه می‌شود.

شیوع بتالاکتامازهای نوع CTX-M در جدایه‏‏ های E. coli با مقاومت چندگانه دارویی از شمال ایران، رشت

طلوع بابایی همتی؛ محمد جواد مهدی پور مقدم؛ زیور صالحی؛ سید محمود حبیب زاده

دوره 3، شماره 12 ، بهمن 1393، ، صفحه 69-78

چکیده

مقدمه: بتالاکتامازهای با طیف گسترده ( ESBLs ) به‏عنوان مهم‏ترین شاخص مقاومت به آنتی بیوتیک‏ها در بین انتروباکتریاسه‏ها در سراسر جهان هستند. در طول دهه گذشته، انواع CTX - M از ESBL شیوع بالایی داشته ... بیشتر مقدمه: بتالاکتامازهای با طیف گسترده ( ESBLs ) به‏عنوان مهم‏ترین شاخص مقاومت به آنتی بیوتیک‏ها در بین انتروباکتریاسه‏ها در سراسر جهان هستند. در طول دهه گذشته، انواع CTX - M از ESBL شیوع بالایی داشته و بیشتر در ارتباط با مسببین مهم عفونت ناحیه ادراری ( UTI ) هستند. هدف از این مطالعه بررسی الگوی مقاومت به آنتی بیوتیک و فراوانی بتالاکتامازهای CTX - M در بین جدایه‏‏های E. coli با مقاومت چندگانه دارویی از بیماران مبتلا به UTI در شمال ایران است . مواد و روش ‏‏ ها: 33‏ جدایه E. coli از نمونه‏های ادرار استفاده شد. فنوتیپ‏های ESBL جدایه‏ها با استفاده از آزمون سینرژی دیسک دوتایی ( DDST ) تعیین شدند. ژن‏های مرتبط با ESBL ، شامل گروه‏‏های (1، 2، 8 و 9) با استفاده از واکنش زنجیره‏ای پلیمراز ( PCR ) تکثیر شدند . نتایج: تمام جدایه‏‏های E. coli حساس به پپیراسیلین بوده و 55 درصد آن‏‏ها مقاوم به سفالوسپورین‏‏های نسل سوم و چهارم بودند. تحلیل مولکولی حضور ژن CTX-M در 88 درصد جدایه‏های تولید کننده ESBL نشان داده شد. جدایه‏های E . coli حاوی CTX - M (1، 2، 8 و 9) بسیار مقاوم به چند آنتی بیوتیک نسبت به جدایه‏‏های فاقد CTX - M بودند. CTX-M-1 به‏عنوان شایع‏ترین نوع CTX - M در جدایه‏های E . coli تولید کننده ESBL بود . بحث و نتیجه ‏ گیری: بر اساس نتایج مطالعه حاضر، آنتی بیوتیک ترجیحی برای کنترل سویه‏‏های E. coli تولید کننده ESBL نوع CTX - M در شمال ایران، رشت، باید پپیراسیلین باشد. اگرچه، شیوع ESBL نوع CTX - M در بین جدایه‏‏های E. coli با مقاومت چندگانه دارویی کم بود، اما کنترل همین فراوانی کم نیز دارای اهمیت است.

جداسازی سودوموناس‏های مقاوم به نانو اکسید روی از خاک و بررسی ژن‏های دخیل در مقاومت

شهلا سلطانی نژاد؛ محمد ربانی خوراسگانی؛ محمد مهدی یعقوبی؛ شهریار شاکری

دوره 3، شماره 11 ، آبان 1393، ، صفحه 99-108

چکیده

مقدمه: نانو ذرات اکسید روی به طور وسیع در صنعت، لوازم آرایشی، بهداشتی و پزشکی استفاده می‏شوند. بررسی‏های زیادی بر روی فعالیت ضد میکروبی نانو ذرات متمرکز انجام شده است، اما اطلاعات اندکی در مورد مقاومت ... بیشتر مقدمه: نانو ذرات اکسید روی به طور وسیع در صنعت، لوازم آرایشی، بهداشتی و پزشکی استفاده می‏شوند. بررسی‏های زیادی بر روی فعالیت ضد میکروبی نانو ذرات متمرکز انجام شده است، اما اطلاعات اندکی در مورد مقاومت باکتری‏ها در برابر آن‏ها در دسترس است‏‏. مواد و روش‏‏ها: جدایه‏های سودوموناس مقاوم به نانو اکسید روی از نمونه‏های خاک جمع آوری شده از مناطق مختلف از جمله معدن مس سرچشمه کرمان جداسازی شد. جدایه انتخاب شده به‏وسیله تحلیل‏ توالی ژن 16S rRNA شناسایی شد. اثر نانو ذرات اکسید روی بر روی سرعت رشد باکتری بررسی شد. یون‏های محلول روی آزاد شده از نانو ذرات اکسید روی به‏وسیله اسپکتروفتومتری جذب اتمی اندازه‏گیری شد. بخشی از توالی ژن مقاوم به روی (czcC) تکثیر شده و به‏وسیله تحلیل‏ فیلوژنتیکی توالی پروتئین آن شناسایی شد. نتایج: تحلیل‏ فیلوژنتیکی بر اساس توالی ژن 16S rRNA نشان داد که جدایه انتخاب شده Pseudomonas sp. ZnO-2 است. الگوی رشد جدایه انتخاب شده در حضور تمام غلظت‏های نانو اکسید روی مورد بررسی، مشابه نمونه کنترل (کشت فاقد نانو ذرات) بود که نشان می‏دهد نانو ذرات اکسید روی رشد جدایه جداسازی شده را تحت تاثیر قرار نداده است. PCR ژن czcC و الکتروفورز نشان داد که Pseudomonas sp. ZnO-2 دارای این ژن است. بحث و نتیجه‏گیری: در طی فرآیند تکامل، میکروارگانیسم‏ها مکانیسم‏های مقاومت به فلزات خود را برای سازگاری با محیط‏های مختلف بهبود می‏بخشند. وجود ژن czcC به‏وسیله PCR تایید شد که شباهت زیادی با ژن‏های مقاوم به روی در باکتری‏های دیگر نشان می‏دهد.

بررسی آلودگی گوشت گوساله عرضه شده در سطح شهر اصفهان به کلستریدیوم دیفیسیل با روش کشت و واکنش زنجیره ای پلیمراز با تکنیک چندتایی

زهرا اسفندیاری؛ محمد جلالی؛ حمید عزت پناه؛ اسکات ویز؛ محمد چمنی

دوره 3، شماره 11 ، آبان 1393، ، صفحه 109-116

چکیده

مقدمه: در سال‏های اخیر احتمال انتقال کلستریدیوم دیفیسیل با مصرف مواد غذایی به انسان با افزایش عفونت این باکتری در جامعه مطرح شد. در این میان پژوهش‏های گسترده‏تری از وضعیتکلستریدیوم دیفیسیل در گوشت ... بیشتر مقدمه: در سال‏های اخیر احتمال انتقال کلستریدیوم دیفیسیل با مصرف مواد غذایی به انسان با افزایش عفونت این باکتری در جامعه مطرح شد. در این میان پژوهش‏های گسترده‏تری از وضعیتکلستریدیوم دیفیسیل در گوشت قرمز کشور‏های مختلف دنیا نسبت به مواد غذایی دیگر انجام شد. مطالعه حاضر با هدف بررسی شیوع کلستریدیوم دیفیسیل در گوشت گوساله انجام گرفت‏‏. مواد و روش‏‏‏ها: 100 نمونه از گوشت گوساله عرضه شده در دو شکل تکه‏ای و چرخ کرده از قصابی‏‏های مناطق مختلف شهراصفهان برای انجام آزمایش‏ها جمع آوری شد. پس از انجام مراحل کشت و تایید پرگنه‏های مثبت کلستریدیوم دیفیسیل با آزمون‏های بیوشیمیایی، روش مولکولی PCR با تکنیک چندتایی جهت تشخیص سه ژن ایزومراز تری فسفات، زهرابه آ و زهرابه ب انجام گرفت. بررسی ارتباط بین شیوع کلستریدیوم دیفیسیل در دو شکل تکه‏ای و چرخ کرده گوشت گوساله در نرم افزار آماری SPSS (ویرایش 16) با آزمون مربع کای در سطح معنی داری Pvalue<0.05 انجام گرفت. نتایج: کلستریدیوم دیفیسیل در 12 نمونه (12 درصد‏) از گوشت‏های گوساله جداسازی شد. از بین 12 نمونه، دو نمونه (4 درصد‏) به گوشت تکه‏ای و 10 نمونه (20 درصد) به گوشت چرخ کرده مربوط بود. همه پرگنه‏های جداسازی شده از هر سه ژن مورد بررسی برخوردار بودند. تفاوت معنی‏داری در شیوع کلستریدیوم دیفیسیل در دو نوع از گوشت‏های مورد بررسی مشاهده شد (01/0=Pvalue). بحث و نتیجه‏گیری: در این مطالعه، میزان جداسازی کلستریدیوم دیفیسیل در گوشت‏های چرخ کرده گوساله نسبت به شکل تکه‏ای افزایش داشت که می‏تواند به علت عدم رعایت اصول بهداشتی در شست و شو و تشکیل احتمالی بیوفیلم در دستگاه‏های چرخ گوشت باشد. همچنین، نتایج این مطالعه نشان داد که مصرف گوشت گوساله به‏عنوان یک مخزن احتمالی از کلستریدیوم دیفیسیل در انتقال این باکتری به انسان می‏تواند عمل کند.

افزایش تولید آنتی‌بیوتیک کلاولانیک ‏اسید با ایجاد گونه‌های استرپتومایسس کلاولی‌جروس تراریخت واجد ژن claR

مریم کی؛ زهره حجتی؛ مجید متولی باشی

دوره 3، شماره 10 ، تیر 1393، ، صفحه 37-44

چکیده

مقدمه : کلاولانیک‏اسید از جمله آنتی‌بیوتیک‌های مهار کننده‌ی β لاکتاماز بوده که توسط استرپتومایسس کلاولی‌جروس تولید‌ می‏شود. کلاولانیک‏اسید در ترکیب با سایر آنتی‌بیوتیک‌های قوی و حساس ... بیشتر مقدمه : کلاولانیک‏اسید از جمله آنتی‌بیوتیک‌های مهار کننده‌ی β لاکتاماز بوده که توسط استرپتومایسس کلاولی‌جروس تولید‌ می‏شود. کلاولانیک‏اسید در ترکیب با سایر آنتی‌بیوتیک‌های قوی و حساس به β لاکتاماز مورد استفاده بالینی قرار می‏گیرد. ژن‌ CalR از جمله ژن‌هایی بوده که نقش مهمی در تنظیم تولید کلاولانیک‏اسید ایفا نموده و به منظور بیان ژن‌های اواخر مسیر بیوسنتز کلاولانیک‏اسید مورد نیاز است‏‏. مواد و روش‏‏ها: کانسترک نوترکیب pMTclaR حاوی ژن تنظیمی claR از دانشگاه اصفهان تهیه و به منظور استفاده، از سویه‌ استرپتومایسس لیویدنس با استفاده از روش لیز قلیایی استخراج شد. به منظور انجام ترانسفورماسیون پروتوپلاست از باکتری استرپتومایسس کلاولی‌جروس تهیه و در مرحله‌ بعد با استفاده از پلی‌اتیلن‌‌گلایکول در سویه‌ استرپتومایسس کلاولی‌جروس ترانسفورم شد. با استفاده از استخراج پلاسمید و انجام PCR ترانسفورماسیون تأیید شد. در نهایت به منظور بررسی نحوه‌ تأثیر ژن claR اضافه شده از روش بایواسی استفاده شد. نتایج: کلونی‏‌های گچی حاصل از رشد استرپتومایسس کلاولی‌جروس ترانسفورم شده بر روی محیط GYME حاوی آنتی‌بیوتیک مشاهده شد که تأیید انجام ترانسفورماسیون است. از سویه‌ ترانسفورم شده پلاسمید استخراج و ساختار آن توسط ژل الکتروفورز تأیید شد. با استفاده از پلاسمید استخراج شده و پرایمرهای اختصاصی claR واکنش PCR انجام و باند 1334 جفت‌بازی مشاهده شد. در نهایت با انجام روش بایواسی و مشاهده‌ی هاله‌ عدم رشد در نمونه‌ ترانسفورم شده و مقایسه‌ آن با نمونه‌ کنترل مشخص شد که حضور پلاسمید نوترکیب سبب افزایش 3/3 برابری تولید کلاولانیک‏اسید در سویه‌ استرپتومایسس کلاولی‌جروس شده است. بحث و نتیجه‏گیری: در مطالعه‌ حاضر، با انتقال پلاسمید نوترکیب حاوی ژن claR میزان تولید آنتی‌بیوتیک کلاولانیک‏اسید تا 5/2 برابر افزایش یافت. با توجه به اهمیت دارویی کلاولانیک‏اسید ایجاد سویه‌هایی که توانایی تولید بیشتر کلاولانیک‏اسید را داشته باشند می‌توانند به بومی‌سازی تولید آنتی‌بیوتیک کلاولانیک‏اسید با صرفه‌ اقتصادی بیشتر درمقیاس صنعتی کمک شایانی نماید.

جستجوی مولکولی تریپانوزوم در شترهای یک‌کوهانه کشتار شده در کشتارگاه نجف‌آباد

سمانه مهرابیان؛ محمدرضا محزونیه؛ محمد ربانی خوراسگانی؛ حسین طهماسبی؛ جاسم امیری ده چشمه؛ اعظم قربانی؛ حمید اسماعیلی نجف‌آبادی؛ مهدی سلیمی

دوره 3، شماره 10 ، تیر 1393، ، صفحه 45-50

چکیده

مقدمه : تریپانوزوم‌ها حیوانات متعددی را آلوده کرده و تب، ضعف و رخوت ایجاد می‏کنند که به کاهش وزن و آنمی منجر می‌شود. اگر بیماری در دام‌ها درمان نشود می‌تواند به مرگ و زیان‏های جدی اقتصادی منتهی ... بیشتر مقدمه : تریپانوزوم‌ها حیوانات متعددی را آلوده کرده و تب، ضعف و رخوت ایجاد می‏کنند که به کاهش وزن و آنمی منجر می‌شود. اگر بیماری در دام‌ها درمان نشود می‌تواند به مرگ و زیان‏های جدی اقتصادی منتهی شود. مطالعه‌ حاضر به منظور ردیابی مولکولی تریپانوزوما در شترهای یک‌کوهانه کشتار شده در کشتارگاه نجف‌آباد انجام شد‏‏. مواد و روش‏‏ها: تعداد 278 نمونه خون در سه بازه زمانی مختلف از شترهای یک‌کوهانه کشتار شده در کشتارگاه نجف‌آباد اخذ و برای ردیابی تریپانوزوما به روش PCR آزمون شدند. نتایج: میزان آلودگی به تریپانوزما در کل 07/1 درصد بود. نمونه‌های مثبت تنها در فصل‌های بهار و تابستان یافت شدند (8/3 درصد). در فصل‌های پاییز و زمستان هیچ نمونه‌ی مثبتی به دست نیامد. بحث و نتیجه‏گیری: نتیجه‌ حاضر می‌تواند بیانگر این مسئله باشد که خوشبختانه عفونت با تریپانوزوم در منطقه مورد مطالعه از شیوع بسیار پایینی برخوردار است. برای پیشگیری از بیماری پیشنهاد می‌شود از ورود دام‌های مشکوک به بیماری به کشور ممانعت شود. اگر امکان آزمایش دام‌های وارداتی که از نظر ظاهری سالم هستند به وسیله‌ آزمون‌های مولکولی وجود ندارد، توصیه می‌شود به وسیله‌ی آزمون‌های سریع و ساده‌ای مانند آگلوتینیشن آزمون که برای انجام آن نیاز به متخصص نیست ارزیابی شوند.

جداسازی و شناسایی ژن‏ها‏ی ‏مقاومت آنتی‏بیوتیکی در ایزوله‏ها‏ی استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از عفونت‏ها‏ی دستگاه تنفسی در شهرستان شهرکرد

مریم رئیسی؛ الهه تاج بخش؛ حسن ممتاز

دوره 3، شماره 10 ، تیر 1393، ، صفحه 97-106

چکیده

مقدمه : استافیلوکوکوس اورئوس یکی ازعوامل اصلی بیماری‏زا‏‏ در انسان محسوب می‏‏‏شود که با درگیر کردن قسمت‏ها‏ی مختلف بدن از جمله دستگاه تنفس باعث صرف هزینه‏ها‏ی فراوان و طولانی شدن ... بیشتر مقدمه : استافیلوکوکوس اورئوس یکی ازعوامل اصلی بیماری‏زا‏‏ در انسان محسوب می‏‏‏شود که با درگیر کردن قسمت‏ها‏ی مختلف بدن از جمله دستگاه تنفس باعث صرف هزینه‏ها‏ی فراوان و طولانی شدن دوره درمان بیمار می‏‏‏شود. این مطالعه، با هدف جداسازی وبررسی الگوی مقاومت آنتی‏بیوتیکی در ایزوله‏ها‏ی استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از عفونت‏ها‏ی فوقانی دستگاه تنفسی در شهرستان شهرکرد انجام شد ‏‏. مواد و روش‏‏ها: این تحقیق، به شکل‏‏ مقطعی- توصیفی بر روی 200 نفر از افراد مشکوک به عفونت‏ها‏ی دستگاه تنفسی فوقانی مراجعه کننده به کلینیک امام علی شهرستان شهرکرد در سال 1391 انجام شد‏‏. پس از جداسازی استافیلوکوکوس اورئوس از ترشحات بینی کشت داده شده، به منظور شناسایی ژن‏ها‏ی کد کننده مقاومت آنتی‏بیوتیکی در ایزوله‏ها، آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز ‏(‏ PCR ) با استفاده از زوج پرایمرهای اختصاصی انجام شد. نتایج: از 200 نمونه مورد بررسی، در 60 مورد ‏(‏30 درصد) ‏آلودگی با استافیلوکوکوس اورئوس ‏(‏در روش کشت و PCR ) ‏تعیین شد که در بررسی الگوی مقاومت ضدمیکروبی، بیش‏ترین مقاومت میکروبی به پنی سیلین و سفوتاکسیم ‏(‏100 درصد) ‏و کم‏ترین میزان مقاومت آنتی‏بیوتیکی ایزوله‏ها‏ به وانکومایسین ‏(‏5/0 درصد) ‏برآورد شد‏‏. ژن mecA ‏(‏کد کننده مقاومت به متی سیلین) ‏با فراوانی 18/85 درصد و ژن aacA-D ‏(‏کد کننده مقاومت به آمینوگلیکوزیدها) ‏با فراوانی 33/28 درصد بیش‏ترین و کم‏ترین ژن‏ها‏ی کد کننده مقاومت آنتی‏بیوتیکی ردیابی شده در ایزوله‏ها‏ی استافیلوکوکوس اورئوس بودند. بحث و نتیجه‏گیری: شیوع ایزوله‏ها‏یاستافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به آنتی‏بیوتیک در افراد مبتلا به بیماری‏ها‏ی دستگاه تنفسی لزوم کنترل دائمی ناقلین و درمان آن‏ها‏ را برای جلوگیری از اشاعه این باکتری وعفونت‏ها‏ی حاصل از آن را توصیه می‏‏‏کند.

کلونینگ و بیان ژن کد‏کننده آنزیم لاکاز از باکتری باسیلوس پومیلوس سویه GAZ23

پروین زمانی؛ محمد علی آموزگار؛ خسرو خواجه

دوره 3، شماره 9 ، خرداد 1393، ، صفحه 1-10

چکیده

مقدمه: لاکازها (بنزن دیول اکسیژن اکسیدو ردوکتاز EC 1. 10. 3. 2 ) یکی از اعضا ی خانواده مالتی کوپر اکسیدازها هستند که اکسیداسیون طیف گسترده ای از ترکیبات فنولی را با استفاده از اکسیژن مولکولی کاتالیز می‌کنند. ... بیشتر

تشخیص مقاومت به افلوکساسین با روش مولکولی سریع Allele Specific PCR ‏در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

وحیده وحیدی؛ محمدرضا ذوالفقاری؛ اعظم احمدی؛ مانا شجاع پور؛ سید رضا مودب؛ محمد ارجمندزادگان

دوره 3، شماره 9 ، خرداد 1393، ، صفحه 21-34

چکیده

مقدمه : مقاومت به فلوروکینولون‏ها در بیماری سل رو به گسترش است. ‏تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول می‏انجامد. ‏مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ‏ها ی کلینیکی ... بیشتر مقدمه : مقاومت به فلوروکینولون‏ها در بیماری سل رو به گسترش است. ‏تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول می‏انجامد. ‏مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ‏ها ی کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به افلوکساسین انجام شد. مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، ‏ DNA ‏های استخراج شده از 41 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ‏حساس و مقاوم ‏به افلوکساسین موجود در بانک DNA مرکز تحقیقات سل و بیماری‏های عفونی با دو روش مولکولیآلل اسپسیفیک پی سی آر ( AS-PCR ) و تعیین ترادف (سکوئنس)، برای تعیین موتاسیون در منطقه مرتبط با مقاومت ژن gyrA با هم مقایسه شدند. ‏پرایمرهای داخلی برای تشخیص موتاسیون‏های مرتبط با مقاومت طراحی و شرایط ‏ PCR ‏تعیین شد‏. ‏قطعه مورد نظر درتعدادی از نمونه‏ها تعیین ترادف شده و به‏عنوان استاندارد طلایی با روش‏های ارائه شده مقایسه شد. نتایج: روش AS-PCR ‏به خوبی قادر به تشخیص موتاسیون با تشکیل یا عدم تشکیل باند داخلی شد‏ که نشان دهنده طراحی صحیح پرایمرها بود. ‏روش AS-PCR اجرا و با توجه به نتایج بسیار خوب به عنوان روش عادی استفاده شد. ‏در مجموع، ‏از 41 سویه کلونیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مطالعه شده، ‏37 سویه از نظر فنوتیپی (‏به روش کشت proportion ) مقاوم به افلوکساسین و 4 سویه حساس به این دارو بودند. ‏از 37 سویه مقاوم از نظر فنوتیپی، 32سویه با روش AS-PCR مقاوم به افلوکساسین و 5 نمونه حساس تعیین شدند. ‏نتایج تعیین ترادف، ‏با نتایج روش‏های استفاده شده انطباق داشت. ‏حساسیت و ویژگی روش به ترتیب ‏معادل ‏11/86 درصد و 100 درصد به دست آمد. بحث و نتیجه‏گیری: نتایج مطالعه حاضر نشان می‏دهد که روش AS-PCR طراحی شده می‏تواند به عنوان یک روش ساده و سریع برای تعیین حساسیت و مقاومت به افلوکساسین در سویه‏های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس استفاده شود. ‏این روش تا کنون در منابع علمی گزارش نشده است.

دوره 11 (1401)

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

موضوعات = ژنتیک و زیست شناسی مولکولی میکروارگانیسم ها

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده