زیست شناسی میکروارگانیسم ها

1. جداسازی و شناسایی باکتری‌‌های تجزیه کننده نفت خام از مکان‌های آلوده به مواد نفتی در مسجد سلیمان

طیبه صابری؛ مهدی حسن شاهیان

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 25 مرداد 1399

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2020.122842.1299

چکیده

مقدمه: ا تجزیه زیستی یک فناوری مقرون به صرفه در جهت احیای مناطق آلوده به نفت می‌باشدمواد و روش‌ها: در این تحقیق جهت جداسازی باکتری‌های تجزیه کننده نفت خام، نمونه برداری از خاک و لجن نفتی از 7 منطقه آلوده ... بیشتر مقدمه: ا تجزیه زیستی یک فناوری مقرون به صرفه در جهت احیای مناطق آلوده به نفت می‌باشدمواد و روش‌ها: در این تحقیق جهت جداسازی باکتری‌های تجزیه کننده نفت خام، نمونه برداری از خاک و لجن نفتی از 7 منطقه آلوده نفتی در مسجدسلیمان انجام گرفت. برای تعیین فراوانی باکتری‌های هتروتروف و تجزیه کننده شمارش باکتری‌ها با روش سریال رقت و MPN انجام شد. 24 سویه با روش غنی سازی کشت در محیط بوشنل هاس براث حاوی نیم درصد نفت خام جداسازی شدند. سپس بر اساس رنگ آمیزی گرم و خصوصیات کلنی، تست گسترش نفت، هیدروفوبیسیته سطح سلولی و فعالیت امولسیون کنندگی سویه‌ها برای غربالگری اولیه مورد بررسی قرار گرفتند. در مرحله نهایی، غربالگری 10 سویه برتر با روش اسپکتروفتومتری و گراویمتری با غلظت نیم درصد نفت خام صورت گرفت. جهت تایید نهایی تجزیه انالیز کرماتوگرافی گازی (GC) روی سویه برتر انجام شد.نتایج: سویه‌های شناسایی شده متعلق به جنس های Rhodococcus jostii strain D3 وArthrobacter citreus strain E3 بودند. دو سویه برتر جهت بررسی اثر غلظت‌های مختلف نفت خام، اثر مواد مغذی، اثر زمان و کشت مخلوط مورد بررسی قرار گرفتند. بیشترین میزان گسترش نفت مربوط به سویه (F3) و بیشترین میزان امولسیون کنندگی مربوط به سویه (E3) بود. سویه D3 با 41 درصد تجزیه در غلظت 5/4 و سویه E3 با5/73 درصد تجزیه در غلظت 5/1 بهترین نتایج را در پاسخ به غلظت‌های مختلف نفت خام نشان دادند. انالیز گاز کرماتوگرافی تایید کرد که سویه D3 قابلیت حذف بیش از 95 درصد نفت در غلظت نیم درصد را دارد.بحث و نتیجه‌گیری: سویه‌های شناسایی شده پتانسیل بالایی را در حذف آلودگی‌های هیدروکربنی دارا بوده و در آینده می‌توان از آن‌ها در سطح میدانی در جهت کاهش و حذف آلودگی‌های نفتی در مناطق آلوده بهره گرفت.

مشاهده مقاله

2. ارزیابی تجزیه زیستی آفت‌کش دیازینون توسط باکتری‌های بومی جداشده از خاک‌های آلوده

آرزو علیپور؛ علی علیزاده؛ پژمان خدایگان

دوره 7، شماره 26 ، تابستان 1397، ، صفحه 73-86

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2017.101617.1025

چکیده

مقدمه: آفت‌کش‌ها، ابزار قدرتمندی هستند که برای تأمین نیاز‌های غذایی جمعیت در حال رشد جهان، توسعه و کاربرد فراوانی یافته‌اند. مصرف بی‌رویه، این مواد را به تهدیدی جدی برای محیط‌‌زیست تبدیل کرده است ... بیشتر مقدمه: آفت‌کش‌ها، ابزار قدرتمندی هستند که برای تأمین نیاز‌های غذایی جمعیت در حال رشد جهان، توسعه و کاربرد فراوانی یافته‌اند. مصرف بی‌رویه، این مواد را به تهدیدی جدی برای محیط‌‌زیست تبدیل کرده است دیازینون یکی از آفت‌کش‌های فسفره آلی است که برای کنترل طیف وسیعی از آفت‌ها استفاده می‌شود. بررسی‌های بسیاری درباره آثار سمیت این آفت‌کش در محیط‌زیست انجام شده است. استفاده از باکتری‌های تجزیه‌کننده یکی از راهکارهای حذف آفت‌کش‌ها از محیط‌های مختلف است. مواد و روش‏‏ها: برای غربال‌گری باکتری‌های بومی تجزیه‌کننده این آفت‌کش از خاک‌های مناطق مختلف صنعتی و کشاورزی نمونه‌برداری و جداسازی باکتری‌ها در محیط پایه معدنی انجام شد. پس از غنی‌سازی نمونه‌ها در محیط‌کشت پایه معدنی، 10 جدایه متفاوت از نظر شکل ظاهری با کشت روی محیط‌کشت جامد جداسازی، خالص‌سازی و در حد جنس شناسایی شدند. میزان غلظت آفت‌کش دیازینون در حضور این جدایه‌ها در محیط‌کشت با دستگاه کروماتوگرافی مایع با کارایی زیاد تعیین شد. نتایج: در پژوهش حاضر، جدایه‌ها‌ی S1 و S2 از بین 10 جدایه تجزیه‌کننده دیازینون، ، غلظت آفت‌کش دیازینون را از غلظت اولیه 50 میلی‌گرم بر لیتر طی 15 روز پس از کشت به‌ترتیب به 18/3 و 21/5 میلی‌گرم بر لیتر رساندند؛ جدایه‌های یادشده نسبت به سایر جدایه‌ها بیشترین توان کاهش غلظت را داشتند. با توجه به رشد باکتری‌ها در محیط‌های‌کشت‌ فقیر استنباط می‌شود این جدایه‌ها از آفت‌کش دیازینون به‌عنوان منبع انرژی برای رشد خود استفاده می‌کنند. بر اساس نتایج تکثیر و تعیین توالی 16SrDNA، جدایه‌های S1 و S2 به‌ترتیب بیشترین شباهت را به جنس‌های Paenibacillus و Pseudomonas داشتند. بحث و نتیجه‏گیری: نتایج پژوهش حاضر نشان دادند باکتری‌های تجزیه‌کننده آفت‌کش دیازینون در مناطق آلوده به این آفت‌کش و در فاضلاب‌های مناطق صنعتی وجود دارند. انتظار می‌رود با استفاده از این باکتری‌ها و روش‌های احیای زیستی، مشکلات زیست‌محیطی ناشی از آثار این آفت‌کش کاهش یابند و پس از بررسی در سطح میدانی و تعیین فرمولاسیون، از این جدایه‌ها برای پاکسازی زیستی استفاده شود.

3. سویه‌های جدید Bacillus cereus Wah1 وEnterobacter cloacae Wkh با پتانسیل بالا برای تولید سیدروفورها

محمود ملکی؛ صدیقه نوروزپور؛ الهام رضوان نژاد؛ شهریار شاکری

دوره 6، شماره 24 ، زمستان 1396، ، صفحه 1-11

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2017.21696

چکیده

مقدمه: سیدروفورها مولکول‌هایی با وزن مولکولی نسبتا پایین (500 تا 1000 دالتون) هستند که به عنوان لیگاندهای کلاته کننده آهن در شرایط کمبود آهن توسط بسیاری از میکروارگانیزم‌ها تولید می شوند. گیاهان می‌توانند ... بیشتر مقدمه: سیدروفورها مولکول‌هایی با وزن مولکولی نسبتا پایین (500 تا 1000 دالتون) هستند که به عنوان لیگاندهای کلاته کننده آهن در شرایط کمبود آهن توسط بسیاری از میکروارگانیزم‌ها تولید می شوند. گیاهان می‌توانند ترکیب آهن-سیدروفور را به منظور رفع نیازشان به آهن جذب کنند. هدف از پژوهش حاضر جداسازی و شناسایی باکتری‌های تولید کننده سیدروفور است. مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش از روش سنجش مایع CAS، برای جداسازی باکتری‌های محرک رشد گیاهی (PGPR) تولید کننده سیدروفوراستفاده شد. سپس، انواع مختلف سیدروفورهای تولید شده توسط بهترین سویه‌ها، با استفاده از روش سنجش O-CAS تعیین شدند. سرانجام دو سویه برتر تولید کننده سیدروفور با استفاده از آنالیز توالی ژن 16S rDNAشناسایی شدند. نتایج: نتایج نشان داد که 3/69 درصد از باکتری‌های جداسازی شده توانایی تولید سیدروفور را دارند. پایین‌ترین و بالاترین میزان سیدروفورها به ترتیب به سویه های Cke1 (58/17 درصد واحد سیدروفوری) و Wah1 (76/97 درصد واحد سیدروفوری) تعلق داشتند. بر پایه روش سنجش O-CAS این سویه‌ها سیدروفورهایی از نوع کاتکول و هیدروکسامات را تولید کردند. دو سویه Wah1 و Wkh با استفاده از آنالیز توالی‌یابی ژن 16S rDNA به ترتیب به عنوان Bacillus cereus و Enterobacter cloacae شناسایی شدند. بحث و نتیجه‏گیری: Wah1 و Wkh سیدروفورهای بیشتری (به صورت واحد سیدروفوری) نسبت به سایر سویه‌هایی که تا کنون با روش مشابهی مطالعه شده بودند، تولید کردند. بنابراین، آن‌ها سویه‌های با ارزشی برای مطالعه پتانسیل‌شان به عنوان کودهای زیستی و حفاظت گیاه در برابر پاتوژن‌های خاکزاد خواهند بود.

4. جداسازی و شناسایی باکتری‌های تجزیه کننده گازوئیل از خاک‌های آلوده به مواد نفتی در استان خوزستان

مهدی حسن شاهیان

دوره 5، شماره 19 ، پاییز 1395، ، صفحه 93-104

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.21003

چکیده

مقدمه: گازوئیل که یکی از محصولات عمدۀ نفت خام است، منبع عمدۀ آلودگی محیط زیست به شمار می‌رود و می‌تواند آثار خطرناک زیستی بر محیط اطراف بگذارد. یکی از روش‌های بازیابی این مناطق آلوده و واردکردن آن‌ها ... بیشتر مقدمه: گازوئیل که یکی از محصولات عمدۀ نفت خام است، منبع عمدۀ آلودگی محیط زیست به شمار می‌رود و می‌تواند آثار خطرناک زیستی بر محیط اطراف بگذارد. یکی از روش‌های بازیابی این مناطق آلوده و واردکردن آن‌ها به چرخۀ تولید محصول سالم، حذف آلاینده‌ها با روش‌های زیستی است که از این میان روش تجزیۀ زیستی با توجه به استفاده از توان طبیعی و پتانسیل‌های نهفتۀ طبیعت و هزینۀ کمتر بیشتر موردِتوجه بوده است. مواد و روش‌ها: در این پژوهش جهت جداسازی باکتری‌های تجزیه‌کنندۀ گازوئیل ابتدا نمونه‌برداری از مناطق آلوده در استان خوزستان به عمل آمد. باکتری‌های جداسازی‌شده با روش‌های بیوشیمیایی و مولکولی شناسایی شدند. صفاتی در این باکتری‌ها همچون آب‌گریزی سطح سلولی و فعالیت امولسیونه‌کنندگی بررسی شد. میزان حذف گازوئیل با روش کروماتوگرافی گازی و به‌صورت کیفی برای هر سویه مشخص شد. نتایج: در این پژوهش از بین 34 سویۀ تجزیه‌کنندۀ گازوئیل جداسازی شده، 10 سویه براساس حذف گازوئیل بیشتر انتخاب شدند. نتایج حاصل از شناسایی مولکولی نشان داد که این سویه‌ها به جنس‌های ‌Achromobacter، Enterobacter و Klebsiella تعلق داشتند. این باکتری‌ها در طی 10 روز بیش از نیمی از گازوئیل را حذف می‌کردند. بیشترین حذف گازوئیل مربوط به سویۀ Enterobacter cloacae strain L2 (72درصد) بود. بیشترین آب‌گریزی سطح سلولی مربوط به باکتری مربوط به سویۀstrain K2 Klebsiella oxytoca (76درصد) و بیشترین فعالیت امولسیون‌کنندگی مربوط به سویۀ strain B2 Achromobacter denitrificans (58درصد) بود. ‌ بحث و نتیجه‌گیری: نتایج این پژوهش ثابت کرد که باکتری‌های تجزیه‌کنندۀ گازوئیل در خاک‌های آلوده در ایران از تنوع مناسبی برخوردار هستند و پتانسیل استفاده در حذف آلودگی گازوئیلی از خاک را دارند.

5. بررسی تنوع باکتریایی غالب در فلور باکتری‌های هوازی و بی‌هوازی گل‌فشان‌های جنوب ‌شرقی دریای‌ خزر

عباس اخوان سپهی؛ قاسمعلی‌ محبعلی؛ بهنام راسخ؛ جلال فصل بهار؛ محمدعلی آرین؛ مهناز دیانسایی؛ ساره فراهانی؛ محمدفاضل فروغیان یزدی

دوره 5، شماره 19 ، پاییز 1395، ، صفحه 147-158

http://dx.doi.org/10.22108/bjm.2016.21008

چکیده

مقدمه: گِل‌فشان‌ها حاوی مواد خاکی عمق زمین مخلوط با آب هستند که به‌شکل خمیر شل و یا غلیظ به سطح زمین می‌رسند. گل‌فشان‌های حاشیۀ جنوب شرقی دریای خزر و شمال شرقی استان گلستان از مهم‌ترین گل‌فشان‌های ... بیشتر مقدمه: گِل‌فشان‌ها حاوی مواد خاکی عمق زمین مخلوط با آب هستند که به‌شکل خمیر شل و یا غلیظ به سطح زمین می‌رسند. گل‌فشان‌های حاشیۀ جنوب شرقی دریای خزر و شمال شرقی استان گلستان از مهم‌ترین گل‌فشان‌های ایران هستند و در این پژوهش بررسی شدند. مواد و روش‌ها: به‌منظور بررسی حضور باکتری‌ها در گل‌فشان، نمونه‌ها در محیط‌های هوازی و بی‌هوازی کشت داده شده‌اند. برای کشت انواع هوازی از محیط‌های رایج برای باکتری‌ها استفاده شد و نمونه‌های بی‌هوازی در محیط تیوگلیکولات براث در جار بی‌هوازی کشت داده شدند. علاوه بر بررسی صفت نمک‌دوستی، آنزیم‌های هیدرولازی و خصوصیات فیزیولوژیک سویه‌ها ارزیابی شد. نتایج: طبق بررسی‌های انجام‌شده از بین 22سویۀ منتخب، 17سویۀ هوازی و 5 سویۀ بی‌هوازی اختیاری بودند. از بین 17 سویۀ هوازی، 11 سویۀ با موفقیت توالی‌یابی شدند. 5 نمونۀ بی‌هوازی اختیاری توالی‌یابی شدند و درخت فیلوژنتیکی آن‌ها رسم شد. اکثر نمونه‌ها باسیل‌های گرم‌مثبتی بودند که توانایی گسترده‌ای در تولید آنزیم‌های هیدرولازی داشتند. با توجه به رشد تمامی جدایه‌ها در محیط حاوی ۰تا15درصد نمک می‌توان آن‌ها را مقاوم به نمک محسوب کرد. ‌ بحث و نتیجه‌گیری: براساس نتایج این پژوهش می‌توان یک ارزیابی از تنوع میکروبی گل‌فشان‌های بررسی‌شده به ‌دست داد. محیط گل‌فشان مانند محیط‌های با شرایط سخت است که امکان کشت تمامی میکروارگانیسم‌های آن مقدور نیست؛ به‌خصوص درمورد نمونه‌های بی‌هوازی اجباری که به شرایط بسیار خاصی نیاز دارند. با توجه به وجود آنزیم‌های هیدرولازی در سویه‌های جداشده از این گل‌فشان‌ها آن‌ها دارای ظرفیت استفاده در زیست‌فناوری هستند.

6. بررسی پتانسیل حذف میکروبی خاک‏های آلوده به ‏گازوییل در شهر همدان

فریبا محسن زاده؛ نسترن احمدی مسعود

دوره 1، شماره 2 ، تابستان 1391، ، صفحه 77-86

چکیده

مقدمه: آلودگی‌های نفتی از مسائل مهم زیست محیطی هستند. ‏گازوییل از متداول‏‏ترین آلاینده‏های نفتی است. زیست پالایی، فنآوری جدید پاک‏سازی‏ خاک است. برخی از میکروارگانیسم‌ها قابلیت زیست پالایی ... بیشتر مقدمه: آلودگی‌های نفتی از مسائل مهم زیست محیطی هستند. ‏گازوییل از متداول‏‏ترین آلاینده‏های نفتی است. زیست پالایی، فنآوری جدید پاک‏سازی‏ خاک است. برخی از میکروارگانیسم‌ها قابلیت زیست پالایی ‏گازوییل را دارند. این پژوهش، با هدف دستیابی به میکروارگانیسم‌های بومی، با قدرت تجزیه زیستی ‏گازوییل در شرایط آب وهوایی شهر همدان انجام شد. مواد و روش‏‏ها: نمونه‏های خاک آلوده به ‏گازوییل از 10 منطقه شهر همدان جمع آوری و باکتری‏های آن جداسازی و براساس ویژگی‏های ریخت‏شناسی و آزمایش‌های بیوشیمیایی دسته بندی شد. توانایی هر دسته در مصرف ‏گازوییل در محیط کشت نمکی حداقل و غلظت‌های مختلف آلاینده (1/0، 5/0، 1، 3 درصد‏) از طریق کدورت سنجی در طول موج 600 نانومتر بررسی شد. نتایج از طریق آزمون آماری تحلیل واریانس چندعاملی با هم مقایسه شد. نتایج: در این تحقیق، 10 سویه مختلف باکتریایی‏ از خاک‌های آلوده به ‏گازوییل شهر همدان یافت شد. نتایج کدورت سنجی نشان داد که اثر عامل زمان، غلظت آلاینده، نوع باکتری و اثر تعاملی آن‏ها‏در تمامی نمونه‏های تیمارشده معنی دار می‌باشد. در غلظت خاص آلاینده، با افزایش زمان ماند، کدورت نمونه‏هابیش‏تر شده که این میزان افزایش از غلظت 1/0 تا 1 درصد چشمگیرتر از غلظت 1 تا 3 درصد آلاینده است.افزایش غلظت از 3 درصد به بالا موجب کاهش کدورت در برخی نمونه‏ها شده که می‏تواند کاهش راندمان حذف میکروبی آلاینده در این غلظت را به دنبال داشته باشد. سه سوش جدا شده نسبت به سایر سوش‏ها در کلیه غلظت‏ها و زمان‏های ماند کدورت بیشتری ایجاد کردند. بحث و نتیجه‏گیری: در بین سه سوش جداشده، بیش‏ترین کدورت ایجاد شده به باکتری شماره 3 مربوط بود که پس از شناسایی، به‏عنوان سودوموناس آیروژنز، گزارش شد. این باکتری به‏عنوان بهترین تجزیه کننده ‏گازوییل از خاک‌های آلوده در شرایط آب و هوایی شهر همدان انتخاب شد.

زیست شناسی میکروارگانیسم ها

مقالات آماده انتشار

شماره جاری

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

کلیدواژه‌ها = باکتری
تعداد مقالات: 6

1. جداسازی و شناسایی باکتری‌‌های تجزیه کننده نفت خام از مکان‌های آلوده به مواد نفتی در مسجد سلیمان

چکیده

2. ارزیابی تجزیه زیستی آفت‌کش دیازینون توسط باکتری‌های بومی جداشده از خاک‌های آلوده

چکیده

3. سویه‌های جدید Bacillus cereus Wah1 وEnterobacter cloacae Wkh با پتانسیل بالا برای تولید سیدروفورها

چکیده

4. جداسازی و شناسایی باکتری‌های تجزیه کننده گازوئیل از خاک‌های آلوده به مواد نفتی در استان خوزستان

چکیده

5. بررسی تنوع باکتریایی غالب در فلور باکتری‌های هوازی و بی‌هوازی گل‌فشان‌های جنوب ‌شرقی دریای‌ خزر

چکیده

6. بررسی پتانسیل حذف میکروبی خاک‏های آلوده به ‏گازوییل در شهر همدان

چکیده

مقالات آماده انتشار

شماره جاری

دوره 10 (1400)

دوره 9 (1399)

دوره 8 (1398)

دوره 7 (1397)

دوره 6 (1396)

دوره 5 (1395)

دوره 4 (1394)

دوره 3 (1393)

دوره 2 (1392)

دوره 1 (1391)

کلیدواژه‌ها = باکتری تعداد مقالات: 6

1. جداسازی و شناسایی باکتری‌‌های تجزیه کننده نفت خام از مکان‌های آلوده به مواد نفتی در مسجد سلیمان

چکیده

2. ارزیابی تجزیه زیستی آفت‌کش دیازینون توسط باکتری‌های بومی جداشده از خاک‌های آلوده

چکیده

3. سویه‌های جدید Bacillus cereus Wah1 وEnterobacter cloacae Wkh با پتانسیل بالا برای تولید سیدروفورها

چکیده

4. جداسازی و شناسایی باکتری‌های تجزیه کننده گازوئیل از خاک‌های آلوده به مواد نفتی در استان خوزستان

چکیده

5. بررسی تنوع باکتریایی غالب در فلور باکتری‌های هوازی و بی‌هوازی گل‌فشان‌های جنوب ‌شرقی دریای‌ خزر

چکیده

6. بررسی پتانسیل حذف میکروبی خاک‏های آلوده به ‏گازوییل در شهر همدان

چکیده

کلیدواژه‌ها = باکتری
تعداد مقالات: 6