زیست شناسی میکروارگانیسم ها

مطالعه تنوع جنس‌های جلبک‌های تک‌سلولی دریاچه ارومیه با تاکید بر گونه‌های جنس دونالیلا

رامین مناف فر؛ سکینه مرادخانی؛ هدیه یزدانی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 04 اردیبهشت 1402

https://doi.org/10.22108/bjm.2023.135417.1502

چکیده

مقدمه: دریاچه ارومیه یکی از دریاچه‌های بسیار شور دنیا می‌باشد با این حال، برخی از جلبک‌های تک‌سلولی در این دریاچه یافت می‌شوند که دارای تنوع زیادی هستند و برخلاف شرایط بحرانی حاکم بر دریاچه ارومیه ... بیشتر مقدمه: دریاچه ارومیه یکی از دریاچه‌های بسیار شور دنیا می‌باشد با این حال، برخی از جلبک‌های تک‌سلولی در این دریاچه یافت می‌شوند که دارای تنوع زیادی هستند و برخلاف شرایط بحرانی حاکم بر دریاچه ارومیه گاها شکوفایی بسیار شدیدی از این نوع از جلبک‌ها در نقاط مختلف دریاچه مشاهده می‌شود. به دلیل افزایش شوری و کاهش شدید میزان آب دریاچه مورد مطالعه و افزایش درجه شوری تا حد اشباع، پیش‌بینی شد که تنوع جلبک‌های تک‌سلولی در این دریاچه به شدت کاهش یافته است. مواد و روش‌ها: در این تحقیق سعی شد شناسایی جنس‌های مختلف جلبک‌های تک‌سلولی موجود در دریاچه ارومیه با استفاده از روش‌های ریخت‌شناسی مورد بررسی قرار گیرد. با توجه به تنوع گونه‌ای جنس دونالیلا در این مطالعه، این کار با استفاده از تکنیک‌های ریخت‌شناسی و مولکولی انجام شد. نتایج: بررسی‌های مولکولی نشان‌دهنده وجود تنوعی از جنس‌های مختلف از 3 رده کلروفیسه، دیاتومه‌ها و سیانوفیسه‌ها بود. در بررسی تنوع گونه‌ای در جنس دونالیلا و مقایسه این نتایج با نمونه‌های موجود در بانک ژنی نشان‌دهنده تغییر تدریجی جمعیت این جلبک‌ها در اثر تغییر شرایط اقلیمی دریاچه ارومیه بود. بحث و نتیجه‌گیری: تنوع جلبک‌های جدا شده از نواحی مختلف دریاچه نشان‌داد که با وجود بحران خشکسالی و کاهش شدید تراکم این جلبک‌ها، همچنان چندین جنس و گونه مختلف از جلبک‌های تک‌سلولی در ایستگاه‌های مورد مطالعه دریاچه وجود دارد.

مشاهده مقاله

نشان پادزیست‌های آموکسی‌سیلین، سفیکسیم و مترونیدازول بر درسد باکتری‌های پایدار در خاک‌های آلوده به فلزهای سنگین

زیبا نجف زاده نوبر؛ علی اکبر صفری سنجانی

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 08 خرداد 1402

https://doi.org/10.22108/bjm.2023.135724.1508

چکیده

مقدمه: هدف این پژوهش بررسی پایداری پادزیستی باکتری‌های کشت‌پذیر در پی افزایش سه‌پادزیست پرکاربرد در سه‌خاک کشاورزی، چراگاه و معدن بااندازه‌های گوناگون فلزهای‌سنگین بود. مواد و روش‌ها: پادزیست‌های ... بیشتر مقدمه: هدف این پژوهش بررسی پایداری پادزیستی باکتری‌های کشت‌پذیر در پی افزایش سه‌پادزیست پرکاربرد در سه‌خاک کشاورزی، چراگاه و معدن بااندازه‌های گوناگون فلزهای‌سنگین بود. مواد و روش‌ها: پادزیست‌های آموکسی‌سیلین، سفیکسیم و مترونیدازول هریک به اندازه‌های 100و200میلی‌گرم درکیلوگرم سه‌خاک کشاورزی، معدن و چراگاه به‌کاررفت ودر یک‌بازه کوتاه‌مدت (صفر، 1، 3 و 7 روز) فراوانی باکتری‌ها درکشتگاه‌های نوترینت‌آگار و درسد باکتری‌های‌پایدار درکشتگاه نوترینت‌آگار دارای پادزیست (16میکروگرم آموکسی‌سیلین، 2میکروگرم سفیکسیم، 8میکروگرم جنتامایسین، 16میکروگرم مترونیدازول و 8میکروگرم تتراسایکلین در میلی‌لیتر نوترینت آگار) شمارش و برآورد شد. نتایج: درسد باکتری‌های پایدار دربرابر پادزیست‌های سفیکسیم، جنتامایسین و تتراسایکلین درخاک‌معدن وبویژه چراگاه که آلودگی بالایی به فلزهای‌سنگین داشتند، بیشتراز خاک‌کشاورزی بود وتنها درسد باکتری‌های‌پایدار دربرابر آموکسی‌سیلین و مترونیدازول درخاک‌کشاورزی بیش‌از معدن بود. درخاک‌چراگاه 100درسد باکتری‌ها دربرابر پادزیست‌های آزمون‌شده گذشته‌از تتراسایکلین، پایداری داشتند. تیمار خاک‌ها به آموکسی‌سیلین مایه افزایش درسد باکتری‌های‌پایدار شد که این افزایش بویژه درخاک‌کشاورزی درغلظت 200میلی‌گرم بر کیلوگرم نمایان‌تر بود. همین یافته درکاربرد سفیکسیم هم دیده‌شد ولی در خاک‌معدن غلظت بالای این پادزیست پیامد کاهشی نشان داد و درسد باکتری‌های‌پایدار دردو خاک‌چراگاه و کشاورزی نزدیک 100درسد ولی درخاک‌معدن به کمتراز 20درسد رسید. درسد باکتری‌های‌پایدار درخاک‌های تیمارشده با مترونیدازول هم دربرابر خاک‌های تیمارنشده افزایش چشم‌گیر داشت ولی دراین تیمار پاسخ باکتری‌های خاک‌کشاورزی به غلظت 200میلی‌گرم بر کیلوگرم کاهشی بود و خاک‌معدن چنان پاسخی رانداشت. بحث و نتیجه‌گیری: روهمرفته درهمه تیمارها توان باکتری‌کشی تتراسایکلین و سپس جنتامایسین درغلظت‌های بکاررفته درکشتگاه دربرابر سه‌پادزیست آموکسی‌سیلین، سفیکسیم، و مترونیدازول بیشتربود. پایداری‌پادزیستی باکتری‌های‌خاک وابسته به آلودگی‌خاک به فلزهای‌سنگین و گوناگونی باکتری‌های خاک، اندوخته ژنتیک و توان جابجایی ژن‌های پایداری درمیان آنها است. افزایش پادزیست‌ها درخاک بسته به ویژگی‌های خاک و پادزیست مایه چیرگی گونه‌های ویژه وپایدار می‌شود که این مایه افزایش جابجایی ژن‌های پایداری وفراوان شدن آنها درزیستگاه‌ها می‌شود.

مشاهده مقاله

بررسی اثر لاکتوفریسین به‌دست‌آمده از لاکتوفرین بر باکتری‌های استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا

شیوا سلیمانی؛ سعید زیبائی؛ معصومه انوری

دوره 12، شماره 45 ، فروردین 1402، ، صفحه 65-75

https://doi.org/10.22108/bjm.2022.132468.1445

چکیده

چکیده مقدمه: لاکتوفریسین، پپتیدی کاتیونی با ۲۵ اسیدآمینه است و در دامین I لوب N لاکتوفرین قرار دارد. این پپتید در مقایسه با لاکتوفرین فعالیت ضدباکتریایی بیشتری دارد. هدف از این مطالعه، بررسی اثر لاکتوفریسین ... بیشتر چکیده مقدمه: لاکتوفریسین، پپتیدی کاتیونی با ۲۵ اسیدآمینه است و در دامین I لوب N لاکتوفرین قرار دارد. این پپتید در مقایسه با لاکتوفرین فعالیت ضدباکتریایی بیشتری دارد. هدف از این مطالعه، بررسی اثر لاکتوفریسین بر رشد استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا است. مواد و روش‏‏ها: لاکتوفرین پس از جداسازی از شیر شتر، با استفاده از کروماتوگرافی تعویض یونی CM-Sephadex C-50 خالص‌‌سازی گردید. سپس لاکتوفریسین به روش تغییریافته Law و Reiter تهیه شد و بررسی پروتئین با الکتروفورز ژل پلی‌آکریل‌آمید، انجام و اثر ضدباکتریایی غلظت‌های مختلف لاکتوفریسین علیه باکتری‌های استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا بررسی شد. نتایج: براساس نتایج، غلظت ۵ میکرو‌گرم بر میلی‌لیتر لاکتوفریسین، کمترین اثر مهاری را بر باکتری‌های مطالعه‌شده داشت. همچنین غلظت‌های ۱۵ و ۲۳ میکرو‌گرم بر میلی‌لیتر لاکتوفریسین با قدرت مهارکنندگی 48-26 و 50-42 درصدی به‌ترتیب بیشترین اثر مهاری را بر استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا داشتند. بحث و نتیجه‏گیری: با توجه به نتایج مشخص شد لاکتوفریسین به‌طور معنی‌دار و وابسته به دوز بر رشد باکتری‌های استافیلوکوکوس اورئوس و سودوموناس آئروژینوزا اثر مهاری دارد. نتایج نشان می‌دهند لاکتوفریسین به‌عنوان یک ماده ضدباکتریایی می‌تواند در انواع برنامه‌های تجاری برای کنترل رشد و بقای بسیاری از عوامل بیماری‌زا مفید باشد.

بررسی اثر سینرژیستی پروتئین‌های نوترکیب درماسپتین B1 و اسانس گیاه پونه علیه باکتری‌های بیماری‌زای گرم منفی گیاهی با استفاده از شاخص غلظت مهاری نسبی (FIC)

حسین میرزایی؛ میترا خادمی؛ فرهاد نظریان فیروزابادی؛ فاطمه دریکوند

دوره 12، شماره 45 ، فروردین 1402، ، صفحه 91-104

https://doi.org/10.22108/bjm.2022.132629.1451

چکیده

چکیده مقدمه: با توجه به افزایش نگرانی به مقاومت باکتری‌ها به انواع آنتی‌بیوتیک‌های رایج، لازم است دارو‌های جدیدی برای درمان بیماری‌های باکتریایی عرضه شوند؛ بنابراین، تلاش فراوان برای یافتن ترکیبات ... بیشتر چکیده مقدمه: با توجه به افزایش نگرانی به مقاومت باکتری‌ها به انواع آنتی‌بیوتیک‌های رایج، لازم است دارو‌های جدیدی برای درمان بیماری‌های باکتریایی عرضه شوند؛ بنابراین، تلاش فراوان برای یافتن ترکیبات ضدمیکروبی با مکانیسم عمل‌ متنوع جهت ممانعت از رشد باکتری‌ها باید صورت گیرد. درمان ترکیبی شامل آنتی بیوتیک‌های فعلی و سایر مولکول‌های بیولوژیکی یا شیمیایی از راهکارهای جدید و کارامد در مبازره علیه بیماری‌های باکتریایی است. مواد و روش‏‏ها: در مطالعه حاضر فعالیت ضدباکتریایی سینرژیستی پپتید نوترکیب درماسپتین B1 جداشده از گیاهان توتون تراریخت در حالت منفرد و ترکیبی با اسانس گیاه پونه علیه پنج باکتری‌های زانتوموناس ترانس لوسنس، زانتوموناس پرفورانس، زانتوموناس سیتری، زانتوموناس گاردنری و سودوموناس سرینگه پتوار سرینگه با استفاده از شاخص غلظت بازدازنده افتراقی (FIC) در غلظت‌های مختلف بررسی شد. نتایج: نتایج نشان دادند حداقل غلظت بازدارندگی پپتیدهای نوترکیب درماسپتین B1 و اسانس پونه علیه بیمارگرهای باکتریایی 50 میکروگرم بر لیتر و 6/4 میکروگرم بر لیتر به‌ترتیب مشاهده شد. محاسبه غلظت بازدارنده افتراقی (FIC شاخص) حاکی از اثرات هم‌افزایی با 49/0 FIC=اسانس پونه با پپتید‌های نوترکیب علیه باکتری‌ها بود. بحث و نتیجه‏گیری: نتایج این بررسی نشان می‌دهند پپتید‌های نوترکیب درماسپتین B1 می‌توانند به تنهایی یا در ترکیب با اسانس پونه برای کنترل بیماری‌های باکتریایی مؤثر باشند؛ با این حال به نظر می‌رسد بین پروتئین‌های نوترکیب و مواد مؤثره گیاه پونه ارتباط سینرژیستی وجود دارد.

اثر برخی قارچ‌های میکوریزی دارسانه‌ای روی رشد گیاه و کنترل زیستی بیماری برق‌زدگی در دو رقم نخود

ناهید معرف‌زاده؛ هادی خاطری؛ روح‌اله شریفی

دوره 11، شماره 44 ، دی 1401، ، صفحه 23-39

https://doi.org/10.22108/bjm.2021.130031.1410

چکیده

چکیده مقدمه: بیماری برق‌زدگی نخود با عامل قارچی Ascochyta rabiei در بیشتر مناطق دنیا نقش مهمی در کاهش عملکرد و کیفیت دانه نخود دارد. این تحقیق با هدف بررسی قابلیت برخی قارچ‌های میکوریزی دارسانه‌ای (arbuscular mycorrhizal ... بیشتر چکیده مقدمه: بیماری برق‌زدگی نخود با عامل قارچی Ascochyta rabiei در بیشتر مناطق دنیا نقش مهمی در کاهش عملکرد و کیفیت دانه نخود دارد. این تحقیق با هدف بررسی قابلیت برخی قارچ‌های میکوریزی دارسانه‌ای (arbuscular mycorrhizal fungi, AMF) در مهار زیستی این بیمارگر وبهبود صفات رشدی در دو رقم نخود انجام شد. مواد و روش‏‏ها: پنج گونة AMF شامل Funneliformis mosseae، Gigaspora margarita، Glomus fasciculatum، Glomus versiform و Rhizophagus irregularis تهیه و اثرشان در مقایسه با قارچکش کلروتالونیل بر مهار برق‌زدگی و نیز تأثیر آنها بر برخی صفات رشدی در دو رقم نخود سارال و بیونیج در حضور بیمارگر بررسی شد. این آزمایش در گلخانه به‌صورت فاکتوریل و بر پایة طرح کاملاً تصادفی با ۱۶ تیمار و ۶ تکرار انجام شد. نتایج: در هر دو رقم نخود، کلروتالونیل بیشترین میزان بازدارندگی از A. rabiei را نشان داد و همه گونه‌های AMF (به استثنای G. fasciculatum در رقم سارال)، سبب کاهش معنی‌دار شاخص بیماری نسبت به شاهد آلوده شدند. بیشترین اثر بازدارندگی از بیماری توسط میکوریزهای R. irregularis و G. versiform به‌ترتیب با 15/46 و 30/42 درصد در رقم سارال و توسط G. fasciculatum با 40 درصد در رقم بیونیج دیده شد. بیشتر گونه‌های AMF در حضور بیمارگر، سبب بهبود شاخص‌های رشدی نخود شدند و بهترین اثر در رقم‌های سارال و بیونیج به‌ترتیب به R. irregularis و G. fasciculatum تعلق داشت. بیشترین میزان کلنیزاسیون ریشه در هر دو رقم مربوط به G. fasciculatum بود. بحث و نتیجه‏گیری: نتایج این پژوهش نشان دادند AMF می‌تواند سبب افزایش رشد گیاه و کاهش خسارت A. rabiei در دو رقم نخود شود. میزان کاهش بیماری و تحریک رشد به ژنوتیپ گیاه و گونة AMF وابسته بود. رابطه‌ای بین میزان کلنیزاسیون ریشه توسط AMF و کاهش بیماری برق‌زدگی مشاهده نشد.

تأثیر فرمولاسیون ارزان قیمت کود زیستی تهیه‌شده از سودوموناس پوتیدا سویه PT و مکمل‌های غذایی بر صفات رویشی ریحان

زهرا اعتمادی فر؛ مریم مرادی؛ محمد ربانی خوراسگانی؛ ساناز خاشعی

دوره 11، شماره 44 ، دی 1401، ، صفحه 51-59

https://doi.org/10.22108/bjm.2022.132813.1457

چکیده

چکیده مقدمه: در سال‌های اخیر تقاضای جهانی برای محصولات کشاورزی افزایش یافته است. یکی از روش‌های افزایش میزان محصولات همراه با کاهش مصرف کودهای شیمیایی، استفاده از کودهای زیستی است. هدف از مطالعه حاضر ... بیشتر چکیده مقدمه: در سال‌های اخیر تقاضای جهانی برای محصولات کشاورزی افزایش یافته است. یکی از روش‌های افزایش میزان محصولات همراه با کاهش مصرف کودهای شیمیایی، استفاده از کودهای زیستی است. هدف از مطالعه حاضر تولید یک فرمول کم‌هزینه از کود زیستی تهیه‌شده از سودوموناس پوتیدا سویه PT است. مواد و روش‏‏ها: ویژگی‌های مختلف محرک رشد گیاه سودوموناس پوتیدا سویه PT مانند محلول‌سازی فسفر، تثبیت نیتروژن و تولید ایندول-3-استیک‌اسید با استفاده از محیط Pikovskaya’s (PVK)، معرف سالکوفسکی و محیط فاقد نیتروژن سنجش شدند. اثر سوبستراهای کم‌هزینه برای تهیه کود زیستی ارزان قیمت با اندازه‌گیری وزن خشک باکتری تجزیه و تحلیل شد. کود زیستی به روش غوطه‌وری بذر تهیه شد و آزمایش‌های گلدانی با استفاده از کود زیستی تهیه‌شده از سودوموناس پوتیدا سویه PTو مکملهای غذایی انجام شدند. اثر تیمارهای مختلف بر رشد و نمو گیاه Ocimum basilicum (ریحان) با اندازه‌گیری طول ریشه و اندام‌های هوایی، وزن تر اندام‌های هوایی و وزن خشک اندام‌های هوایی ارزیابی شد. نتایج: سودوموناس پوتیدا سویه PT قابلیت محلول‌سازی فسفات (OD430nm = 1.1)، تولید (OD530nm = 0.86) IAA و تثبیت نیتروژن را نشان داد. بالاترین زیست‌توده باکتریایی در حضور آب پنیر و به دنبال آن ملاس با درجه بریکس 5/2 همراه با آمونیوم سولفات مشاهده شد. کود زیستی تهیه‌شده از این باکتری به‌ویژه در صورت استفاده با فسفات نامحلول، رشد گیاه را به‌طور چشمگیری افزایش داد. افزودن کود زیستی و فسفات نامحلول به‌ترتیب باعث افزایش 6/41، 7/83 و 25 درصدی طول اندام‌های هوایی، وزن تر اندام‌های هوایی و وزن خشک اندام‌های هوایی نسبت به گیاهان شاهد تیمارنشده شد. بحث و نتیجه ‏گیری: نتایج نشان می‌دهند سودوموناس پوتیدا سویه PT می‌تواند برای تهیه کود زیستی مقرون‌به‌صرفه به‌منظور افزایش رشد گیاه استفاده شود.

نقش سیانوباکترهای جداشده از پوسته زیستی پارک ملی خبر در اصلاح برخی ویژگی‌های خاک و تأثیر سویه منتخب بر رشد Secale montanum

زهرا حجتی بناب؛ پریسا محمدی؛ عذرا صبورا؛ رقیه زارعی

دوره 11، شماره 44 ، دی 1401، ، صفحه 61-75

https://doi.org/10.22108/bjm.2022.127281.1460

چکیده

چکیدهمقدمه: پارک ملی خبر یکی از منابع طبیعی ارزشمند ایران است که جمعیت سیانوباکتری آن تاکنون مطالعه نشده است. سیانوباکتری‌ها مهم‌ترین باکتری‌های تثبیت‌‌کنندة نیتروژن در محیط‌های آبی و خشکی‌اند ... بیشتر چکیدهمقدمه: پارک ملی خبر یکی از منابع طبیعی ارزشمند ایران است که جمعیت سیانوباکتری آن تاکنون مطالعه نشده است. سیانوباکتری‌ها مهم‌ترین باکتری‌های تثبیت‌‌کنندة نیتروژن در محیط‌های آبی و خشکی‌اند که نقش حیاتی در اکوسیستم‌های خشک و نیمه‌خشک دارند. مطالعه حاضر با هدف تعیین نقش گونه‌های سیانوباکتری جداشده از مناطق دست‌خورده و دست‌نخورده در دو استپ سرد و گرم از پارک ملی خبر در برخی ویژگی‌های خاک، انجام و تأثیر گونه منتخب بر رشد گیاه مرتعی سکاله مونتانوم بررسی شد.مواد و روش‏‏ها: در مطالعه حاضر، سیانوباکتری‌ها از اکوسیستم سخت خشکی، جدا و روی محیط BG11 کشت شد. سپس بیان ژن nifH در تمامی جدایه‌ها با استفاده از Real Time-PCR سنجش شد. ندولاریا به‌عنوان بهترین سیانوباکتری تثبیت‌کنندة نیتروژن، انتخاب و فعالیت آن در آزمایش گلدانی به تنهایی و در ترکیب با کود شیمیایی بررسی شد. در این مطالعه از سه خاک با ویژگیهای فیزیکی و شیمیایی مختلف استفاده شد و نتایج تجزیه و تحلیل شد.نتایج: نتایج نشان دادند تلقیح خاک‌ با سیانوباکتری منتخب ندولاریا به‌عنوان یک کود زیستی، میزان نیتروژن را در خاک کشاورزی و خاک مخلوط افزایش داد و بدین ترتیب امکان کاهش مصرف کودهای شیمیایی را فراهم کرد. این باکتری توانایی ارتقای برخی ویژگی‌های خاک را ازطریق افزایش مقادیر TN، SOC، SOM و تقویت فعالیت آنزیمی دارد.بحث و نتیجه‏ گیری: سیانوباکتری‌ منتخب باعث افزایش پایداری خاک ازنظر شکست مکانیکی و مقاومت در برابر خشک‌شدن شد و از این نظر ساختار خاک را بهبود بخشید؛ این موضوع به‌ویژه در خاک مناطق خشک و بیابانی بسیار حائز اهمیت است.

مطالعه اپیدمیولوژی کریپتوسپوریدیوز در کودکان مبتلا به اسهال در استان چهارمحال و بختیاری

سمانه قایدامینی؛ مجتبی بنیادیان؛ یاسر پیرعلی

دوره 11، شماره 44 ، دی 1401، ، صفحه 95-103

https://doi.org/10.22108/bjm.2022.133132.1461

چکیده

چکیده مقدمه: عفونت کریپتوسپوریدیوم به‌عنوان عامل اصلی شیوع بیماری‌های منتقله از راه غذا و آب شناخته شده که نگرانی‌های بهداشت عمومی را در کشورهای توسعه‌یافته و درحال توسعه ایجاد کرده است. در مطالعه ... بیشتر چکیده مقدمه: عفونت کریپتوسپوریدیوم به‌عنوان عامل اصلی شیوع بیماری‌های منتقله از راه غذا و آب شناخته شده که نگرانی‌های بهداشت عمومی را در کشورهای توسعه‌یافته و درحال توسعه ایجاد کرده است. در مطالعه حاضر، شیوع و عوامل خطر ابتلا به کریپتوسپوریدیوم در کودکان مبتلا به اسهال در جوامع شهری و روستایی استان چهارمحال و بختیاری بررسی شدند. مواد و روش‌ها: در مجموع، 400 نمونه به‌صورت تصادفی از مدفوع کودکان مبتلا به اسهال مراجعه‌کننده به بیمارستان‌های شهرکرد و آزمایشگاه‌های تشخیص طبی گرفته شدند. بخشی از نمونه برای تست PCR، فریز و بخشی برای رنگ‌آمیزی زیل نلسون تغییریافته استفاده شد. نمونه‌هایی که از لحاظ میکروسکوپی آلودگی به کریپتوسپوریدیوم در آنها مثبت تلقی شدند، برای تعیین سویه انگل نیز با تست PCR ارزیابی شدند. نتایج: میزان شیوع کریپتوسپوریدیوم در نمونه‌های گرفته‌شده 5/3 درصد بود. همچنین نتایج نشان دادند 85 درصد کودکان مبتلا به کریپتوسپوریدیوز در سن زیر 6 سال و تنها 15 درصد در سن 6 تا 12 سال بوده‌اند (P<0.05). براساس نتایج، میزان شیوع کریپتوسپوریدیوم در روستاییان، 5 درصد و در شهر حدود 2 درصد است (P<0.05). همچنین، 95 درصد روستاییان مبتلا و 85 درصد افراد شهری مبتلا، در یک ماه قبل از مراجعه، حداقل یک بار تماس با حیوان داشته‌اند (P<0.05). نتایج بیان می‌کنند میزان شیوع در فصل‌های بهار و تابستان بیشتر از فصول سرد بوده است (P<0.05)؛ اما بین دو جنس مذکر و مؤنث تفاوت آماری معنی‌داری مشاهده نشد (P>0.05). نتایج آزمون PCR نشان دادند همه نمونه‌های مثبت تک‌یاخته کریپتوسپوریدیوم پارووم بودند. بحث و نتیجه‏ گیری: به‌طور کلی نتایج نشان دادند میزان شیوع و بروز کریپتوسپوریدیوز در کودکان با عواملی مانند سن، سبک زندگی، تماس با حیوان و فصل ارتباط دارد. همچنین گونه غالب در این منطقه کریپتوسپوریدیوم پارووم است.

تعیین تنوع قارچی در یک منطقه نیمه خشک بیابانی با استفاده از توالی یابی نسل دوم

مریم تیموری؛ پریسا محمدی؛ عادل جلیلی

دوره 11، شماره 44 ، دی 1401، ، صفحه 159-168

https://doi.org/10.22108/bjm.2022.134408.1478

چکیده

چکیده مقدمه: اهمیت قارچ‌ها در اکوسیستم‌های خشکی بسیار درخور توجه است؛ با وجود این، دانش ما دربارة انتشار و تنوع قارچ‌ها در زیستگاه‌های طبیعی به‌ویژه اکوسیستم‌های نیمه‌خشک کم است. به‌منظور داشتن ... بیشتر چکیده مقدمه: اهمیت قارچ‌ها در اکوسیستم‌های خشکی بسیار درخور توجه است؛ با وجود این، دانش ما دربارة انتشار و تنوع قارچ‌ها در زیستگاه‌های طبیعی به‌ویژه اکوسیستم‌های نیمه‌خشک کم است. به‌منظور داشتن اطلاعات مناسب از ساختار جوامع قارچی و تأثیرعوامل محیطی بر ترکیب جوامع قارچی چنین محیط‌هایی، تنوع قارچی در کنار ویژگی‌های شیمیایی خاک بررسی شد. مواد و روش‏‏ها: نمونه‌برداری از خاک در بهار و تابستان از دو ناحیه سرد و گرم اکوسیستم نیمه‌خشک واقع در استان کرمان انجام شد. ویژگی‌های شیمیایی خاک با استفاده از روش‌های استاندارد خاک تعیین شدند. قارچ‌های ساکن در خاک با استفاده از توالی‌یابی نسل دوم ناحیه ITS (ITS1f-ITS2) تعیین شدند. نتایج: با تجزیه و تحلیل یافته‌های حاصل از پلت‌فرم Illumina Miseq، 1542 واحد عملکردی تاکسونومی در نمونه‌های خاک مطالعه‌شده شناسایی شدند. تفاوت مشاهده‌شده در ترکیب جمعیت قارچی دو ناحیه سرد و گرم می‌تواند ناشی از اختلاف چشمگیر شرایط محیطی این دو ناحیه ازجمله تفاوت در میزان رطوبت و کربن آلی خاک باشد. آسکومیکوتا، شاخه غالب قارچی شناسایی‌شده بود و در مرتبه بعدی بازیدیومیکوتا فراوانی بیشتری داشت. بحث و نتیجه ‏گیری: قارچ‌های متنوعی در این اکوسیستم شناسایی شدند. برای آگاهی از نقش گونه‌های غالب قارچی در اکوسیستم‌های نیمه‌خشک به مطالعات بیشتری نیاز است.

شناسایی ساختار جمعیت دو اندوفیت قارچی Fusarium sp. وThielavia sp. و فراوانی مکانی-زمانی آنها در بافت‌های مختلف شش گونة گیاه هالوفیت

سهیلا آقائی درگیری؛ داود صمصام پور؛ مجید عسکری سیاهویی؛ عبدالنبی باقری

دوره 11، شماره 43 ، مهر 1401، ، صفحه 1-11

https://doi.org/10.22108/bjm.2021.129745.1405

چکیده

مقدمه: به نظر می‌رسد همه گیاهان در اکوسیستم‌های طبیعی با اندوفیت‌های قارچی همزیست‌اند. این گروه بسیار متنوع از قارچ‌ها می‌توانند ازطریق کمک به تحمل تنش غیرزیستی و زیستی، افزایش زیست‌توده و کاهش ... بیشتر مقدمه: به نظر می‌رسد همه گیاهان در اکوسیستم‌های طبیعی با اندوفیت‌های قارچی همزیست‌اند. این گروه بسیار متنوع از قارچ‌ها می‌توانند ازطریق کمک به تحمل تنش غیرزیستی و زیستی، افزایش زیست‌توده و کاهش مصرف آب یا تغییر در تخصیص منابع، تأثیرات عمیقی بر جوامع گیاهی داشته باشند.مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش تنوع زیستی مکانی - زمانی اندوفیت‌های قارچی Fusarium sp. وThielavia sp. جداسازی‌شده از شش گونة گیاه هالوفیت بررسی شد. تنوع زیستی مکانی - زمانی دو اندوفیت قارچی مزبور در بافت‌های مختلف گونه‌های گیاهی هالوفیت با استفاد از شاخص‌های سیمپسون، شانون و غنای مارگالف با نرم‌افزار PAST ارزیابی شد. برای شناسایی مولکولی قارچ‌ها از آغازگر اختصاصی ITS استفاده شد.نتایج: نتایج نشان دادند بیشترین فراوانی مربوط به اندوفیت قارچی Thielavia sp. به میزان 75/21 درصد در ساقه بود. با بررسی شاخص‌های تنوع سیمپسون، شانون و غنای مارگالف مشخص شد بیشترین تنوع اندوفیت قارچی برای شاخص‌های مزبور به‌ترتیب 498/0، 691/0 و 445/0 در ساقه گونة گیاهیBienertia cycloptera بود. همچنین نتایج شاخص تنوع سیمپسون و شانون نشان دادند بیشترین میزان تنوع اندوفیت قارچی به میزان 500/0 و 693/0 در گونه‌های گیاهی جزیرة ابوموسی و برای شاخص غنای مارگالف بیشترین میزان تنوع اندوفیت قارچی 455/0 در بندر سیریک مشاهده شد.بحث و نتیجه‏گیری: نتایج این پژوهش تنوع بالای مکانی - زمانی دو گونة اندوفیت قارچی مدنظر در شش گونة گیاهی شورپسند مطالعه‌شده را نشان می‌دهد. براساس این اطلاعات می‌توان نتیجه‌گیری کرد تأمین اندوفیت از محل‌های جغرافیایی با تنوع بالای گونه‌های گیاهی، در موفقیت‌آمیزبودن برنامة کلونیزاسیون گیاهان مؤثر است.

تنوع و توزیع مکانی قارچ‌های اندوفیت فندق (Corylus avellana) در رویشگاه‌های مختلف آن در ایران

آرزو کاشانیان؛ ناصر پنجه که؛ فاختک طلیعی

دوره 10، شماره 40 ، دی 1400، ، صفحه 53-69

https://doi.org/10.22108/bjm.2021.125722.1345

چکیده

مقدمه: اندوفیت‌ها یا درون‌رست‌ها گروه بزرگ و متنوعی از ریزموجوداتی‌اند که بدون ایجاد علائم در بافتها یا اندامهای گیاهان زندگی می‌کنند. اندوفیت‌ها نقش مهمی در حفاظت از گیاه در برابر تنش‌های ... بیشتر مقدمه: اندوفیت‌ها یا درون‌رست‌ها گروه بزرگ و متنوعی از ریزموجوداتی‌اند که بدون ایجاد علائم در بافتها یا اندامهای گیاهان زندگی می‌کنند. اندوفیت‌ها نقش مهمی در حفاظت از گیاه در برابر تنش‌های زیستی و غیرزیستی دارند. هدف مطالعة حاضر جداسازی و شناسایی قارچ‌های اندوفیت در Corylus avellana L. و ارزیابی اثرات احتمالی بافتهای مختلف و شرایط جغرافیایی بر جوامع آنها بود. مواد و روش‏‏ها: نمونه‌گیری از اندام‌های سالم (برگ، ساقه و ریشه) گیاه فندق در استان‌های گلستان، مازندران، گیلان، اردبیل، زنجان و قزوین در شمال و شمال غربی ایران انجام شد. به دنبال ضدعفونی سطحی، قارچهای اندوفیت با استفاده از تکنیک‌های استاندارد کشت، جداسازی و براساس مشخصات ریختشاسی شناسایی شدند. نمایندگان هر گونه به روش مولکولی و توالی‌یابی نواحی ITS ‐rDNA، LSU، TEF1 و β-tubulin شناسایی شدند. دادهها با استفاده از شاخصهای تنوع و تحلیل تناظری (CA) تجزیه و تحلیل شدند. نتایج: درمجموع، 791 جدایة قارچی اندوفیت از برگهای سالم (39 درصد)، ساقهها (65/35 درصد) و ریشهها (16/25 درصد) به دست آمد که به 24 گونة قارچی متعلق به هفت راسته در چهار ردة قارچی طبقهبندی شدند که شامل Dothideomycetes (Capnodiales و Pleosporales)، Sordariomycetes (Diaporthales و Hypocreales)، Eurotiomycetes (Eurotiales و Chaetothyriales) و Agaricomycetes (Polyporales) بودند. Ascomycota و Basidiomycota به‌ترتیب 2/96 و 8/3 درصد از جدایه‌ها را تشکیل دادند. ساقه و ریشه به‌ترتیب بیشترین و کمترین میزان کل کلونیزاسیون و شاخصهای تنوع قارچهای اندوفیت را داشتند. همچنین، شاخصهای تنوع اندوفیتها در گیلان از سایر استان‌های مورد مطالعه بیشتر بودند. بحث و نتیجه‏گیری: فراوانی و تنوع اندوفیت‌های قارچی در گیاه C. avellana تأثیرگرفته از عواملی مانند شرایط جغرافیایی، تنوع زیستی و نوع بافت‌اند؛ بنابراین، آگاهی از ویژگی‎های بافت‌های مختلف گیاهی، مکان‌های متعدد نمونه‌برداری و شاخص‌های اکولوژیکی مربوط به آنها، به درک علت وجود تنوع زیستی بالا در جمعیت قارچ‎های اندوفیت مربوط به یک گونة گیاهی خاص کمک می‌کند.

بررسی اثرات ضد‏قارچی چند سویة Trichoderma علیه چهار بیمارگر ریشه‏ و طوقة لوبیا چشم‏ بلبلی

صدیقه خدادادی پورارپنایی؛ مهدی مهرابی کوشکی؛ رضا فرخی نژاد

دوره 10، شماره 39 ، مهر 1400، ، صفحه 51-63

https://doi.org/10.22108/bjm.2021.125835.1349

چکیده

مقدمه: این تحقیق برای جداسازی و شناسایی بیمارگرهای طوقه و ریشة لوبیا چشم‏بلبلی در استان خوزستان انجام شد. علاوه بر این، اثرات ضد‏قارچی نه سویة انتخاب‏شده از پنج گونة Trichoderma روی چهار بیمارگر طوقه ... بیشتر مقدمه: این تحقیق برای جداسازی و شناسایی بیمارگرهای طوقه و ریشة لوبیا چشم‏بلبلی در استان خوزستان انجام شد. علاوه بر این، اثرات ضد‏قارچی نه سویة انتخاب‏شده از پنج گونة Trichoderma روی چهار بیمارگر طوقه و ریشة لوبیا چشم‏بلبلی بررسی شدند. مواد و روش‏‏ها: از بیست سویة به‌دست‏آمده، چهار سویه برای مطالعة بیشتر، شامل آزمون بیماری‌زایی و سنجش سیدروفور انتخاب شدند. میزان نسبی تولید سیدروفور توسط نه سویة انتخاب‌شده از پنج گونة Trichoderma و بیمارگرها با استفاده از روش CAS سنجش شد. رشد شعاعی پرگنه‏های بیمارگر در مقابل سویه‏های Trichoderma در قالب یک طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار بررسی شد. ناحیة ITSسویه‏های بیمارگر تکثیر و توالی‏یابی شدند. توالی‏های به‌دست‏آمده با سویه‏های شناخته‏شده با استفاده از جستجوی بلاست و تجزیه و تحلیل تبارزایی با الگوریتم درست‏نمایی بیشینه (ML) مقایسه شدند. نتایج: بیمارگرهای ذیل شناسایی شدند: Rhizoctonia solani، Fusarium chlamydosporum، F. falciforme و Macrophomina phaseolina. تمام سویه‏های Trichoderma و بیمارگرها در محیط کشت با فقر آهن، سیدروفور تولید کردند. سویه‏های T. koningiopsis SCUA-Arak-96 و T. pleuroticola SCUA-Isf-15 به‌ترتیب حداقل (31 درصد) و حداکثر (85 درصد) تولید سیدروفور را داشتند. در آزمون کشت دوگانه، بیشتر سویه‏های Trichoderma رشد قارچ‏های بیمارگر را در سطح معنی‏داری کاهش دادند. بیشترین اثر ضد‏قارچی برای سویة‏ T. virens SCUA-Ham-65 با 30 و 29 درصد بازدارندگی روی بیمارگرهای F. chlamydosporum و F. falciforme مشاهده شد. بحث و نتیجه‏گیری: R. solani،F. chlamydosporum،F. falciforme وM. phaseolinaمهم‏ترین بیمارگرهای ایجاد‏کنندة پوسیدگی طوقه و ریشة لوبیا چشم‏بلبلی در استان خوزستان‌اند. سویه‏های Trichoderma سیدروفور تولید کردند که باعث کلاته‏شدن آهن حد‏اقلی محیط می‏شود. علاوه بر این، آنها رشد بیمارگرهای گیاهی را در محیط آزمایش کاهش می‏دهند.

بررسی تنوع زیستی قارچ‌های اریزیفالز (Erysiphales) و میزبان‌های آنها در نواحی مرکزی و پیرامونی منطقة حفاظت‌شدة اشتران‌کوه

کرم سپه وند؛ مصطفی درویش نیا؛ سید اکبر خداپرست؛ عیدی بازگیر

دوره 10، شماره 39 ، مهر 1400، ، صفحه 65-86

https://doi.org/10.22108/bjm.2021.125396.1338

چکیده

مقدمه: ﺑﺮرﺳﻲ ﭘﻮﺷﺶ ﮔﻴﺎﻫﻲ مناطق حفاظت‌شده و عوامل آسیب‌رسان مانند قارچ‌های اریزیفالز، ﻋﺎﻣﻞ ﻣﻬﻤﻲ در ﺳﻨﺠﺶ و ارزﻳﺎﺑﻲ این مناطق‌اند. هدف از این تحقیق بررسی تنوع زیستی قارچ‌های اریزیفالز ... بیشتر مقدمه: ﺑﺮرﺳﻲ ﭘﻮﺷﺶ ﮔﻴﺎﻫﻲ مناطق حفاظت‌شده و عوامل آسیب‌رسان مانند قارچ‌های اریزیفالز، ﻋﺎﻣﻞ ﻣﻬﻤﻲ در ﺳﻨﺠﺶ و ارزﻳﺎﺑﻲ این مناطق‌اند. هدف از این تحقیق بررسی تنوع زیستی قارچ‌های اریزیفالز و میزبان‌های آنها در نواحی مرکزی و پیرامونی اشتران‌کوه است. این بررسی مبنایی برای مطالعات بیشتر و ارائه اطلاعات اولیة زیست‌سنجی گیاهان این مناطق ازنظر آلودگی به عوامل بیماری‌زا است. مواد و روش‏‏ها: به‌منظور بررسی وضعیت تنوع زیستی این قارچ‌ها و گیاهان میزبان آنها 10 پلات از ناحیة مرکزی و به همین تعداد از نواحی پیرامونیمنطقة حفاظت‌شدة اشتران‌کوه، انتخاب و تعداد گونة گیاهی آلوده و گونه‌های قارچی در این مناطق با استفاده از مشخصات ریخت‌شناسی شناسایی شدند. سپس شاخص‌های تنوع زیستی سیمپسون (Simpson)، شانون (Shannon)، شاخص یکنواختی ایونس (Eviness) و غنای گونه‌ای مارگالف (Margalef) و منهینیک (Menhenik) این گونه‌ها با نرم‌افزار PASTمحاسبه و درصد‌های فراوانی نسبی و فراوانی کل این گونه‌ها نیز برآورد شدند. بررسی همبستگی شاخص‌های تنوع و غنا با استفاده از آزمون لون (levene Test) آنالیز شد. نتایج: هجده گونة قارچ بیماری‌زا از شش جنس روی 40 گونة گیاهی از 15 تیره شناسایی شدند. بیشترین فراوانی نسبی قارچ‌ها مربوط به جنس لویلولا (Leveillula) و بیشترین فراوانی نسبی گیاهان حساس مربوط به تیرة استراسه (Astreaceae) بود. ازنظر شاخص‌های تنوع زیستی، غنا و یکنواختی بین مناطق بررسی‌شده اختلاف معنی‌دار مشاهده نشد. بین طبقات ارتفاعی ازنظر فراوانی نسبی قارچ‌های بیماری‌زا و گیاهان آلوده اختلاف مشاهده شد و همبستگی بین شاخص‌های تنوع و شاخص‌های غنا در گیاهان آلوده و همبستگی بین این دو شاخص‌ در قارچ‌های بیماری‌زا با هم مثبت و معنی‌دار بود (01/0>p ). بحث و نتیجه‏گیری: گزارش بیشتر گونه‌های گیاهی میزبان این قارچ‌ها برای دنیا و ایران جدید است. خسارت این قارچ‌ها در کنار دیگر عوامل آسیب‌رسان و وضع بحرانی سطح در اشغال این گونه‌ها، گیاهان منطقه را تهدید می‌کند.

شناسایی قارچ‌های میکوریز آربوسکولار همزیست با برخی گیاهان در شهرستان رفسنجان بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی و توالی ناحیۀ بتاتوبولین

پریسا امینیان نسب؛ ابراهیم صداقتی؛ ثمین حسینی؛ روح الله صابری

دوره 10، شماره 38 ، تیر 1400، ، صفحه 27-40

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.123989.1311

چکیده

مقدمه: قارچ‌های میکوریز آربوسکولار (AMF) فراوان‌ترین عوامل ایجاد‌کنندۀ همزیستی بین قارچ و گیاه در خاک به شمار می‌آیند و ازاین‌رو، اهمیت اکولوژیکی و اقتصادی فراوانی دارند. مطالعۀ حاضر با هدف شناسایی ... بیشتر مقدمه: قارچ‌های میکوریز آربوسکولار (AMF) فراوان‌ترین عوامل ایجاد‌کنندۀ همزیستی بین قارچ و گیاه در خاک به شمار می‌آیند و ازاین‌رو، اهمیت اکولوژیکی و اقتصادی فراوانی دارند. مطالعۀ حاضر با هدف شناسایی گونه‌هایAMF همزیست با ریشۀ گیاهان مختلف بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی و مولکولی ژن بتاتوبولین در دو منطقۀ راویز و داوران شهرستان رفسنجان انجام شد. مواد و روش‏‏ها: نمونه‌برداری از منطقۀ ریزوسفر گیاهان مختلف انجام شد. اسپورهای AMF از خاک نمونه‌ها با استفاده از روش الک مرطوب جداسازی شدند. گروه‌بندی بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی مانند رنگ اسپور، شکل، تزئینات سطح، اندازه و ساختار دیوارۀ آنها و ویژگی‌های اسپورها در آب انجام شد. استخراج DNA از تک‌اسپور انجام شد و بخشی از ژن بتاتوبولین به روش PCR آشیانه‌ای سه‌مرحله‌ای با آغازگرهای مناسب تکثیر شد. محصول PCR نمونه‌های انتخابی به روش سنگر توالی‌یابی شد. رابطۀ فیلوژنتیکی توالی‌های انتخابی پس‌از اصلاح و بازبینی با استفاده از روش حداکثر احتمال با سایر جدایه‌های انتخابی از بانک ژن ارزیابی شد. نتایج: بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی و فیلوژنی مبتنی بر ژن بتاتوبولین، گونه‌های Funneliformis mosseae، Funneliformis coronatum، Gigaspora gigantea، Scutellospora calosporaو Septoglomus constrictum شناسایی شدند. گونۀ F. mosseae و پس‌از‌آن، گونۀ F.coronatumگونه‌های غالب در مناطق بررسی‌شده بودند. بحث و نتیجه‏گیری: ژن بتاتوبولین، راسته‌ها، خانواده‌ها و جنس‌های میکوریز آربوسکولار مطالعه‌شده در پژوهش حاضر را به‌خوبی از یکدیگر تفکیک کرد و تمام گونه‌های شناسایی‌شده در جایگاه تاکسونومیکی اختصاصی خود قرار گرفتند. نتایج تجزیه‌وتحلیل مولکولی تأیید‌کنندۀ نتایج شناسایی بر اساس ویژگی‌های ریخت‌شناسی بودند.

ارزیابی تأثیر استرپتومایسس‌های خاک‌برد بر شاخص‌های رشدی گیاه گوجه‌فرنگی در شرایط تنش زیستی ناشی از شبه‌قارچ Phytophthora nicotianae

ریحانه میجانی؛ غلامحسین شهیدی بنجار؛ سونیا عقیقی؛ اکرم صادقی

دوره 10، شماره 38 ، تیر 1400، ، صفحه 57-70

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.124279.1316

چکیده

مقدمه: شبه‌قارچ (Breda de Haan) Phytophthora nicotianaeبیمارگر گیاهی ویرانگر با انتشار جهانی است که سبب پوسیدگی ریشه، میوه، برگ و طوقة گیاه می‌شود. این میکروارگانیسم یکی از مخرب‌ترین اوومیست‌های بیمارگر گیاهی به شمار ... بیشتر مقدمه: شبه‌قارچ (Breda de Haan) Phytophthora nicotianaeبیمارگر گیاهی ویرانگر با انتشار جهانی است که سبب پوسیدگی ریشه، میوه، برگ و طوقة گیاه می‌شود. این میکروارگانیسم یکی از مخرب‌ترین اوومیست‌های بیمارگر گیاهی به شمار می‌رود. گونه‌های فیتوفتورا به‌عنوان عامل بیماری‌های مختلف در تعداد زیادی از گیاهان صیفی و جالیز شناخته شده‌اند که در اثر حمله به گیاه، علائمی مانند مرگ گیاهچه، سوختگی اندام‌های هوایی و پوسیدگی میوه، ساقه، طوقه و ریشه ایجاد می‌کنند و در بیشتر موارد نیز منجر به مرگ میزبان می‌شوند. زیان‌های اقتصادی ناشی از P. nicotianae به‌دلیل تنوع میزبان و خسارت‌های زیست‌محیطی آن بسیار زیاد است؛ ازاین‌رو، کنترل این بیمارگر یک چالش مداوم محسوب می‌شود. مواد و روش‏‏ها: به‌منظور کنترل بیولوژیک بیماری مزبور، از بین تعداد زیادی از اکتینومیست‌های خاکزی جداشده از استان کرمان سه جدایة M6، M8 و M215 انتخاب شدند که فعالیت ضد‌اوومیستی مؤثری علیه P. nicotianae نشان دادند. برای درک بهتر مکانیسم بازدارندگی این جدایه‌ها،آزمون کشت متقابل در شرایط آزمایشگاهی، اثر محرک رشدی و کنترل‌کنندگی بیمارگر ازطریق کاربرد جدایه‌های آنتاگونیست در شرایط گلخانه‌ای و شناسایی مولکولی آنتاگونیست منتخب با اعمال بهترین اثر مهارکنندگی بر بیماری در گیاه گوجه‌فرنگی رقم Super Chefانجام شد. نتایج: سه جدایة M6 ، M8و M215 جداشده از خاک به‌منظور ارزیابی فعالیت آنتاگونیستی علیه بیمارگر P. nicotianae در گیاه گوجه‌فرنگی ارزیابی شدند. از بین آنها جدایة M8 در شرایط آزمایشگاهی و گلخانه‌‌ای پس از آنالیز آماری، اثر مهارکنندگی بر بیماری پوسیدگی طوقه و ریشة گوجه‌فرنگی اعمال کرد. مقایسة عملکرد جدایه‌های ارزیابی‌شده در شرایط گلخانه‌ای نشان داد جدایة M8 بیشترین تأثیر را در افزایش شاخص‌ها‌ی رشد گیاه گوجه‌فرنگی رقم Super Chef شامل ارتفاع بوته، تعداد گل، وزن خشک اندام هوایی و وزن خشک ریشه داشت. جدایة مزبور براساس آنالیز توالی زیرواحد کوچک RNA ریبوزومی (16S rRNA)، شناسایی و براساس نتایج حاصل سویة شاخص Streptomyces venetus CMU-AB225T بالاترین شباهت (08/96 درصد) را با جدایة M8 داشت. بحث و نتیجه‏گیری: امید است بتوان از سویة M8 S. venetus درکودها‌ی زیستی و تولید ترکیبات بازدارندة زیستی برای بیوکنترل بیمارگرهای گیاهی استفاده کرد. در این خصوص، در تحقیقاتی گزارش شده است که استفاده از عوامل مختلف کنترل زیستی مانند Trichoderma. harzianum و T. asperellum در کمپوست غنی‌شده می‌تواند برای کاهش علائم P. nicotianae در نهال‌های فلفل مؤثر باشد. در این راستا، تولید محصول بر پایة باکتری M8 S. venetus مستلزم انجام تحقیقات فراتری است؛ ازجمله برهمکنش باکتری مزبور با سایر میکروارگانیسم‌های مفید خاکزی و عدم تأثیر منفی در جمعیت میکروب‌های مفید خاک، بررسی دامنة فعالیت ضدمیکروبی باکتری علیه سایر قارچ‌ها و باکتری‌های بیمارگر گیاهی و ملاحظات ایمنی زیستی.

جداسازی مخمرها از رسوبات آبی و بررسی ویژگی‌های آنزیمی آنها

شهره نصیری پروج؛ عباس اخوان سپهی؛ فرزانه حسینی؛ محدثه لاری پور

دوره 10، شماره 37 ، فروردین 1400، ، صفحه 1-12

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.121015.1263

چکیده

مقدمه: رسوبات آبی رودخانه‌ها و دریای خزر به‌علت ایجاد شرایط مناسب، زیستگاه‌های میکروسکوپی متعددی را برای جامع‌ بزرگی از اعضای میکروبی فراهم می‌کند که فعالانه به تولید آنزیم‌های سوختی بپردازند. مواد ... بیشتر مقدمه: رسوبات آبی رودخانه‌ها و دریای خزر به‌علت ایجاد شرایط مناسب، زیستگاه‌های میکروسکوپی متعددی را برای جامع‌ بزرگی از اعضای میکروبی فراهم می‌کند که فعالانه به تولید آنزیم‌های سوختی بپردازند. مواد و روش‏‏ها: نمونه‌برداری رسوبات سطحی برخی رودخانه‌های مسیر شهرستان‌های رشت و انزلیرودخانۀ سفیدرود، سیاه‌رود، رود هراز و دریای خزر انجام شد. نمونه‌ها در محیط YGC آگار به روش پور‌پلیت کشت داده شدند. قارچ‌های حاصل از رشد روی پلیت‌های یادشده ازنظر حضور آنزیم‌های پروتئاز، آمیلاز، لیپاز، Dnase، کیتیناز، لسیتیناز و پکتیناز بررسی شدند؛ در ادامه، افتراق بین جدایه‌های مخمری با محیط‌های کروم‌آگار انجام و شناسایی مولکولی جدایه‌های جداسازی‌شده به روش PCR و در ادامه، توالی‌یابی محصولات PCR انجام شد. نتایج: چهار جدایۀ بررسی‌شده طی سه مرحله نمونه‌برداری از چهارده ایستگاه از رسوبات رودخانه‌ها و دریای خزر پس‌از تهیۀ رقت‌های پی‌درپی و کشت روی YGC آگار جدا شدند. همۀ جدایه‌ها آنزیم لیپاز، DNase و آمیلاز و دو جدایه آنزیم پروتئاز و لسیتیناز را تولید می‌کردند. هیچ‌یک از جدایه‌ها توانایی تولید آنزیم کیتیناز و پکتیناز را نداشتند. دو جدایۀ SH002 و SH007 بیشترین تنوع آنزیمی را داشتند. شناسایی بیوشیمیایی و ریخت‌شناختی چهار جدایه و سپس شناسایی ژنتیکی دو جدایۀ SH002 و SH014 انجام شد که به‌ترتیب به گونه‌های Candida tropicalisو Candida fameta شبیه بودند. بحث و نتیجه‏گیری: بر اساس بررسی‌های انجام‌شده در منابع در‌دسترس، گزارش‌هایی از فعالیت پکتینازی و کیتینازی در مخمرهای جداشده از منابع مختلف مشاهده می‌شوند که در توضیح این مشاهده می‌توان گفت علاوه‌بر تأثیر عوامل، منطقه‌ای که مخمر از آن جداسازی شده است، ممکن است بر تولیدشدن یا تولیدنشدن این آنزیم‌ها تأثیرگذار باشد.

جداسازی و شناسایی باکتری‌های مقاوم به علف‌کش‌های اُتللو، آتلانتیس و پوماسوپر از خاک مزارع گندم

عبدالرضا احمدی؛ حسین میرزایی نجفقلی؛ میلاد آئینی؛ کاظم کاکولوند

دوره 10، شماره 37 ، فروردین 1400، ، صفحه 67-77

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.122745.1296

چکیده

مقدمه: یکی از روش‌های نوین برای کاهش آلودگی‌های ناشی از کاربرد علف‌کش‌ها و سایر سموم شیمیایی کشاورزی، استفاده از جدایه‌های باکتریایی متحمل و تجزیه‌کنندۀ این علف‌کش‌هاست. پژوهش حاضر به‌منظور جداسازی ... بیشتر مقدمه: یکی از روش‌های نوین برای کاهش آلودگی‌های ناشی از کاربرد علف‌کش‌ها و سایر سموم شیمیایی کشاورزی، استفاده از جدایه‌های باکتریایی متحمل و تجزیه‌کنندۀ این علف‌کش‌هاست. پژوهش حاضر به‌منظور جداسازی و شناسایی جدایه‌های باکتریایی مقاوم یا متحمل در برابر علف‌کش‌های اُتللو، آتلانتیس و پوماسوپر از خاک مزارع گندم انجام‌ شد. مواد و روش‏‏ها: نمونه‌برداری از خاک مزارع گندم تیمار‌شده با سه علف‌کش اُتللو، آتلانتیس و پوماسوپر انجام شد. جدایه‌های باکتریایی با استفاده از محیط‌کشت سوکسینات استاندارد حاوی 10 درصد از علف‌کش‌های آزمایش‌شده جداسازی شدند. جدایه‌های نماینده بر اساس آزمون‌های بیوشیمیایی و تکثیر ژن 16S rRNA شناسایی شدند. کمترین غلظت مهارکنندگی و کمترین غلظت کشندگی برای هر سه علف‌کش آزمایش‌شده محاسبه شد. نتایج: درمجموع، تعداد 17 جدایه توانایی رشد روی محیط‌های رشد حاوی 10 درصد از علف‌کش‌های آزمایش‌شده را داشتند. بر اساس کلیدهای باکتری‌شناسی معتبر و نتایج آزمون‌های مولکولی روی جدایه‌های نماینده، استنوتروفوموناس مالتوفیلیا، انسیفر ادهائرنس، زانتوموناس، سودوزانتوموناس و اسینتوباکتر شناسایی شدند. کمترین غلظت مهارکنندگی و کمترین غلظت کشندگی در علف‌کش‌های اُتللو (به‌ترتیب 28/0 و 4/0) و آتلانتیس (به‌ترتیب 35/0 و 5/0) برای اسینتوباکتر و در علف‌کش پوماسوپر برای جنس زانتوموناس (به‌ترتیب 45/0 و 67/0) محاسبه شد. بحث و نتیجه‏گیری: باتوجه‌به نتایج پژوهش حاضر، شناسایی جدایه‌های متحمل و تعیین میزان تحمل آنها به علف‌کش‌های یادشده، گامی مهم در پژوهش‌های زیست‌فناوری آینده به‌منظور پالایش آلاینده‌ها از محیط‌های آلوده است و می‌تواند مشکلات زیست‌محیطی ناشی از این علف‌کش‌ها در اکوسیستم را کاهش دهد؛ ازاین‌رو، پژوهش‌های بیشتر برای تعیین توانایی جدایه‌های باکتریایی مقاوم در تجزیه‌کنندگی علف‌کش‌های یادشده پیشنهاد می‌شود.

Characterization of Psychrophilic and Psychrotolerant Cultivable Bacteria in Alpine Soil in Iran

الهام لشنی؛ بهار شهنواز؛ علی مخدومی

دوره 9، شماره 36 ، دی 1399، ، صفحه 47-57

https://doi.org/10.22108/bjm.2020.121439.1273

چکیده

مقدمه: در اکوسیستم‌های سرد، باکتری‌ها نقشی حیاتی در چرخه‌های بیوشیمیایی، تجزیۀ زیستی آلاینده‌ها و زیست‌فناوری دارند؛ به‌همین‌علت در سال‌های اخیر، توجه زیادی به شناسایی و ارزیابی آنزیم‌های خارج‌سلولی ... بیشتر مقدمه: در اکوسیستم‌های سرد، باکتری‌ها نقشی حیاتی در چرخه‌های بیوشیمیایی، تجزیۀ زیستی آلاینده‌ها و زیست‌فناوری دارند؛ به‌همین‌علت در سال‌های اخیر، توجه زیادی به شناسایی و ارزیابی آنزیم‌های خارج‌سلولی آنها شده است. مواد و روش‏‏ها: در پژوهش حاضر، 43 باکتری سرمادوست یا مقاوم به سرما از خاک‌های آلپی در محیط‌کشت‌های متفاوت جداسازی و مشخصه‌یابی شدند و توانایی باکتری‌های یادشده در تولید آنزیم‌های خارج‌سلولی مطالعه شد. نتایج: باکتری‌های مطالعه‌شده به پنج گروه اصلی شامل Actinobacteria، Firmicutes،γ-proteobacteria α و Bacteroidetes تعلق داشتند و درمجموع، تعداد 9 جنس شناسایی شدند که جنس‌های Arthrobacter، Bacillusو Pseudomonas فراوانی بیشتری را نشان دادند. بحث و نتیجه‏گیری: تمام سویه‌های به‌دست‌آمده توانایی تولید حداقل یک آنزیم خارج‌سلولی را داشتند و فعالیت پروتئولیتیک و آمیلولیتیک در بین سویه‌ها بیشتر بود. فعالیت سلولاز و پکتیناز به‌ترتیب در 44 و 22 درصد سویه‌ها مشاهده شد. مطالعۀ حاضر نشان داد هنگامی که علاقه‌مند به یافتن منابع زیستی برای تولید آنزیم‌های خارج‌سلولی فعال در سرما به‌منظور باز‌کردن پنجره‌های جدید برای کاربردهای زیست‌فناوری باشیم، باکتری‌ها در محیط‌های سرد نامزدهای مناسبی برای جستجو هستند

بررسی تنوع میکروبی میدان نفتی سیلاب زنی نشده با دمای بالا در جنوب ایران

محسن پورنیا؛ نیما بهادر؛ میثم طباطبائئ؛ رضا آذربایجانی؛ قاسم حسینی سالکده

دوره 8، شماره 32 ، دی 1398، ، صفحه 15-23

https://doi.org/10.22108/bjm.2019.113951.1170

چکیده

مقدمه: با وجود توانایی رشد و سازگاری باکتری‌ها و ارکی‌ها درون میدان‌های نفتی طی سالیان دراز، تاکنون بررسی جامعی برای شناسایی تنوع میکروبی میادین نفتی با دمایی بالا در ایران صورت نگرفته است. از این رو ... بیشتر مقدمه: با وجود توانایی رشد و سازگاری باکتری‌ها و ارکی‌ها درون میدان‌های نفتی طی سالیان دراز، تاکنون بررسی جامعی برای شناسایی تنوع میکروبی میادین نفتی با دمایی بالا در ایران صورت نگرفته است. از این رو در این مطالعه تنوع میکروبی میدان نفتی سیلاب زنی نشده ذیلایی (ZZ) با دمایی بالا در جنوب ایران مورد شناسایی قرار گرفت. مواد و روش ها: در این بررسی برای اولین مرتبه تنوع جمعیت های مختلف میکروبی میدان نفتی سیلاب زنی نشده ذیلایی با دمایی بالا به روش توالی یابی نسل نوین ژن های 16S rRNA مورد ارزیابی قرار گرفت.نتایج: نتایج بدست آمده در این تحقیق نشان می دهد که فراوان ترین باکتری های شناسایی شده متعلق به شاخه Firmicutes (Bacilli) و Thermotoga می‌باشند. سایر شاخه‌های باکتریایی (Proteobacteria , Actinobacteria و Synergistetes) در مقادیر بسیار کم شناسایی گردیدند. باکتری‌های Bacillus subtilis ، B. licheniformis ، Petrotoga mobilis ، P. miotherma ، Fervidobacterium pennivorans و Thermotoga subterranea با فراوانی بالا مشاهده شدند. از سویی دیگر فراوان‌ترین آرکی شناسایی شده نیز متعلق به Methanothermobacter thermautotrophicus بود.بحث و نیجه گیری: با وجود گزارش های زیادی از محققین مختلف در رابطه با بررسی میادین نفتی، برای اولین مرتبه وجود مقادیر زیاد گونه‌های مختلف باسیلوس درون یک میدان نفتی با دمایی بالا گزارش می گردد.

بهره‌گیری از انگشت‌نگاری PCR-DGGE و تنفس خاک برای شناخت دگرگونی‌های باکتریایی در خاک‌های آلوده به فلزهای سنگین

محمدحسین همت جو؛ علی اکبر صفری سنجانی؛ اصغر میرزایی اصل؛ آرزو طهمورث پور

دوره 8، شماره 29 ، فروردین 1398، ، صفحه 41-56

https://doi.org/10.22108/bjm.2018.111786.1142

چکیده

مقدمه: آلودگی خاک به فلزهای سنگین سرب و روی پیرامون کانسارهای این فلزها باعث دگرگونی ساختار، پیچیدگی، گوناگونی و کارکرد ریزجانداران خاک مانند باکتری‌ها می‌شود.‏‏ مواد و روش‏‏ها: برای بررسی پیامد ... بیشتر مقدمه: آلودگی خاک به فلزهای سنگین سرب و روی پیرامون کانسارهای این فلزها باعث دگرگونی ساختار، پیچیدگی، گوناگونی و کارکرد ریزجانداران خاک مانند باکتری‌ها می‌شود.‏‏ مواد و روش‏‏ها: برای بررسی پیامد آلودگی معدن سرب و روی باما در اصفهان بر گوناگونی ریزجانداران خاک‌های پیرامون خود از روش نشانگر مولکولی موسوم به انگشت‌نگاری PCR-DGGE بهره‌گیری شد. 9 نمونه از خاک‌های معدن باما با میزان آلودگی‌های کم تا زیاد برداشت شدند و پس‌از استخراج DNA هریک از خاک‌ها، ناحیۀ 468 جفت بازی درون ژن 16SrRNA با PCR تکثیر شد. سپس الکتروفورز DGGE انجام شد و اثر انگشت‌های باکتریایی روی ژل به دست آمدند و برای برآورد گوناگونی ریزجانداران بهره‌برداری شدند. همچنین با اندازه‌گیری تنفس پایه (BR) و برانگیختۀ (SIR) خاک و محاسبۀ بهرۀ متابولیک، تغییرات کارکرد ریزجانداران خاک بررسی شد. نتایج: پیچیدگی و گوناگونی باکتری‌های خاک با افزایش مقدار در دسترس فلزهای سنگین سرب و روی کاهش می‌یابد و ساختار و گوناگونی آنها دگرگون‌ می‌شود. فراوانی نسبی باکتری‌های پایدارتر با افزایش آلودگی خاک به فلزهای یادشده افزایش می‌یابد. آلودگی خاک کارکرد باکتری‌ها را کاهش می‌دهد؛ به‌طوری‌که تنفس برانگیختۀ خاک کاهش می‌یابد. تنفس برانگیخته و بهرۀ متابولیک پاسخ نمایان‌تری به آلودگی خاک می‌دهند و برای سنجش چگونگی خاک بهتر از تنفس پایه هستند. بحث و نتیجه‏گیری: اگرچه گوناگونی باکتریایی با افزایش آلودگی کاهش معناداری نشان می‌‌دهد در خاک‌های بسیار آلوده شاهد گوناگونی به‌‌نسبت زیادی هستیم و علت آن احتمالاً مدت زمان زیاد آلودگی خاک است؛ زیرا فرصت کافی برای باکتری‌ها وجود داشته است تا به این آلودگی سازگار شوند و باکتری‌های پایدار در خاک‌های آلوده تکثیر شوند. این توانایی سازگاری باکتری‌ها و کارکردهای مهم بوم‌شناختی که در تنش فلزهای سنگین ایفای نقش می‌کنند بسیار ارزشمند هستند و انجام پژوهش‌های بیشتر دربارۀ آنها را پیشنهاد می‌کنند.

جداسازی و شناسایی اندوفیت‏های قارچی لوبیا چشم‏ بلبلی در استان خوزستان

سحر جانبزرگی؛ مهدی مهرابی کوشکی؛ رضا فرخی نژاد

دوره 8، شماره 29 ، فروردین 1398، ، صفحه 97-115

https://doi.org/10.22108/bjm.2018.113754.1167

چکیده

مقدمه: اندوفیت‌ها ریزجاندارانی هستند که بدون هیچ‌گونه نشانۀ آشکاری در بافت‌های داخلی گیاهان ساکن می‏شوند. مطالعۀ حاضر با هدف شناسایی و جداسازی قارچ‌های اندوفیت لوبیا چشم‌بلبلی (Vigna unguiculata (L.) Walp.) ... بیشتر مقدمه: اندوفیت‌ها ریزجاندارانی هستند که بدون هیچ‌گونه نشانۀ آشکاری در بافت‌های داخلی گیاهان ساکن می‏شوند. مطالعۀ حاضر با هدف شناسایی و جداسازی قارچ‌های اندوفیت لوبیا چشم‌بلبلی (Vigna unguiculata (L.) Walp.) در استان خوزستان انجام شد. مواد و روش‏‏ها: در سال 1395، هشت نمونۀ گیاهی سالم از مناطق مهم زیرکشت لوبیا چشم‏بلبلی در شمال استان خوزستان جمع‌آوری شدند. قطعه‌های کوچکی از ریشه، ساقه، برگ و غلاف هر نمونه ضدعفونی سطحی عمیق و روی محیط‌غذایی سیب‌زمینی‌دکستروز‌آگار کشت شدند. 60 جدایۀ قارچی حاصل به روش تک‏اسپور خالص‏سازی و 21 جدایه بر اساس ویژگی‌های ریخت‏شناسی برای بررسی‏های مولکولی انتخاب شدند. جدایه‏ها در محیط سیب‌زمینی‌دکستروز‌براث رشد کردند و زیست‏تودۀ میسیلیومی با کاغذ صافی جمع‏آوری شد. استخراج DNA با استفاده از روش ارگانیک مبتنی بر فنل و کلروفرم انجام شد. بخش‏هایی از ژن nrRNA (نواحی ITS و 28S-D1/D2) با استفاده از آغازگرهای مناسب تکثیر و سپس توالی‌یابی شدند. نتایج: جدایه‏های بررسی‌شده بر اساس ویژگی‌های ریخت‏شناسی، نتایج جستجوی BLASTn و فیلوژنی مبتنی بر ناحیۀ ITS تجزیه‌وتحلیل شدند و بر اساس آن گونه‏های Alternaria destruens،Alternaria sp.،Curvularia mosaddeghii،Curvularia sp.، Fusarium chlamydosporum،F. nygamai، F. falciforme،F. proliferatum،Fusarium sp.،Macrophomina phaseolinaوPenicillium oxalicum شناسایی شدند. بحث و نتیجه‏گیری: جنس‏های Alternaria، Fusarium و Curvularia فراوان‏ترین اندوفیت‏های قارچی در گیاه لوبیاچشم‏بلبلی در زیست‏بوم گرم استان خوزستان هستند. بر اساس دانش ما، این نخستین مطالعه‏ای است که حضور اندوفیتی قارچ‏های Alternaria destruens،Alternaria sp.، M. phaseolina، Fusarium chlamydosporum،F. nygamai،F. falciforme،F. proliferatumوPenicillium oxalicum رادر گیاه لوبیا‏چشم بلبلی گزارش می‏کند.

شناسایی مولکولی سویۀ بومی ترائوستوکیتریوم 1-71 و تعیین کمی و کیفی تولید روغن و اسکوالن در آن

فرشاد خوش بصیرت؛ شهریار شاکری؛ محمود ملکی

دوره 8، شماره 29 ، فروردین 1398، ، صفحه 131-140

https://doi.org/10.22108/bjm.2018.110288.1119

چکیده

مقدمه: اسکوالن، هیدروکربن غیراشباع با شش پیوند دوگانه است. این اسید چرب زنجیره‌بلند کاربردهای بسیاری در صنایع آرایشی‌- بهداشتی، پزشکی، داروسازی و تولید سوخت‌های زیستی دارد. روغن کبد کوسۀ ماهیان منبع ... بیشتر مقدمه: اسکوالن، هیدروکربن غیراشباع با شش پیوند دوگانه است. این اسید چرب زنجیره‌بلند کاربردهای بسیاری در صنایع آرایشی‌- بهداشتی، پزشکی، داروسازی و تولید سوخت‌های زیستی دارد. روغن کبد کوسۀ ماهیان منبع معمول تولید اسکوالن است که در‌حال‌حاضر، استفاده از آن با محدودیت‌هایی مواجه است. ترائوستوکیتریوم جنسی از آغازیان تک‌سلولی دریازی متعلق به خانوادۀ ترائوستوکیتریدها است که توانایی تولید مقدار زیاد اسکوالن را دارد. مواد و روش‏‏ها: در پژوهش حاضر، میزان کیفی و کمی تولید اسکوالن، روغن و زیست‌توده در سویۀ بومی ترائوستوکیتریوم 1-71 جداسازی‌شده از سواحل جنوبی ایران از طریق TLC و HPLC بررسی شد؛ همچنین بررسی مولکولی این سویه با تجزیه‌وتحلیل و توالی‌یابی ژن 18S rDNA انجام شد. نتایج: نتایج نشان دادند سویۀ ترائوستوکیتریوم 1-71 متعلق به خانوادۀ ترائوستوکیتریدها و جنس ترائوستوکیتریوم به‌ترتیب میزان 12/4 و 25/1 گرم‌برلیتر زیست‌توده و روغن تولید می‌کند و 6/74 میلی‌گرم‌برلیتر اسکوالن در روز چهارم پس‌از کشت در محیط‌کشت GYP تولید می‌شود. بحث و نتیجه‏گیری: در پژوهش حاضر برای نخستین‌بار در خاورمیانه، تولید اسکوالن در سویۀ آغازی دریایی ترائوستوکیتریوم گزارش شد. امید است در آینده بتوان تولید این ماده را با بهینه‌کردن محیط‌کشت و شرایط کشت سویۀ یادشده در راستای تولید اسکوالن افزایش داد.

تجزیه زیستی ارگانوفسفره‌های دیازینون و کلروپیروفوس به وسیله دو باکتری جداسازی شده از خاک‌های آلوده کشاورزی

فاطمه امانی؛ علی‌اکبر صفری‌سنجانی؛ فیرروز ابراهیمی؛ شهرام نظریان

دوره 7، شماره 28 ، دی 1397، ، صفحه 27-39

https://doi.org/10.22108/bjm.2017.105946.1079

چکیده

مقدمه: حشره کش های ارگانوفسفره نظیر کلروپیروفوس و دیازینون به طور گسترده ای برای کنترل حشرات خانگی، کشاورزی و امور دامپزشکی به کار می رود. این ترکیبات یک تهدید برای سلامتی عمومی و محیط زیست به شمار می ... بیشتر مقدمه: حشره کش های ارگانوفسفره نظیر کلروپیروفوس و دیازینون به طور گسترده ای برای کنترل حشرات خانگی، کشاورزی و امور دامپزشکی به کار می رود. این ترکیبات یک تهدید برای سلامتی عمومی و محیط زیست به شمار می روند. از طرف دیگر نرخ تجزیه پایینی دارند و بنابراین می توانند برای مدت طولانی در خاک باقی بمانند. یکی از مهمترین فاکتور هایی که سرنوشت آفت کش های ارگانوفسفره را در خاک و آب تعیین می کند تجزیه زیستی است. مواد و روش‏‏ها: دو باکتری تجزیه کننده دیازینون و کلروپیروفوس از خاک های آلوده به آفت کش ها جدا سازی شد. گونه های باکتریهای جدا شده با استفاده 16S RNA ریبوزومی و آنالیز متیله کردن اسید های چرب شناسایی شدند. نتایج: همبستگی مثبتی بین رشد میکروبی و تجزیه دو ارگانوفسفات مشاهده شد. به طور متوسط گونه باکتری 1 و 2 به ترتیب 27/88 و 45/82 درصد از غلظت اولیه دیازینون و 07/81 و 35/88 درصد از غلظت ابتدایی کلروپیروفوس را در محیط کشت نمکی در طول 20 روز گرما گرماگذاری تجزیه کردند. گونه های باکتریهای جداسازی شده با عنوانAcinetobacter وPseudomonasspشناسایی شدند. بالاترین میزان تجزیه دیازینون توسط باکتری Acinetobacter و بالاترین مقدار تجزیه کلروپیروفوس توسط Pseudomonas در محیط های کشت نمکی مشاهده شد. بحث و نتیجه‏گیری: جدایه های خالص باکتری ها از این دو سم به عنوان منبع کربن استفاده کردند. این باکتری ها بیشتر ترکیبات سمی را در طول 20 روز تجزیه کردند. بنابراین باکتری های جداسازی شده پتانسیل زیست پالایی را در خاک های آلوده به دیازینون و کلروپیروفوس دارند.

شناسایی برخی جدایه‌های سیانوباکتریایی پارک ملی خبر کرمان با روش‌های کلاسیک و ‏مولکولی

زهرا حجتی؛ پریسا محمدی؛ عزت عسگرانی

دوره 7، شماره 27 ، مهر 1397، ، صفحه 25-35

https://doi.org/10.22108/bjm.2018.109584.1110

چکیده

مقدمه: پارک ملی خبر یکی از ذخیره‌گاه‌های طبیعی بسیار باارزش کشور است که تاکنون تنوع میکروبی آن بررسی نشده است. سیانوباکتری‌ها ازجمله موجودات زنده‌ای هستند که در بیشتر اکوسیستم‌های خاکی و آبی وجود ... بیشتر مقدمه: پارک ملی خبر یکی از ذخیره‌گاه‌های طبیعی بسیار باارزش کشور است که تاکنون تنوع میکروبی آن بررسی نشده است. سیانوباکتری‌ها ازجمله موجودات زنده‌ای هستند که در بیشتر اکوسیستم‌های خاکی و آبی وجود دارند و برخی مواد معدنی عامل محدودکنندۀ رشد این موجودات هستند. هدف پژوهش حاضر، بررسی حضور و شناسایی سیانوباکتری‌های موجود در خاک‌های مناطق دست‌خورده و دست‌نخورده در دو منطقۀ استپ سرد و گرم پارک خبر با استفاده از روش‌های کلاسیک و مولکولی است. مواد و روش‏‏ها: از 32 نمونۀ مختلف خاک پارک خبر که در فصل پاییز نمونه‌برداری شده بودند در محیط BG11کشت داده شد و جداسازی سیانوباکتری‌ها با استفاده از واکشت‌های متعدد انجام شد؛ سپس کلنی‌های خالص ازنظر ریخت‌شناسی با استفاده از کلید‌های شناسایی معتبر بررسی شدند. شناسایی مولکولی جدایه‌های یادشده با استفاده از تکثیر و تعیین توالی ژنوم ناحیۀ gene 16S rRNA انجام شد. ویژگی‌های خاک مناطق یادشده ازنظر فیزیکی و شیمیایی تجزیه‌وتحلیل شدند. نتایج: نتایج بررسی نشان دادند نوع بافت خاک لوم- شنی، میانگین میزان هدایت الکتریکی 12/99 میکروزیمنس بر سانتی‌متر و میانگین اسیدیتۀ خاک 29/8 است. جدایه‌های سیانوباکتری‌ها متعلق به جنس‌های Chroococcidiopsis sp.، Leptolyngbya sp.، Nodularia sp. و Synechococcus sp. بودند. نتایج تعیین توالیDNA با بانک‌های اطلاعاتی NCBI مقایسه و نتایج آن هم‌تراز (Blast) شد. بحث و نتیجه‏گیری: پژوهش حاضر نشان داد تنوع و تعداد سیانوباکتری‌های موجود در مناطق بیابانی به عوامل مختلفی ازجمله شرایط آب‌و‌هوایی، میزان رطوبت، مقدار تابش نور جذب‌شده بر سطح و دمای منطقه بستگی دارد. نتایج شناسایی مولکولی نتایج ریخت‌شناسی را تأیید کردند.

مقایسه روش‌های مولکولی و ریخت‌شناسی در مطالعه همزیستی قارچ‌های میکوریزی آربوسکولار گیاه زعفران (Crocus sativus L.)

حمزه پوریوسف؛ جعفر همت؛ محسن واعظ

دوره 7، شماره 26 ، تیر 1397، ، صفحه 1-10

https://doi.org/10.22108/bjm.2017.105754.1074

چکیده

مقدمه: شناسایی قارچ‌های همزیست میکوریزا آربوسکولار گیاه زعفران که در فصل‌های سال با تنش‌های محیطی فراوان اعم از اقلیمی و خاکی مواجه است، جهت کاربرد، افزایش رشد و تولید گیاه و مقاومت به عوامل بیماری‌زا ... بیشتر مقدمه: شناسایی قارچ‌های همزیست میکوریزا آربوسکولار گیاه زعفران که در فصل‌های سال با تنش‌های محیطی فراوان اعم از اقلیمی و خاکی مواجه است، جهت کاربرد، افزایش رشد و تولید گیاه و مقاومت به عوامل بیماری‌زا اهمیت ویژه‌ای دارد. مواد و روش‏‏ها: وجود اسپور قارچ‌های همزیست میکوریزا آربوسکولار در خاک ریزوسفر گیاه زعفران سه منطقه از مزارع شهرستان گناباد بررسی شد. همچنین کلنیزاسیون ریشه و تنوع قارچ‌های همزیست با زعفران طی دو سال متوالی 93-1392 مبتنی بر روش‌های ریخت‌شناسی و مولکولی انجام شد. علاوه بر این، کشت تله‌ای با استفاده از گیاه سورگوم و خاک سه منطقه کشت زعفران انجام شد. روش مولکولی با استفاده از PCR آشیانه‌ای حاصل از تکثیر ژن زیرواحد کوچک ژن rRNA قارچ‌های کلنیزه انجام شد. نتایج: طی بررسی اسپورهای موجود در اطراف خاک ریزوسفر، سه گونه اسکوتلوسپورا دیپورپورسنس، ریزوفاگوس اگرگاتوس و فونیلیفورمیس کالدونیوم شناسایی شدند. کلنیزه‌شدن میکوریزها در ریشه زعفران در فیلد طبیعی تنها در یک منطقه مشاهده شد؛ درحالی که کلنیزه‌شدن میکوریزها در گیاه تله سورگوم در خاک مناطق کشت زعفران بین 21 تا 24 درصد متغیر بود، در مزرعه زعفران بیش از 5/1 درصد مشاهده نشد. با وجود این، نتایج مولکولی همزیستی آنها را درتمام مناطق مطالعه‌شده زعفران و گیاه سورگوم نشان داد. این نتایج کلنیزاسیون زعفران را با ریزوفاگوس ایرانیکوس و ف. کالدونیم نشان دادند. پیش از این، به روش مولکولی تعیین همزیستی در زعفران گزارش نشده است. بحث و نتیجه‏گیری: تنوع گونه‌ای قارچ‌های همزیست در سورگوم و زعفران متفاوت بود و بر اساس مقایسه نتایج همزیستی مبتنی بر ریخت‌شناسی و مولکولی، به نظر می رسد که روش مولکولی ارائه‌شده شاخص مناسب‌تری برای وجود همزیستی است در حالی که روش‌های کلاسیک نتایج متفاوت و گاه گمراه‌کننده‌ای ارائه می‌کنند.

دوره 12 (1402)

دوره 11 (1401)

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

موضوعات = اکولوژی و سیستماتیک میکروارگانیسم ها

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده

چکیده